以大腸桿菌為代表,除了大腸桿菌外，變形桿菌、痢疾桿菌、肺炎桿菌、布氏桿菌、產氣夾膜桿菌、流感(嗜血)桿菌、副流感(嗜血)桿菌、卡他(摩拉)菌、不動桿菌屬、耶爾森菌屬、嗜肺軍團菌、百日咳桿菌、副百日咳桿菌、志賀菌屬、巴斯德菌屬、霍亂弧菌、副溶血性桿菌、類志賀吡鄰單胞菌等也是革蘭氏陰性菌. 它們產生內毒素，靠內毒素使人致病革蘭氏陰性菌則對青黴素不敏感,可以選擇氟喹諾酮類藥物如諾氟沙星，左氧氟沙星等，也可以選擇大環內酯類比如克拉黴素、羅紅黴素等。

革蘭陽性菌、革蘭陰性菌是根據對細菌進行革蘭氏染色的結果來區分的，如果將細菌作革蘭氏染色，凡染後菌體呈紫色的，稱“革蘭氏陽性菌”， 菌體呈伊紅色，稱“革蘭氏陰性菌” 。無論陽性菌還是陰性菌都有桿菌和球菌。葡萄球菌、大腸桿菌、綠膿桿菌是臨床最為常見的病原菌，葡萄球菌屬於革蘭陽性球菌，大腸桿菌屬於革蘭陰性菌中的腸桿菌科，除大腸桿菌以外，臨床較常見的腸桿菌科細菌還有變形桿菌、沙門氏菌、克雷白桿菌；綠膿桿菌屬於假單胞菌，為非發酵菌，是臨床常見的較耐藥革蘭陰性桿菌。

革蘭氏染色反應是細菌分類和鑑定的重要性狀。它是1884年由丹麥醫師Gram創立的。革蘭氏染色法(Gram stain)不僅能觀察到細菌的形態而且還可將所有細菌區分為兩大類：染色反應呈藍紫色的稱為革蘭氏陽性細菌，用G+表示；染色反應呈紅色(復染顏色)的稱為革蘭氏陰性細菌，用G-表示。

　　細菌對於革蘭氏染色的不同反應，是由於它們細胞壁的成分和結構不同而造成的。革蘭氏陽性細菌的細胞壁主要是由肽聚糖形成的網狀結構組成的，在染色過程中，當用乙醇處理時，由於脫水而引起網狀結構中的孔徑變小，通透性降低，使結晶紫-碘複合物被保留在細胞內而不易脫色，因此，呈現藍紫色；革蘭氏陰性細菌的細胞壁中肽聚糖含量低，而脂類物質含量高，當用乙醇處理時，脂類物質溶解，細胞壁的通透性增加，使結晶紫-碘複合物易被乙醇抽出而脫色，然後又被染上了復染液(番紅)的顏色，因此呈現紅色。

革蘭氏陽性細菌：金黃葡萄球菌、鏈球菌、腸球菌、利斯特菌……

革蘭氏陰性桿菌：克雷白桿菌、大腸桿菌、綠膿桿菌、流感嗜血桿菌、沙門氏菌……