腳男們在虛空中擊敗了基爾加丹後，蛋總將阿古斯拉回了艾澤拉斯星軌附近，並且開始集結部隊準備反攻阿古斯，而先知維綸此前早已在準備修復維迪卡爾號飛船。
來到埃索達後發現伊利丹、維綸、聖光恐懼魔王等人都已集結完畢，在各位指揮官們都準備好後，正式開始前往阿古斯，到達阿古斯後，維綸痛心於自己曾經的家園竟然變成了這樣。
還沒等感慨結束，就看到另外一艘聖光飛船澤尼達爾號被軍團的大炮轟下了，並且維迪卡爾也受到了攻擊，不得已只好迫降，然後在附近救治了幾個傷員，一路前進，遇到了殘存的艾瑞達人，其中就有維綸的老熟人。
正在劍拔弩張時，一個聖光騎士衝了出來攔住雙方，原來他就是當年穿越黑門的幾位英雄之一圖拉楊。在解決了當地的惡魔後，我們也迎來了圖拉楊的夫人，風行者三姐妹中的大姐大，奧蕾莉亞。
當眾人齊集在澤尼達爾號後，當初我們撿到的聖光之心被圖拉楊送去還給了澤拉，澤拉復原後二話不說就要用聖光洗練伊利丹，伊利丹表示我的命運我自己做主！然後一個眼稜滅了澤拉。
然後眾位指揮官要在維綸的指引下收集齊當初三巨頭統治阿古斯時候創造的一件寶物，執政團之冠來強化維迪卡爾號的力量。
這個寶物分為三個部分，維綸、基爾加丹和阿克蒙德分別保管一份，但是由於這個寶物需要集齊才能發揮作用，而基爾加丹和阿克蒙德都不重視這份力量，所以即便二人都已被玩家消滅，還是能在阿古斯上找到它們。
當一切就緒後，使用執政團之冠強化後的維迪卡爾號轟開了安託魯斯，燃燒王座的大門。
各位指揮官們一路上消滅了燃燒軍團的眾多指揮官（包括鎮守大門的加洛西滅世者和薩格拉斯的惡犬；位於軍團之眼的安託蘭統帥議會；守護軍團傳送門的哈薩貝爾；位於安託魯斯底層的獵魂者和金加洛斯）、關閉了通往其他世界的傳送門後，眾人發現原來泰坦們的靈魂並沒有被消滅。
而是被薩格拉斯囚禁起來，被位於燃燒王座的破壞魔女巫會所折磨著，唯有生命賦誓者艾歐娜的靈魂逃脫了並躲藏了起來，在眾位指揮官的幫助下，艾歐娜的精華未被軍團腐蝕，但是在面對破壞魔女巫會時，藉助眾泰坦的力量還是讓玩家陷入了苦戰。
如果讓她們腐蝕成功，薩格拉斯將組建全新的黑暗萬神殿，以此來對付最後的一位泰坦——艾澤拉斯。最終消滅了破壞魔女巫會後，萬神殿泰坦的靈魂被解放了，但要復活眾位泰坦的肉身還必須要深入阿古斯深處，從那裡前往萬神之座。
眾人深入到了阿古斯深處後卻發現薩格拉斯的副官阿格拉瑪已被複活成為邪能泰坦，並鎮守著阿古斯的核心和前往萬神之座的傳送門。推倒阿格拉瑪後，在麥格尼銅須的指引下眾人來到了萬神之座，並且幫助眾位泰坦恢復了肉身。然而也就在這時，阿古斯星球的星魂寂滅者已經覺醒，強大的邪能束縛了萬神殿的力量。
縱然萬神之父阿曼蘇爾和眾位泰坦將自己的力量賦予凡人，泰坦之力也非凡人所能抵抗。所有人都被阿古斯消滅了，但是在艾歐娜的幫助下，閃耀著生命之火的腳男（主角光環啊…）再次站了起來，艱苦的戰鬥過後，寂滅者阿古斯被擊敗了。
至此，燃燒軍團的核心幹部和主要戰力都被擊敗了，薩格拉斯孤注一擲，化為一陣巨大的邪能風暴向艾澤拉斯襲去。就在此時，萬神殿的泰坦們合力將薩格拉斯拉回萬神之座。
