1 雲霄飛車殺人事件（新一和小蘭去熱帶樂園玩不巧碰上黑暗組織的人進行交易不巧被逮被迫灌下變成柯南的藥）；
7 每月一件禮物威脅事件（小蘭懷疑柯南是新一，柯南讓阿笠博士用蝴蝶結形變聲機用新一的聲音給小蘭打電話）；
10 足球選手恐嚇事件（委託人想找新一，小蘭吃醋一同前往）；
19 六月新娘殺人事件（園子、小蘭和新一的國中音樂老師松本小百合的結婚典禮，柯南終於知道國中三年被欺負的原因）；
43 卡拉OK廳事假（柯南用新一的聲音進行破案）；
44 江戶川柯南誘拐事件（新一的父母聯合阿笠博士誘拐柯南到美國去可是沒成功）；
49~50 外交官殺人事件上下（柯南第一次變回新一，原因是重感冒再加上服部平次給柯南喝的白乾的酒）；
56 電玩公司殺人事件（有黑暗組織的下落了）；
59~60 福爾摩斯迷殺人事件（柯南與服部平次相遇，服部猜到柯南的真實身份）；
78~79 柯南對怪盜基德上下（柯南為抓住基德，柯南給阿笠博士打電話獲得基德的代號）；
80~81 名家連續慘死事件上下（柯南和服部平次三次見面二次聯手破案，服部平藏登場）；
87~88 滑雪別墅殺人事件上下（上集事件發生有小蘭和米原老師提到，下集柯南用蝴蝶結變聲器用新一的聲音打到小蘭帶著的耳環式行動電話進行推理破案）；
99~100 總投無路的名偵探連續兩大殺人事件（魔術師殺人事件篇小蘭對柯南的身份再次起疑）；
101~102 總投無路的名偵探連續兩大殺人事件（工藤有希子帶柯南到鄉下有希子一起長大的好朋友家，工藤優作進行推理）；
106~107 初戀情人回憶事件上下（麻美學姐教小蘭烤檸檬派，新一被麻美告白）；
124~125 浪花連續殺人事件上下（遠山和葉登場，和葉吃起小蘭的醋 ，柯南保護小蘭被刺，平次被打傷）；
135 黑暗組織十億元搶劫事件（宮野明美被殺琴酒所殺）；
136~139 黑暗組織來的女子 大學教授殺人事件（灰原登場）；
154~155 上野出發的北斗星上下（兇手以優作未發表的小說情節殺人）；
172~173 飛天密室 工藤新一最初的案件上下（飛機上小蘭的回憶）；
190~192 與黑暗組織再次重逢（灰原首次變回宮野志保，匹斯可被琴酒所殺）；
203 生死一瞬間 偵探隊洞窟探險記（偵探隊野外洞窟探險柯南受傷）；
204 生死一瞬間 名偵探負傷記（柯南受傷被送醫救治，小蘭抽血救柯南）；
205 生死一瞬間 第三個選擇（帝丹中學園遊會小蘭主演話劇）；
206 生死一瞬間 黑衣騎士（新一與平次聯手推理破案）；
207 生死一瞬間 新一回來了（新一回到學校上學，新一和小蘭約會）；
208 生死一瞬間 約會的地點（工藤父子相繼破了兇手父子相隔20年後的案子,破完案子後新一又變回柯南）；
257~258 大阪3K事件上下（小蘭為新一要到最愛足球選手簽名，柯南與平次一起破案）；
259 新幹線護送事件上集（這集剛開始時柯南以新一的聲音給小蘭打電話）；
272~273 總局刑警戀愛物語4上下（柯南以新一的聲音打電話個高木警官協助他破案）；
306~307 中華街雨中的Phantom上下（小蘭感冒發燒產生見到新一的幻覺）；
308~310 工藤新一的紐約事件上中下（新一和小蘭抵達美國，莎朗溫亞德登場）；
326~329 撼動警視廳 1200萬人質系列（少年偵探團的各位不巧被捲進一起事件，柯南不得已拆掉炸彈時高木警官問柯南他到底是何方神聖，柯南會他說他的確有另一個身份要到最後才告訴他）；
