新冠病毒核酸檢測樣本採集方法有常見的鼻咽拭子和口咽拭子，還有不常見的支氣管盥洗，具體採用哪種方式，要根據病人的身體狀況和各檢測機構的需要。

（▲鼻咽拭子取樣示意圖）

採集鼻咽拭子時，將長棉籤透過鼻孔插入，當棉籤頭部接觸咽後壁時，轉動棉籤完成取樣。

鼻咽拭子核酸檢測結果假陰性率較低，臨床使用較多，但存在取樣過程不適感強的缺點，部分人取樣過程中有較強疼痛感，還有人形容取樣過程“感覺棉籤要插進腦子裡”“棉籤轉動時，感覺腦子裡癢”。部分人員取樣過程中可能因鼻腔受刺激而打噴嚏，操作者存在被感染可能，所以必須戴面罩操作。

口咽拭子核酸檢測假陰性率較鼻咽拭子高，容易造成漏診。但採集過程簡單，只需用棉籤擦拭雙側扁桃體及咽後壁即可，採集過程不會產生特別不適，患者容易接受。如果操作不當也有可能出現噁心症狀。

支氣管盥洗核酸檢測準確性最高，但操作複雜，且只能用於氣管插管病人取樣，無法在臨床廣泛使用。

不同的取樣方法在取樣難度、檢測準確率和適用人群上各不相同，臨床上很少使用支氣管盥洗取樣，而鼻咽拭子和口咽拭子常同時採集、同時檢測，以增加檢測準確率，減少漏診。