簡單點說，秦帝國之初，秦始皇大搞打倒土豪劣紳分田地運動，使平民耕者有其田，這就使得統一之前的各國貴族利益大大受損。加上很多儒生憤青只會耍嘴皮子不幹實事，對國家大計、方針路線、政策綱領說三道四，又說不出良性建議，最後還各種搗亂搞破壞，儒生們犯了秦國的“反革命罪”，所以秦始皇憤而坑之。

第一，評判事件首先看當時的歷史大環境，要具體問題具體分析。焚書是李斯倡議，為何？因為首先，千古以來，打江山難，坐江山更難；秦滅六國，一統天下，是表象，但不等於就屁股底下是一片風平浪靜，可以安坐江山；六國老氏族無時無刻不想著復辟，各種力量扭曲，湧動，統一初定的秦國暗潮洶湧，風雨如晦，在揮劍決浮雲，諸侯盡西來的背後，是深徹的復辟危機，後來胡亥亂政，大澤鄉起義後，六國瞬間復辟即是明證。焚書是秦國統一後郡縣制實行第8年，秦始皇34年，六國老氏族復辟浪潮正自兇猛，搏浪鼓刺殺已過，博士儒生淳于越竟於此時，公然上書，提出廢除郡縣制，力行王道，恢復分封制，給皇家子弟封侯裂土的請求。而此時的秦國，已經7代實施商鞅變法時的縣制（秦孝公至秦始皇為7代君主），並正式設立帝國郡縣制8年，累計實行縣制141年，木已成舟，生米不但熟飯，而且都生了厚重的鍋巴，而此時儒生公認老調重談，並大以為非，其悖逆，其狂妄，其有違常理之幅度，擺明了其背後有強大的復辟力量推動，而且其力道之猛，可以想象，這件事情將復辟勢力公開擺上了檯面，反覆闢的鬥爭刻不容緩。李斯作為法家代表人物、丞相、郡縣制發起者，是論戰的最主要戰將。【三代不同禮而王，五伯不同法而霸】，【治世不一道，便國不法古】，【不法古、不修今】，【就事論事】，【具體問題具體分析】是法家的核心思想。面對早在六代之前商鞅變法之時已經被拋棄的腐朽言論，李斯痛加駁斥了以古非今的論調，揭露了儒家依附分封而存的立場，並倡議焚燒除農家醫家墨家等實用之學和秦宮保留史書之外的“王道之書”、“春秋古籍”，並禁止以私學非議朝政，這就是焚書的起因。郡縣制與封建制，孰優孰劣，已不難辯駁。秦始皇清晰的看到了，封建是戰亂之源，因此維護商鞅變法的歷代成果，力行郡縣。而劉邦採取半郡縣，半封建，結果如何？七國之亂，王莽篡漢，東漢末年分三國；晉帝司馬炎，實行分封制，如何？16國分華夏，八王之亂，五胡亂華。孰優孰劣，自不待言。回到焚書。誠然，焚書為過，但我們不能不看到在焚書背後的大時代背景，儒生為何倡議古代分封？因為分封是復辟的首要條件。儒生倡議廢除郡縣，恢復分封，不過是六國利用儒生做探路石，試探和瓦解初生的統一秦國之步驟。當是時，如果你是那個橫掃六合，虎視雄踞的千古一帝，面對復辟浪潮的如此挑釁，你會作何感想？如何反擊？我只知道，即便再偉大的胸懷，也不能拿六世基業開歷史玩笑。強硬反擊挑釁，摧毀詆譭根基，保住初創的帝國基業，是秦始皇的不二和唯一選擇。而詆譭秦政、郡縣制的根基為何？不過是那些詩、書、禮、樂的所謂王道大政罷了。焚掉這些無用之書，口舌之書，與民何害？我們且看看，焚書的真正實施結果又如何？儒家因此滅絕了？沒有。儒生因此消失了？更沒有。焚書，只是政治威懾力大於破壞力罷了。千古之下，看康有為如何說：秦焚書，六經未因此而亡。秦坑儒，儒生未因此而絕。議禮者三十餘人，皆秦諸生，皆未嘗被坑者。其人皆懷六藝，學通《詩》《書》，逮漢猶存者也。然則以坑儒為絕儒術者，亦妄言也。再看看魯迅如何說：秦始皇實在冤枉得很，他的吃虧是在二世而亡，一班幫閒們都替新主子去講他的壞話了。不錯，秦始皇燒過書，燒書是為了統一思想。但他沒有燒掉農書和醫書；他收羅許多別國的“客卿”，並不專重“秦的思想”，倒是博採各種的思想的。——————————————————————————————————————坑儒，坑的也不是儒家子弟，大部分是方士。