主要是明朝崇禎疑心太重。不相信屬下。不放手指揮權調兵譴將權。怕傭兵自重在打仗上處處掣肘制約。後金只用反間計。就能讓崇禎冤殺熊婷弼。

熊廷弼確實擁有軍事謀略，是遼東邊務的中流砥柱，但遼東不是在他手裡丟的，雖然他任遼東經略，官最大，但軍權掌握在遼東巡撫王化貞手裡，是王化貞幹了敗仗，一路逃下來，碰到北上的熊廷弼時，還將手裡僅有的5000人馬拿去掩護百姓撤退，當然這敗仗之責必須兩人來背了，誰讓他倆是最高長官呢。

熊廷弼兩次經略遼東，一次是1619年，一次是1621年，其實在這兩次經略之前，他曾以都御史身份巡按遼東，給當時的遼東總兵李成梁建言獻策，反響不錯，所以在1619年薩爾滸之戰明軍慘敗後，勇提熊廷弼經略遼東，規格很高，賜了尚方寶劍，軍政都他管，撫民備軍，經略的很成功，但他情商很低，朝中樹敵太多，沒多久就被彈劾去職。

第二次經略遼東，是1621年，明軍又遭敗仗，丟瀋陽、遼陽兩重鎮，經略袁應泰自殺，這時朝中又想起有點能幹的熊廷弼，可有人擔心他權力過大，於是給配了個巡撫叫王化貞。說一下明朝官制經略與巡撫的關係，明面上經略大於巡撫，但大家都是直面中央的，只要實力雄厚，完全可以不鳥，王化貞就是這樣的人。

雖然熊廷弼官比王化貞大，但王化貞背景深厚，他是東林黨的重要成員，所以在遼東6萬軍隊全握在王化貞手裡，熊廷弼只有區區5千人馬，王化貞主張攻，熊廷弼主張防，觀點還不同，所以第二次經略遼東的熊廷弼被排擠在外，一沒軍權二沒話語權，當廣寧之戰打響時，熊廷弼啥都不知道，城都丟了熊廷弼趕著去救已晚了，王化貞已孤身一人逃跑。

廣寧之戰後，明朝在遼東的統治基本結束了，遼東雖是熊廷弼在任經略時丟的，但是在遼東巡撫王化貞手裡丟的，熊廷弼作為最高長官也要負責任，但不是主責，廣寧之戰後朝廷的做法是，抓王化貞，罷熊廷弼，也能看出兩人責任之分。

天啟元年(1621年) 3月，熊廷弼再次經略遼東。熊廷弼認為努爾哈赤剛剛佔領遼陽，根基不穩，遼東百姓心裡也不服努爾哈赤，要想收復遼東，就須三方佈置，以一軍從廣寧出發與敵人對峙於三岔河，吸引敵軍主力，一軍從海上出南衛，只為疑兵，努爾哈赤必然感到腹背受敵，一奇一正相互結合，努爾哈赤必兩方不得兼顧。於是熊廷弼在登菜、天津、廣寧三地設撫鎮，並由他親自坐鎮山海關經略節制三方，三方佈置之策一出，各方一致叫好。只是熊廷弼以往的臭脾氣並沒有改掉，與兵部尚書張鶴鳴產生了嫌隙。

當時任遼東巡撫的是王化貞，此人也是個軍事菜鳥，卻自視其高，而整個遼東的軍隊卻基本掌握在了王化貞的手上。王化貞沿遼河設定了西平、鎮武等六營抵禦努爾哈赤。熊廷弼一看王化貞的部署就急了，認為這些堡壘根本就防不住努爾哈赤，一旦一個堡壘被攻陷，其他的堡壘也必然士氣崩潰，努爾哈赤只要集中兵力攻擊一點，整個防線就會全部玩完。而熊廷弼的防守策略是儘量集中兵力在重要的地區，不重要的地區只是象徵性地駐兵，一旦努爾哈赤來襲，這樣的分兵策略就便於調集優勢兵力進行防守。

對於熊廷弼的建議，王化貞認為是在拆他的臺，當即表示如果不按照他的策略佈防，他就不幹了，由此熊廷弼與王化貞之間也產生了矛盾。同時熊廷弼與張鶴鳴的矛盾也大大地掣肘了他的部署。熊廷弼派梁之垣聯絡北韓，為三方佈置之策呼應，請求明廷發六萬兩白銀以為資費，天啟允諾。兵部尚書張鶴鳴卻從中作梗，銀兩遲遲不發。

