咽痛可由炎症、創傷、過敏、腫瘤及全身性疾病等引起，亦可由外科及氣管插管引起。非病原因素包括張口呼吸引起的黏膜乾燥、呼吸道細菌感染、飲酒、吸菸及內科病因等引起的區域性刺激。

(一)粒細胞減少症

在這種疾病，咽痛通常伴隨有其他炎症引起的症狀和體徵，如發熱、寒戰、頭痛。典型表現還有進行性的乏力及虛弱。其他臨床表現還包括噁心、嘔吐、厭食及傾向。邊緣毛糙並伴有灰色或黑色被膜的潰瘍經常會出現在齒齦、軟顎及肛周。

(二)過敏性

本病可以季節性發作，發生咽痛及鼻塞和清亮鼻涕、後鼻滴涕、陣發性噴嚏、嗅覺減低，前面或顥側頭痛，眼、鼻、咽發癢。體格檢查發現鼻甲黏膜蒼白、結膜充血、眼瞼充血。

(三)禽流感

咽痛、肌肉痠痛、咳嗽和發熱是禽流感的早期症狀。致病菌家禽甲型H5N1可導致肺炎及急性呼吸窘迫和其他一些威脅生命的併發症。最近一次H5N1引起的家禽流感暴發是在亞洲，引起了與家禽及汙染物接觸的人群的發病及死亡。研究正在向有效的抗病毒物及疫苗方向發展。

(四)急性支氣管炎

在此疾病，可發生輕微咽痛、肌肉痠痛及背痛。聽診可聞及幹囉音、溼咿音，偶可聞及尖銳的肺泡音。

(五)慢性疲勞綜合徵

這種特殊的臨床綜合徵是以進行性的失功能的疲勞為特徵。輔助檢查可見咽痛、肌痛及認知障礙。

(六)普通感冒

咽痛可伴隨有咳嗽、噴嚏、鼻塞、流涕、乏力、頭痛、肌痛及關節痛。

(七)接觸潰瘍

多發生於工作壓力大的人群。潰瘍出現在後科卡爾線，可引起咽痛，可因發音而加劇，可伴有放射性耳痛及咯血。典型的症狀可有慢性咳嗽或酸反射。

(八)異物

顎扁桃體、舌扁桃體及梨狀隱窩部位異物可引起區域性疼痛。只要黏膜刺激存在，這種疼痛可能會在異物去除後持續存在。

(九)胃食管反流性疾病

此種疾病時。反流物可反流人下嚥部並刺激咽喉，引起慢性咽痛及聲音嘶啞。杓狀軟骨可出現紅、腫，同時出現咽部的腫物感覺。

(十)舌咽神經

舌咽神經痛可由特殊的咽部運動引發.比如打呵欠、吞嚥等。觸發後引起～側扁桃體隱窩內的刀割樣疼痛，可向外耳放射。

(十一)單純皰疹病毒

咽痛可以由黏膜損傷引起，特別是舌、齒齦及面部。在前驅期後，發展成紅色皰疹，最後破裂形成潰瘍，引起疼痛，最後形成微黃色的痂。在大多數的感染中，皰疹通常伴發頜下淋巴結疾病、口臭，唾液分泌增多、厭食及高達40。6℃的高熱。

(十二)流感

流感患者通常會出現咽痛、高熱、寒戰、頭痛、乏力、不適、肌痛、咳嗽、聲音嘶啞及流涕。

(十三)喉癌

外生的喉癌，重要的症狀是飲柑橘汁及熱飲時出現的疼痛、咽部燒灼感或咽部的異物感。內生的喉癌，伴發>3周的聲音嘶啞。晚期轉移的症狀及體徵包括吞嚥困難、呼吸困難、咳嗽、頸部淋巴結腫大及外耳放射痛。

