不止，東漢時，長安，洛陽，許昌。唐朝時，西都長安，東都洛陽。宋朝時，東京開封，西京洛陽，南京應天府，北京大名府。明朝，北京，南京。

燕王朱棣取得政權以後把都城遷到自己經營多年的封地，一是天子戍邊可以節省大量的軍費開支；二是朱棣總覺得都城在南京自己被建文餘黨包圍，不安全。

燕王遷都以後保留南京，可以順理成章的把建文餘黨留在南京，掛起不用，排除異己，去北京培養自己的原班人馬，所以就造成了明朝兩都的局面。

明朝建立初期，朱元璋就有遷都的想法，原因一個是歷朝歷代統一的王朝都城都在中原，另一方面南京皇宮是填湖所建。建成之後，由於地表下沉，逐漸形成南高北低的態勢，在風水上是不祥的徵兆。洪武二十四年（1391年），明太祖派遣太子朱標考察關中地區，為遷都西安作準備。然而第二年朱標（朱允炆的父親）病逝，沉重打擊了明太祖，加上年事已高令其不願再勞師動眾地更換京師。

中國由秦朝至唐朝在中原地方建立的大一統的皇朝近一千二百多年間，長安與洛陽長期互動成為首都，洛陽更隨著朝代更替，多次成為首都或東都，直至北宋滅亡為止。南宋定杭州為行在，建康改為留都。洪武元年曾設開封府為陪都，但不久即罷。洪武二年，設鳳陽府為陪都，稱中都。明成祖將首都遷往北京，應天府南京則作為陪都，。起初明朝設立兩京主要是為遷都一事做準備，遷都後為了鞏固鞏對南方的統治，所以留南京為陪都。當皇帝在行在而不在正都時，國政由其他人代理，在許可權限制的基礎上由太子代理被稱為“太子監國制”，由信賴的大臣代理被稱為“留守官制”。

歷史上其實不僅僅是明朝有兩京，曹魏的時候更是有五個都城鄴、許昌、洛陽、譙、長安；東漢有京都洛陽、西京長安、南都南陽；東吳的建業、武昌二都；北魏的京都洛陽和北京平城（此北京為北方的京都的意思，並非現在北京）；唐朝更是有六都京都長安、東都河南、北都太原、西都鳳翔、南京成都（此南京是南方京都的意思）中都河中、南都江陵；北宋也有東京開封、西京河南、南京應天、北京大名（在今天的邯鄲市）、清朝也設京都和盛京奉天府兩京，雖然都稱為都城，但是政治地位是分高低的，有的是出於鞏固地方政治、有的可能只是建國初期步步為營時臨時的國家政府，

現代其實仍然有兩京復都制、陪都制的存在，符合復都制的國家主要有南非 （行政首都比勒陀利亞、立法首都開普敦、司法首都布隆方丹）、馬來西亞（國會及皇宮所在地吉隆坡、行政中心及司法機構所在地布城）等。