醫學界始終認為服用氨基葡萄糖沒有危險性。 然而，最近的拉瓦爾大學(Université Laval)的研究表明，服用氨基葡萄糖的人, 往往使用超出推薦的劑量。 研究人員初步研究中發現， 超過推薦劑量的氨基葡萄糖，可能會損壞胰腺細胞，可能會增加患糖尿病的風險。因此氨糖並非含量越高越好，一般建議每日補充氨糖800-1500毫克即可，儘量不要超過1500毫克，絕對不能超過2000毫克。　　另外，一般的低檔氨糖當中常有鈉鹽含量過多、或是新增防腐劑的問題。儘管服用氨基葡萄糖沒有危險性，但這些附加的成份有時會對高年齡的消費者帶來一些副作用。　　對蝦蟹等甲殼類食物過敏的人士擔心氨基葡萄糖會造成過敏反應，但是由於實際上蝦蟹的過敏源來自其肉類中的蛋白質，所以來自甲殼本身的氨基葡萄糖不會造成此類人士過敏。一些人服用氨糖後產生腸胃不適等過敏反應症狀，可能與鹽酸中的氯離子或者新增的輔料等有關。和氨糖沒有直接關係。　　此外，也有從真菌或穀物發酵制的氨基葡萄糖供擔心過敏的人選擇。有人認為過多的攝取氨基葡萄糖可能會影響體內正常的氨基己糖生物合成，但是目前的研究還沒有表明存在這樣的影響。美國國家衛生研究院於2003年還對補充氨基葡萄糖對特定肥胖人群的影響進行了研究，因為此類人群可能在胰島素抵抗方面對氨基葡萄糖較為敏感。　　病例：口述使用氨糖半年後得了直腸癌和糖尿病病例一名，口述使用氨糖兩個月後得了腦梗病例一名