358~359 相似的兩位公主上下（帝丹高中選美的帝丹女王和帝丹公主共同破案）；
369~370 便利商店的陷阱上下（小蘭和新一一起推理破案為國中同學洗刷冤屈）；
371~375 與黑色組織面對面 滿月之夜的兩起神秘事件系列（服部以工藤新一的名義參加宴會，並藉助著柯南的推理一同破案）；
434 滿腹疑惑的小蘭（小蘭對柯南的手機進行密碼破解，之後柯南以新一的名義打電話個小蘭）；
452 米花町斜頂閣樓之家（優作和有希子夫婦變裝偷拍事務所變小的柯南）；
475 上戶彩與新一四年前的約定（上戶彩拜訪新一家偶然得知小彩小姐的鄰居婆婆要自殺，小彩小姐和小蘭園子前去阻止，柯南以新一的名義打電話給上戶彩小姐回答她四年前的約定）；
512~513 工藤新一少年冒險上下（柯南把小時候和小蘭回憶的故事講給班裡的同學們聽）；
536~537 服部平次VS工藤新一 滑雪場的推理對決上下（服部平次和工藤新一最開始的推理對決破案後，兩人擦身而過，新一那時已經知道服部的身份，可是那時服部不知道）；
554~555 卡拉OK包廂的死角上下（本堂瑛佑拒絕FBI的證人保護制度的保護，要轉回美國的學校也想把小蘭帶到美國，柯南向瑛佑說明身份不讓他把小蘭帶到美國去）；
566 風林火山 陰影和雷光的對決（最後結尾小蘭和和葉分別向新一和平次告白，但最後放棄）；
570~571 殺人犯 工藤新一上下（最後假扮的那個人是屋田誠人；屋田誠人給工藤新一寫信說他之前推理的案子有錯誤讓他到林裡的木屋一敘）；
572~573 新一的真實身份和小蘭的眼淚上下（可是阿笠博士誤把灰原哀製作的APTX—4869的解藥當做感冒藥拿給了服部讓柯南服下，柯南就變回了工藤新一的模樣保護小蘭不被嫌犯所傷害）；
574 真正想知道的事（服部他們一行人在回東京的路上，又捲到一起案件平次和新一共同推理解決案件後，小蘭想知道她在新一心裡的位置和感覺死也不放手）；
659~660 背叛的白色情人節上下（最後結尾時小蘭受到柯南以新一的名義送給小蘭白色情人節的回禮一包喉糖）；
667福爾摩斯默示錄 名偵探的弟子（柯南吃了小哀給的藥坐飛機去的英國）；
668福爾摩斯默示錄 Love is 0 （小蘭在途中打電話給新一問關於暗號的事，不巧大本鐘此時響起，小蘭猜到新一可能也在英國就去追，柯南沒處躲就躲到電話亭裡了在裡面吃下小哀給的另一粒藥變成新一）；
669福爾摩斯默示錄 撒旦 （柯南變成新一後，新一在大本鐘下面向小蘭告白，新一不敢外出，但利用電話向小蘭和毛利大叔給予提示）；
672福爾摩斯默示錄 0 is Start（柯南在網球場外見到了父母工藤優作和有希子，從父母那裡拿到了回程用的解藥）；
679柯南與基德的龍馬寶物攻防線 下集（結尾柯南在男廁所找到了基德的偽裝，基德問題他是否是龍馬迷，柯南告訴他，因為自己的媽媽之前演過龍馬的姐姐而且演的很可愛）；
698幽靈飯店的推理對決 下集（柯南邊用工藤新一的電話邊與世良真純推理破案）；
700偵探事務所挾持事件 阻擊（柯南打電話給小蘭，發現事務所那邊有事件發生，柯南用新一的身份被要求破案）；
701偵探事務所挾持事件 解放（柯南用新一的身份繼續推理破案）；
703柯南VS平次東西偵探推理對決 下集（柯南利用電話以工藤新一的名義進行推理）；
825工藤新一水族館事件 前後篇 （小蘭回憶與新一約會）；
836緋色的真相（柯南與父親優作在自己家裡聯手揭穿了波本的真面目和赤井秀一假死的真相）；