薩格拉斯最後一搏，將他的巨劍深深插入艾澤拉斯地表留下了一個巨大的傷口，然後就被徹底帶回了虛空，在那裡等待他的是他曾無情消滅的兄弟姐妹和一位等待了萬年的惡魔獵手。維綸則帶領眾人踏上了返航的道路，在艾澤拉斯，還有更多的冒險等待著各位玩家。
阿古斯的故事：
英雄們在薩格拉斯之墓擊敗基爾加丹後，伊利丹使用薩格里特鑰石強行將阿古斯傳送到了艾澤拉斯的星球軌道上，還處於阿古斯的惡魔們的軍事聯絡、作戰動向和援兵通道一時間陷入混亂，無法及時向這顆星球折躍大規模的援軍。於是，艾澤拉斯的英雄們決定趁此機會，揮師直擊阿古斯。
在那裡英雄們終於見到了失蹤千年的圖拉揚夫婦，以及流傳已久的聖光軍團。然而，這顆破碎星球上還有著數不清的傳送門和源源不斷的陸軍部隊，聖光軍團即使得到了來自艾澤拉斯的全力協助，每次勝利仍要付出巨大的代價。英雄們就一面推進攻向燃燒王座的戰線，一面淨化來自宇宙各個世界的軍團威脅。
最終，艾澤拉斯的英雄們聯合聖光軍團攻入安託魯斯燃燒王座，摧毀了燃燒軍團的中樞指揮系統。他們在泰坦的協助下淨化了阿古斯星魂，並將薩格拉斯拖回萬神殿，永遠地囚禁起來。這支毀滅萬物的惡魔軍團終於被徹底擊敗，燃燒的遠征到此結束。
擴充套件資料
7.3的後續劇情：
在對抗燃燒軍團的最終時刻，軍團大佬薩格拉斯一劍刺穿了艾澤拉斯世界的軀殼，世界之血從希利蘇斯巨大的傷口噴湧而出，凝結成一種神器的結晶礦石-艾澤裡特。
當全世界還未明白這意味著什麼的時候，部落已經搶先行動。龐大的地精部隊趕往希利蘇斯創傷之痕，開始瘋狂的開採這種神秘的結晶。
聯盟軍情七處發現部落的行蹤後，以保護艾澤拉斯之名也向希利蘇斯派遣兵力，隨之而來的第三方組織如塞納里奧議會和大地之環等，開始在治癒這可怕的傷痕。而聯盟部落雙方劍拔弩張，新的戰爭一觸即發。
部落正在動員兵力和集結部隊，種種跡象表明，部落將用優勢兵力打擊聯盟在希利蘇斯的部署。為了增強抵禦部落的攻擊，暗夜精靈的艦隊出發前往增員希利蘇斯，因為羽月要塞有少量駐軍且離希利蘇斯最近，但仍然還需要從黑海岸調遣更多的艦隊。
然而萬萬沒想到這正中希爾瓦娜斯的下懷，大量的部落兵力並沒有南下至希利蘇斯，而是突然揮師北上，直擊暗夜精靈因調遣艦隊而空虛的後方——黑海岸！
願望妖王之王早已謀劃了一切，聲東擊西，調虎離山之計，一舉拿下黑海岸，佔領洛達內爾，將泰達希爾納入部落的火力範圍之內。
一旦精靈主城都被部落脅迫，聯盟將不可避免的陷入被動，不得不向部落妥協。試圖收復洛丹倫的吉爾尼斯派與家園被要挾的達納蘇斯人必然分裂，部落將迎來長久的優勢與和平，即使大王薩魯法爾也深信這一點。
果不其然，瑪法里奧領導下的精靈因兵力懸殊而導致節節敗退，黑海岸失守，洛達內爾淪陷。然而這場戰爭中的種種端倪讓薩魯法爾十分疑惑，一場以打促談，以戰求和的行動似乎正變得一發不可收拾。出於內心的榮耀與掙扎，他在偷襲並重傷了瑪法里奧後選擇放過對方的性命。
在兵臨城下之時，希爾瓦娜斯突然發令，焚燬泰達希爾！無數投石車向古樹之王丟擲火藥桶，將這棵宏偉的世界之樹化為火海。薩魯法爾這才發現，女妖之王的計劃根本不是事先所說的那樣，恍然大悟自己被利用了。