方士是什麼人，也就是求神算命，長生不老的法師們，以徐福為代表，徐福在焚書之前，已經入海閃人；坑儒發生在焚燒後第二年，方士候生、盧生等替秦始皇尋仙藥而不得，為了彌補自己無能，開始詆譭秦始皇，說他剛愎自用，以刑殺為威，貪於權勢，此不足以得仙藥也。我們知道秦國就像現在的民營企業，都很實在，都是拿結果說話，拿業績說話，錢給你了，時間給你了，期限到了，就要給業績，就要考核，考核不達標就要淘汰，不達標甚至拿企業開涮的犯罪的就要治罪。於是，盧生和候生在績效考核前，心裡發虛，逃跑了。方士頓時失去信任，秦開始由御史大夫全面考核，方士哪裡經得起考核？哪裡有仙藥？哪裡有神蹟？用今天的話說，一幫騙吃騙喝的江湖騙子罷了。於是，全面逮捕。小部分儒家，大部分方士，根據歷史記載460多人全部被坑。這也怪不得誰，在以法制強盛，以法制滅六國的秦國，觸法者必亡。焚書和坑儒，是兩件獨立起來的事情，歷史上也不一定曾真實發生，史學家有杜撰的考證。但即便是真實發生，這兩件事情也有其發生的深遠背景與推動力，以一個普通凡人的眼光和選擇，去評判一個豪邁古今的千古一帝，是不可能無誤的，也是不可能準確的，我們能看到明面上的大體事情記載，但不可能作為當事人去體會其眼光所及。但是，我們可以清楚的知道一件事情，那就是秦始皇在完成滅六國之偉業後，並沒有立刻躺在功勞簿上睡大覺，而是依然一如既往的勤奮、努力和警惕，這位始皇帝每日要批閱120多斤奏章，每日只睡4到5小時，少有娛樂，連皇后都不立，修長城，建馳道，書同文，車同軌，統一度量衡，其武功蓋世千古，其文治造福千載，而且秦始皇在位期間，從無錯殺，冤殺一位功臣，所有文臣武將，絕無狡兔死，走狗烹之命運，從無一起悲劇，僅此一項，足以證明秦始皇之胸襟，之誠摯，之決斷，之清醒，千古一帝配得上，前無古人，後無來者，這八字評語。秦始皇如果真的做出了焚書坑儒的選擇，必然有其原因，這絕不是昏頭舉措。但，得罪了文化人，是不得了的。尤其是儒家。焚書和坑儒這兩件事情，被作為秦始皇和秦政殘酷暴戾、滅絕文化的鐵證，被儒家從漢朝一直罵到現在，成功的讓千古一帝遺臭萬年，秦也和暴牢牢鎖定，凡舉秦，必不離暴。後人之眼光，只以成敗論英雄。秦因其短暫，而一短毀所有。後世已經在儒家影響下，打下深刻烙印：短，因其暴。暴，所以短。事實是這樣嗎？就跟戀愛一樣，時間短，未必情不深；時間長，未必情很深。漢承秦制，秦始皇與文臣武將創立的所有，除了郡縣制，被劉邦全部搬走，連衛青、霍去病出徵，都走的是秦朝建成的全國高速公路網——馳道。漢祚400餘年。短乎？巍巍長城，屹立至今，巍然世界，短乎？中華文明，自隸書，而普及最底層大眾，方塊字至今流轉於鍵盤俠指下，短乎？秦二世而亡，秦始皇不早立扶蘇，是其根本失誤。而秦之亡，其核心在於內部的趙高、李斯、胡亥惡性政變，迅速摧毀和瓦解了一切秦政廟堂，廟堂是朝代的首腦，是發號施令的中樞，三公九卿被趙高和胡亥誅戮一空，任何軍情政情完全中斷，初建的秦國，就像一個新生兒，突發腦溢血，瞬間倒下，休克。即便如此，休克中的秦帝國依然爆發出了令人驚歎的戰鬥力，甚至沒有動用滅六國的秦國主力軍團（一在九原，一在嶺南），少府章邯，僅僅帶領這一波臨時整編列隊的驪山刑徒，就如鷹擊雲雀，風捲殘雲，將起義民軍與六國復辟軍打的抱頭鼠竄，六國復辟核心項梁也自殺與定陶之敗，僅剩趙國未平，秦國迎來了最後的自我休整曙光。然而這時，章邯和增援的王離犯了戰略性選擇錯誤，本應穩妥據險防禦，率隊回師咸陽，靖亂復國，他們卻想為靖亂徹底奠定局勢，出擊趙國。結果最後的決戰，鉅鹿之戰，項羽破釜沉舟，九戰秦軍，掘其甬道，秦軍斷糧，章邯不得已退軍，最終投降。項羽坑殺20萬刑徒降卒，後又彭城坑殺30萬，屠城6次，被後世譽為【人傑、鬼雄】。秦始皇坑儒460人被罵為千古殘暴第一。儒家之價值觀與評判標準，呵呵，無解。此時，在咸陽，子嬰誅趙高靖亂，立為秦三世，秦的腦休克好容易自我修復，但是已經太晚了，46天后，劉邦西進咸陽，子嬰投降，秦滅。