1 雲霄飛車殺人事件（新一和小蘭去熱帶樂園玩不巧碰上黑暗組織的人進行交易不巧被逮被迫灌下變成柯南的藥）；
7 每月一件禮物威脅事件（小蘭懷疑柯南是新一，柯南讓阿笠博士用蝴蝶結形變聲機用新一的聲音給小蘭打電話）；
10 足球選手恐嚇事件（委託人想找新一，小蘭吃醋一同前往）；
19 六月新娘殺人事件（園子、小蘭和新一的國中音樂老師松本小百合的結婚典禮，柯南終於知道國中三年被欺負的原因）；
43 卡拉OK廳事假（柯南用新一的聲音進行破案）；
44 江戶川柯南誘拐事件（新一的父母聯合阿笠博士誘拐柯南到美國去可是沒成功）；
49~50 外交官殺人事件上下（柯南第一次變回新一，原因是重感冒再加上服部平次給柯南喝的白乾的酒）；
56 電玩公司殺人事件（有黑暗組織的下落了）；
59~60 福爾摩斯迷殺人事件（柯南與服部平次相遇，服部猜到柯南的真實身份）；
78~79 柯南對怪盜基德上下（柯南為抓住基德，柯南給阿笠博士打電話獲得基德的代號）；
80~81 名家連續慘死事件上下（柯南和服部平次三次見面二次聯手破案，服部平藏登場）；
87~88 滑雪別墅殺人事件上下（上集事件發生有小蘭和米原老師提到，下集柯南用蝴蝶結變聲器用新一的聲音打到小蘭帶著的耳環式行動電話進行推理破案）；
99~100 總投無路的名偵探連續兩大殺人事件（魔術師殺人事件篇小蘭對柯南的身份再次起疑）；
101~102 總投無路的名偵探連續兩大殺人事件（工藤有希子帶柯南到鄉下有希子一起長大的好朋友家，工藤優作進行推理）；
106~107 初戀情人回憶事件上下（麻美學姐教小蘭烤檸檬派，新一被麻美告白）；
124~125 浪花連續殺人事件上下（遠山和葉登場，和葉吃起小蘭的醋 ，柯南保護小蘭被刺，平次被打傷）；
135 黑暗組織十億元搶劫事件（宮野明美被殺琴酒所殺）；
136~139 黑暗組織來的女子 大學教授殺人事件（灰原登場）；
154~155 上野出發的北斗星上下（兇手以優作未發表的小說情節殺人）；
172~173 飛天密室 工藤新一最初的案件上下（飛機上小蘭的回憶）；
190~192 與黑暗組織再次重逢（灰原首次變回宮野志保，匹斯可被琴酒所殺）；
203 生死一瞬間 偵探隊洞窟探險記（偵探隊野外洞窟探險柯南受傷）；
204 生死一瞬間 名偵探負傷記（柯南受傷被送醫救治，小蘭抽血救柯南）；
205 生死一瞬間 第三個選擇（帝丹中學園遊會小蘭主演話劇）；
206 生死一瞬間 黑衣騎士（新一與平次聯手推理破案）；
207 生死一瞬間 新一回來了（新一回到學校上學，新一和小蘭約會）；
208 生死一瞬間 約會的地點（工藤父子相繼破了兇手父子相隔20年後的案子,破完案子後新一又變回柯南）；
257~258 大阪3K事件上下（小蘭為新一要到最愛足球選手簽名，柯南與平次一起破案）；
259 新幹線護送事件上集（這集剛開始時柯南以新一的聲音給小蘭打電話）；
272~273 總局刑警戀愛物語4上下（柯南以新一的聲音打電話個高木警官協助他破案）；
306~307 中華街雨中的Phantom上下（小蘭感冒發燒產生見到新一的幻覺）；
308~310 工藤新一的紐約事件上中下（新一和小蘭抵達美國，莎朗溫亞德登場）；
326~329 撼動警視廳 1200萬人質系列（少年偵探團的各位不巧被捲進一起事件，柯南不得已拆掉炸彈時高木警官問柯南他到底是何方神聖，柯南會他說他的確有另一個身份要到最後才告訴他）；