(十四)急性喉炎

急性喉炎可引發咽痛，但其主要症狀是中至重度的聲音嘶啞或短暫性聲音缺失。其他的症狀包括不適、低熱、吞嚥困難、乾咳及頸部淋巴結腫大伴觸痛。

(十五)猴痘

(十六)細菌感染引起的單核細胞增多症

咽痛是其經典的3個症狀之一，其餘兩個表現為頸部淋巴結腫大及38～38.9℃的波動熱。發病的患者可同時出現肝脾腫大。

(十七)急性壞死性潰瘍性牙齦炎

本病又叫戰壕口腔牙齦炎，以突發的咽痛及牙齦潰瘍為首發症狀。可以有白色滲出物覆蓋牙齦及舌咽扁桃體。相關的症狀及體徵包括口腔內感覺臭味的味覺異常、口臭、頸部淋巴結腫大、頭痛、不適及發熱。

(十八)扁桃體膿腫

系細菌性舌炎的併發症，這種膿腫可引起劇烈的咽痛，可向外耳放射。伴隨症狀可有吞嚥困難、流涎、發音困難、口臭、發熱、寒戰、不適及噁心。患者的頭部經常向患側傾斜，進一步體格檢查可見顎垂傾斜、牙關緊閉、頸部淋巴結軟性增大。

(十九)咽部燒傷

咽後部的I度或Ⅱ度燒傷可引起咽痛及吞嚥困難。

(二十)咽炎

細菌、黴菌、病毒引起的咽炎可引起咽痛及區域性的紅腫。細菌性咽炎可引起一側咽痛，伴隨症狀及體徵包括吞嚥困難、發熱、不適、頭痛、腹痛、肌痛及關節痛。體格檢查可見舌及扁桃體窩的分泌物、顎垂水腫、軟顎充血及頸部淋巴結腫大。鵝口瘡也叫真菌性口炎，可引起彌散性咽痛，通常被描述為咽部燒灼感，伴發咽部紅、腫，咽部、扁桃體、顎垂、舌部、口腔黏膜的白斑.白斑剝脫後可見基底。病毒性咽炎可產生彌散性咽痛、不適、發熱及口咽後壁的輕微紅、腫。扁桃體腫大及頸前淋巴結腫大可以伴隨出現。

(二十一)咽上領間隙膿腫

咽上頜間晾膿腫是未處理的咽部及扁挑體感染或拔牙的併發症。咽上頜間隙膿腫可引起中度咽痛。進一步體格檢查可發現咽中部紅腫伴發患側頜角及頸部紅腫，其他的症狀和體徵包括髮熱、吞嚥困難、牙關緊閉，亦可能伴有呼吸窘迫及毒血癥。

(二十二)急性鼻竇炎

在此情況下可引發咽痛、鼻化膿、鼻後分泌物導致口臭。其他反應包括頭痛、不適、咳嗽、發熱及面部腫痛及鼻充血。

(二十三)舌癌

患有舌癌的患者可表現為區域性咽痛，腫瘤周圍可出現潰瘍。疼痛可放射向耳部，同時出現吞嚥困難。

(二十四)扁桃體癌

咽痛可出現於扁桃體癌，然而，腫瘤經常在症狀出現之前就已經明顯，疼痛可向外耳放射，經常伴隨扁桃體或舌根的淺表潰瘍。

(二十五)扁桃體炎

中重度的咽部疼痛經常是急性扁桃體炎的首發症狀。疼痛可向外耳放射，伴隨吞嚥困難及頭痛，相關的症狀還可出現乏力、發熱、寒戰、口臭、肌痛、關節痛及頸部淋巴結腫大。進一步體格檢查可見扁桃體紅、腫及膿性分泌物。慢性扁桃體受可引起中度咽痛、不適及頸部淋巴結腫大，扁桃體光滑、發紅，可伴腫大，可伴化膿小皰脫落。口臭及口內味覺異常可比較常見。舌扁桃體炎時可發生舌骨之上一側或雙側咽痛。舌扁桃體出現紅、腫，被覆分泌物。其他的症狀還可以有聲音低沉、眷咽困難及患側的頸部淋巴結腫大。

(二十六)顎垂炎

此類炎症可能引起咽痛或咽部異物感。顎垂炎呈紅、腫，但是，在過敏性顎垂炎表現為蒼白。

(二十七)其他病因

氣管插管及區域性，比如：扁桃體切除術、增殖腺切除術均可以引起咽痛。