腳男們在虛空中擊敗了基爾加丹後，蛋總將阿古斯拉回了艾澤拉斯星軌附近，並且開始集結部隊準備反攻阿古斯，而先知維綸此前早已在準備修復維迪卡爾號飛船。
來到埃索達後發現伊利丹、維綸、聖光恐懼魔王等人都已集結完畢，在各位指揮官們都準備好後，正式開始前往阿古斯，到達阿古斯後，維綸痛心於自己曾經的家園竟然變成了這樣。
還沒等感慨結束，就看到另外一艘聖光飛船澤尼達爾號被軍團的大炮轟下了，並且維迪卡爾也受到了攻擊，不得已只好迫降，然後在附近救治了幾個傷員，一路前進，遇到了殘存的艾瑞達人，其中就有維綸的老熟人。
正在劍拔弩張時，一個聖光騎士衝了出來攔住雙方，原來他就是當年穿越黑門的幾位英雄之一圖拉楊。在解決了當地的惡魔後，我們也迎來了圖拉楊的夫人，風行者三姐妹中的大姐大，奧蕾莉亞。
當眾人齊集在澤尼達爾號後，當初我們撿到的聖光之心被圖拉楊送去還給了澤拉，澤拉復原後二話不說就要用聖光洗練伊利丹，伊利丹表示我的命運我自己做主！然後一個眼稜滅了澤拉。
然後眾位指揮官要在維綸的指引下收集齊當初三巨頭統治阿古斯時候創造的一件寶物，執政團之冠來強化維迪卡爾號的力量。
這個寶物分為三個部分，維綸、基爾加丹和阿克蒙德分別保管一份，但是由於這個寶物需要集齊才能發揮作用，而基爾加丹和阿克蒙德都不重視這份力量，所以即便二人都已被玩家消滅，還是能在阿古斯上找到它們。
當一切就緒後，使用執政團之冠強化後的維迪卡爾號轟開了安託魯斯，燃燒王座的大門。
各位指揮官們一路上消滅了燃燒軍團的眾多指揮官（包括鎮守大門的加洛西滅世者和薩格拉斯的惡犬；位於軍團之眼的安託蘭統帥議會；守護軍團傳送門的哈薩貝爾；位於安託魯斯底層的獵魂者和金加洛斯）、關閉了通往其他世界的傳送門後，眾人發現原來泰坦們的靈魂並沒有被消滅。
而是被薩格拉斯囚禁起來，被位於燃燒王座的破壞魔女巫會所折磨著，唯有生命賦誓者艾歐娜的靈魂逃脫了並躲藏了起來，在眾位指揮官的幫助下，艾歐娜的精華未被軍團腐蝕，但是在面對破壞魔女巫會時，藉助眾泰坦的力量還是讓玩家陷入了苦戰。
如果讓她們腐蝕成功，薩格拉斯將組建全新的黑暗萬神殿，以此來對付最後的一位泰坦——艾澤拉斯。最終消滅了破壞魔女巫會後，萬神殿泰坦的靈魂被解放了，但要復活眾位泰坦的肉身還必須要深入阿古斯深處，從那裡前往萬神之座。
眾人深入到了阿古斯深處後卻發現薩格拉斯的副官阿格拉瑪已被複活成為邪能泰坦，並鎮守著阿古斯的核心和前往萬神之座的傳送門。推倒阿格拉瑪後，在麥格尼銅須的指引下眾人來到了萬神之座，並且幫助眾位泰坦恢復了肉身。然而也就在這時，阿古斯星球的星魂寂滅者已經覺醒，強大的邪能束縛了萬神殿的力量。
縱然萬神之父阿曼蘇爾和眾位泰坦將自己的力量賦予凡人，泰坦之力也非凡人所能抵抗。所有人都被阿古斯消滅了，但是在艾歐娜的幫助下，閃耀著生命之火的腳男（主角光環啊…）再次站了起來，艱苦的戰鬥過後，寂滅者阿古斯被擊敗了。
至此，燃燒軍團的核心幹部和主要戰力都被擊敗了，薩格拉斯孤注一擲，化為一陣巨大的邪能風暴向艾澤拉斯襲去。就在此時，萬神殿的泰坦們合力將薩格拉斯拉回萬神之座。