358~359 相似的兩位公主上下（帝丹高中選美的帝丹女王和帝丹公主共同破案）；
369~370 便利商店的陷阱上下（小蘭和新一一起推理破案為國中同學洗刷冤屈）；
371~375 與黑色組織面對面 滿月之夜的兩起神秘事件系列（服部以工藤新一的名義參加宴會，並藉助著柯南的推理一同破案）；
434 滿腹疑惑的小蘭（小蘭對柯南的手機進行密碼破解，之後柯南以新一的名義打電話個小蘭）；
452 米花町斜頂閣樓之家（優作和有希子夫婦變裝偷拍事務所變小的柯南）；
475 上戶彩與新一四年前的約定（上戶彩拜訪新一家偶然得知小彩小姐的鄰居婆婆要自殺，小彩小姐和小蘭園子前去阻止，柯南以新一的名義打電話給上戶彩小姐回答她四年前的約定）；
512~513 工藤新一少年冒險上下（柯南把小時候和小蘭回憶的故事講給班裡的同學們聽）；
536~537 服部平次VS工藤新一 滑雪場的推理對決上下（服部平次和工藤新一最開始的推理對決破案後，兩人擦身而過，新一那時已經知道服部的身份，可是那時服部不知道）；
554~555 卡拉OK包廂的死角上下（本堂瑛佑拒絕FBI的證人保護制度的保護，要轉回美國的學校也想把小蘭帶到美國，柯南向瑛佑說明身份不讓他把小蘭帶到美國去）；
566 風林火山 陰影和雷光的對決（最後結尾小蘭和和葉分別向新一和平次告白，但最後放棄）；
570~571 殺人犯 工藤新一上下（最後假扮的那個人是屋田誠人；屋田誠人給工藤新一寫信說他之前推理的案子有錯誤讓他到林裡的木屋一敘）；
572~573 新一的真實身份和小蘭的眼淚上下（可是阿笠博士誤把灰原哀製作的APTX—4869的解藥當做感冒藥拿給了服部讓柯南服下，柯南就變回了工藤新一的模樣保護小蘭不被嫌犯所傷害）；
574 真正想知道的事（服部他們一行人在回東京的路上，又捲到一起案件平次和新一共同推理解決案件後，小蘭想知道她在新一心裡的位置和感覺死也不放手）；
659~660 背叛的白色情人節上下（最後結尾時小蘭受到柯南以新一的名義送給小蘭白色情人節的回禮一包喉糖）；
667福爾摩斯默示錄 名偵探的弟子（柯南吃了小哀給的藥坐飛機去的英國）；
668福爾摩斯默示錄 Love is 0 （小蘭在途中打電話給新一問關於暗號的事，不巧大本鐘此時響起，小蘭猜到新一可能也在英國就去追，柯南沒處躲就躲到電話亭裡了在裡面吃下小哀給的另一粒藥變成新一）；
669福爾摩斯默示錄 撒旦 （柯南變成新一後，新一在大本鐘下面向小蘭告白，新一不敢外出，但利用電話向小蘭和毛利大叔給予提示）；
672福爾摩斯默示錄 0 is Start（柯南在網球場外見到了父母工藤優作和有希子，從父母那裡拿到了回程用的解藥）；
679柯南與基德的龍馬寶物攻防線 下集（結尾柯南在男廁所找到了基德的偽裝，基德問題他是否是龍馬迷，柯南告訴他，因為自己的媽媽之前演過龍馬的姐姐而且演的很可愛）；
698幽靈飯店的推理對決 下集（柯南邊用工藤新一的電話邊與世良真純推理破案）；
700偵探事務所挾持事件 阻擊（柯南打電話給小蘭，發現事務所那邊有事件發生，柯南用新一的身份被要求破案）；
701偵探事務所挾持事件 解放（柯南用新一的身份繼續推理破案）；
703柯南VS平次東西偵探推理對決 下集（柯南利用電話以工藤新一的名義進行推理）；
825工藤新一水族館事件 前後篇 （小蘭回憶與新一約會）；
836緋色的真相（柯南與父親優作在自己家裡聯手揭穿了波本的真面目和赤井秀一假死的真相）；