熊廷弼二度出山，本以為能大有一番作為，不想被張鶴鳴和王化貞這哼哈二將架空，軍備錢糧直接過山海關送到了王化貞那裡。熊廷弼要兵沒兵，要糧沒糧。熊廷弼要求王化貞集中兵力在廣寧，王化貞卻認為要卻敵於境外，將兵力分散在了各要口。對於進攻，熊廷弼認為糧草還沒齊備，不宜發動進攻，而王化貞則幼稚地認為只要他的大軍一過河，河東的明朝父老會膳食壺漿以迎王師，根本就不需要後勒。

而此時的努爾哈赤已經磨刀霍霍，他新訓練了四五萬遼兵，加上他的六萬八旗軍，主力已經增加到了十餘萬人。對於平定努爾哈赤，王化貞竟然胸有成竹。他認為自古當上兵伐謀，要策反敵軍大將，他自認為策反了最早投降努爾哈赤的漢將李永芳，卻不想派去策反李永芳的孫得功反被策反，此時的永寧城內其實已經遍佈奸細，王化貞卻全然不知。

十二月二十三日，王化貞兵出三岔河，兵鋒直至河東，可是期待的蒙古人沒有來，河東派出的間諜也沒有動靜，只好掃興而歸。就在王化貞和熊廷弼矛盾不斷激化的時候，到了天啟二年正月(1622年) ，努爾哈赤率軍進攻遼西，包圍了西平堡，西平堡守將羅一貫率軍堅守，努爾哈赤連續攻城不下，暫時包圍了西平堡。聽聞努爾哈赤來襲，王化貞派祖天壽，孫得功率軍支援西平堡，駐守閭陽的大將祁秉忠率軍一萬，熊廷弼派出鎮武大營總兵劉渠帶兵兩萬，三路大軍匯合迎戰努爾哈赤。

羅一貫以三千兵馬駐守西平堡兩日，到二十一日，西平堡最終為努爾哈赤攻佔，羅一貫英勇戰死，他以三千兵馬的代價殺傷後金軍達六七千之多，值了。努爾哈赤率軍攻打西平堡的同時，也派出了部隊阻截明朝援軍，兩軍在三岔河的平陽橋相遇，祖天壽、祁秉忠、劉渠輪番上陣，雙方互有損傷。就在雙方激戰的時候，孫得功竟然率軍撤退，使大軍一時間全部亂套，劉渠在混戰中率軍突入敵陣戰死。祁秉忠也在戰鬥中身負重傷，在身邊士兵的拼死保護下才得以突圍而出，於回城的途中死去。其副將劉徵也戰死當場。

之後的戰爭進展也如熊廷弼所料，努爾哈赤在拿下西平保後，沿河的守軍全無鬥志，紛紛未戰先逃。二十三日，孫得功及其屬下控制了廣寧城，並打算將廣寧城獻給努爾哈赤，城內的軍民紛紛出城而走直奔山海關。就是到了這個時候王化貞竟然還矇在鼓裡，在部下的提醒下才發覺原來孫得功已經叛變，於是匆匆收拾了行李逃出了廣寧城。熊廷弼派出所部五千人從右屯趕往廣寧，到了閭陽的時候才知道了廣寧的變故，熊廷弼便令全軍撤退。退到了大淩河的時候，熊廷弼遇到了狼狽逃出來的王化貞，這個時候王化貞也是痛哭流涕，後悔不迭。

有人建議熊廷弼堅守寧遠前屯一帶，熊廷弼則認為遼東的局勢已不可挽回，護送著百姓退到了山海關。戰爭的程序也如熊廷弼預想的一樣，王化貞分兵各處把守，結果一個西平堡被攻下，其他的堡壘全部不戰而逃，整個防線瞬間崩潰。

其實努爾哈赤二十一日拿下西平堡後，由於損失慘重，大軍徘徊三日不敢進，直到二十四日才進入了廣寧。努爾哈赤也只是在廣寧燒殺搶掠一番而去，二十七日就回到了遼陽，並沒有長期據守的打算。當時的形勢未必已不可挽回，如果重奪廣寧城或許還有可能。可是熊廷弼一來是與王化貞負氣，想看王化貞的笑話，二來不想犯險，便主動放棄了整個東北。而熊廷弼這一跑就給後來彈劾他的官員落下了口實。這位真正懂得遼東形勢的軍事大佬就這樣因為此事丟了腦袋，實在不值。