薩格拉斯最後一搏，將他的巨劍深深插入艾澤拉斯地表留下了一個巨大的傷口，然後就被徹底帶回了虛空，在那裡等待他的是他曾無情消滅的兄弟姐妹和一位等待了萬年的惡魔獵手。維綸則帶領眾人踏上了返航的道路，在艾澤拉斯，還有更多的冒險等待著各位玩家。
阿古斯的故事：
英雄們在薩格拉斯之墓擊敗基爾加丹後，伊利丹使用薩格里特鑰石強行將阿古斯傳送到了艾澤拉斯的星球軌道上，還處於阿古斯的惡魔們的軍事聯絡、作戰動向和援兵通道一時間陷入混亂，無法及時向這顆星球折躍大規模的援軍。於是，艾澤拉斯的英雄們決定趁此機會，揮師直擊阿古斯。
在那裡英雄們終於見到了失蹤千年的圖拉揚夫婦，以及流傳已久的聖光軍團。然而，這顆破碎星球上還有著數不清的傳送門和源源不斷的陸軍部隊，聖光軍團即使得到了來自艾澤拉斯的全力協助，每次勝利仍要付出巨大的代價。英雄們就一面推進攻向燃燒王座的戰線，一面淨化來自宇宙各個世界的軍團威脅。
最終，艾澤拉斯的英雄們聯合聖光軍團攻入安託魯斯燃燒王座，摧毀了燃燒軍團的中樞指揮系統。他們在泰坦的協助下淨化了阿古斯星魂，並將薩格拉斯拖回萬神殿，永遠地囚禁起來。這支毀滅萬物的惡魔軍團終於被徹底擊敗，燃燒的遠征到此結束。
擴充套件資料
7.3的後續劇情：
在對抗燃燒軍團的最終時刻，軍團大佬薩格拉斯一劍刺穿了艾澤拉斯世界的軀殼，世界之血從希利蘇斯巨大的傷口噴湧而出，凝結成一種神器的結晶礦石-艾澤裡特。
當全世界還未明白這意味著什麼的時候，部落已經搶先行動。龐大的地精部隊趕往希利蘇斯創傷之痕，開始瘋狂的開採這種神秘的結晶。
聯盟軍情七處發現部落的行蹤後，以保護艾澤拉斯之名也向希利蘇斯派遣兵力，隨之而來的第三方組織如塞納里奧議會和大地之環等，開始在治癒這可怕的傷痕。而聯盟部落雙方劍拔弩張，新的戰爭一觸即發。
部落正在動員兵力和集結部隊，種種跡象表明，部落將用優勢兵力打擊聯盟在希利蘇斯的部署。為了增強抵禦部落的攻擊，暗夜精靈的艦隊出發前往增員希利蘇斯，因為羽月要塞有少量駐軍且離希利蘇斯最近，但仍然還需要從黑海岸調遣更多的艦隊。
然而萬萬沒想到這正中希爾瓦娜斯的下懷，大量的部落兵力並沒有南下至希利蘇斯，而是突然揮師北上，直擊暗夜精靈因調遣艦隊而空虛的後方——黑海岸！
願望妖王之王早已謀劃了一切，聲東擊西，調虎離山之計，一舉拿下黑海岸，佔領洛達內爾，將泰達希爾納入部落的火力範圍之內。
一旦精靈主城都被部落脅迫，聯盟將不可避免的陷入被動，不得不向部落妥協。試圖收復洛丹倫的吉爾尼斯派與家園被要挾的達納蘇斯人必然分裂，部落將迎來長久的優勢與和平，即使大王薩魯法爾也深信這一點。
果不其然，瑪法里奧領導下的精靈因兵力懸殊而導致節節敗退，黑海岸失守，洛達內爾淪陷。然而這場戰爭中的種種端倪讓薩魯法爾十分疑惑，一場以打促談，以戰求和的行動似乎正變得一發不可收拾。出於內心的榮耀與掙扎，他在偷襲並重傷了瑪法里奧後選擇放過對方的性命。
在兵臨城下之時，希爾瓦娜斯突然發令，焚燬泰達希爾！無數投石車向古樹之王丟擲火藥桶，將這棵宏偉的世界之樹化為火海。薩魯法爾這才發現，女妖之王的計劃根本不是事先所說的那樣，恍然大悟自己被利用了。