首先要說明一點，漢末三國時期是沒有什麼“秘書長”的，秘書機構其實是尚書檯，所謂的秘書長其實就是尚書令。還有，劉備沒稱漢王，而是漢中王，稱漢王的是他老祖宗劉邦。

再說說尚書令這個職務，他相當於大秘書長，但又不太一樣，因為他不僅是秘書機構的首領，即內朝的總管，也同時需要處理朝堂事務。尤其是東漢以後，大將軍、丞相等高階職務都要加一個“錄尚書事”的頭銜，以轄制尚書檯的事務。

如果按現在的政治體制來做比較，丞相就相當於總理，而尚書令相當於中央辦公廳主任。前者雖然和後者沒有明顯的統屬關係，卻因為是領導人而有權管轄後者。

再看這三任尚書令的人選：法正、劉巴和李嚴，不僅能力都確實不錯，而且都有一個共同的特點，那就是劉璋舊部。作為一個外來政權，蜀漢政權的首腦位置也就是丞相是必須用自己人的，但是文臣的二把手也就是尚書令，卻必須要有原來政權的人參與進來。

這是基本的政治執行規律，劉備不可能不明白，所以他會把權柄最大的職務丞相交給諸葛亮，而相對次要一點點的尚書令交給其他集團的人。

我來回答下這個問題，當年劉備在漢中稱王后，特意設定了一個比較特殊的機構，叫做尚書檯，也就是劉備的秘書處，主要職責是協助劉備處理國家的日常事務。

按理說以諸葛亮當時的資歷，他應該是秘書長的最合適人選，但問題是，當時的諸葛亮實際職位是軍師將軍，管理的更多的軍事方面的行政和後勤，在當時那個戰爭年代，這個位置是非常重要的，直接關係到劉備軍隊的後勤保障，可以毫不客氣的說，諸葛亮的這個位置，掌控著劉備的半條命脈！

在這種情況下，劉備顯然是不可能把諸葛亮調離到秘書處工作的，因為在荊州集團內，沒有人比諸葛亮做得更好，也沒有人比他更合適，而益州集團才剛剛被征服，其中很大部分人的政治可靠性還不能百分之百保證，所以劉備不可能讓益州集團中的人來掌控自己的後勤命脈！

同時，當時的秘書處雖然說是協助劉備處理國家政事，但實際上就是處理益州的政務，因為荊州已由關羽坐鎮處理，不可能再讓別人來插手，實際上除了劉備也沒有人敢插手。在這種情況下，為了安撫益州原來的那些各級官員和豪門大族，選擇一個益州本地有威望的人來協助處理益州的日常事務，相對而言更容易讓益州當地的各個社會階層接受。

另一方面，選擇益州人來擔任秘書長，也是對益州集團利益的照顧，否則你劉備陣營中的高層實權位置，都被荊州集團或者劉備的鐵桿兄弟佔據，那益州集團的大佬們自然全部都得靠後排坐，明白著就是想讓益州集團低人一等，在這種情況下，他們會對劉備真心實意的歸順而沒有怨言嗎？所以劉備必須平衡荊州集團和益州集團的利益。

在這種背景下，深受劉備信任的益州大佬法正很榮幸成為第一任秘書長，在法正死後，劉璋的舊部劉巴成為第二任秘書長，等到劉巴死後，劉璋的另一箇舊部李嚴成為第三任秘書長。這實際上就要劉備在特意平衡荊州集團和益州集團的利益，緩解雙方的矛盾。當然，這三任秘書長所擁有的權力，顯然都是無法與諸葛亮相比的，因為諸葛亮始終掌控著最重要的東西：軍隊的行政和後勤。尤其是在劉備死後，諸葛亮更是全面接管了軍事權力，在這種背景下，李嚴就更無法與諸葛亮抗衡了！

相信看過三國演義的人都有一個困惑，為何劉備三顧茅廬，大費周折的請諸葛亮出山，從入川便開始冷落諸葛亮。劉備後期冷落諸葛亮，不是因為諸葛亮沒有才能，恰恰是因為諸葛亮太有才能。

所謂秘書長，就是尚書令。劉備入川之後，進位漢中王，設定尚書檯，尚書檯最高長官便是尚書令。尚書檯本就是皇帝的秘書處，原本是代替皇帝處理日常事務的。那麼劉備進位漢中王之後有哪幾位尚書令呢？劉備的第一位尚書令是法正，法正這個人能力很強，對劉備入川及進位漢中王，也作出了很大的貢獻。第二位尚書令是劉巴。法正和劉巴任職尚書令的時候，諸葛亮的工作是軍師將軍兼錄尚書事，所謂錄尚書事，也可以參與尚書令的工作，但是實際權力掌握在尚書令手中。就是說錄尚書事只有建議權，而沒有決策權。

第三位尚書令，是李嚴。劉備白帝城託孤的時候，李嚴為尚書令，諸葛亮為丞相兼錄尚書事，但沒有丞相府。

到這裡已經明白，劉備的三位秘書長全是益州本土人。劉備這麼做的最大目的，是為了平衡益州和荊州兩大勢力。只是劉備低估了諸葛亮的政治能力，劉備死後，諸葛亮便戰勝李嚴，將蜀國的實際權力，掌握在自己手中。

其實，劉備這麼做的目的，表面上看是為了平衡兩大勢力，但是筆者認為應該還有更深層的原因。那就是為了給劉禪鋪路，劉備生前壓制諸葛亮，但是劉備死後，劉禪即位，諸葛亮的地位便如日中天。是為了讓劉禪給諸葛亮恩惠，讓諸葛亮能死心踏地輔佐劉禪。這就好像李世民當年對李勣一樣，李世民臨終上對唐高宗李治說，你對李勣沒有什麼恩惠，朕現在準備貶他為外官。朕死後，你應當授給他僕射之職，他就蒙受了你的恩惠，必定為你盡死力。

政治就是這樣，你看到的未必是真相。

這個“秘書長”指的應該是尚書令吧。

劉備的第一任尚書令是法正，可惜法正壽命不長，幹了兩年就去世了。

先主立為漢中王，以正為尚書令、護軍將軍。明年卒，時年四十五。

然後繼任者是劉巴。

建安二十四年，先主為漢中王，巴為尚書，後代法正為尚書令。

劉備稱帝之後，劉巴死於章武二年，同年，劉備任命李嚴為第三任秘書長。

章武二年，先主徵嚴詣永安宮，拜尚書令。

諸葛亮同期的職位是這樣的：

成都平，以亮為軍師將軍，署左將軍府事。……先主於是即帝位，……亮以丞相錄尚書事，假節。張飛卒後，領司隸校尉。

不過劉備自立為漢中王后，向漢獻帝繳還了左將軍印。所以諸葛亮這個“署左將軍府事”當然也就跟著去了。所以，劉備稱帝之前，諸葛亮是軍師將軍；稱帝之後，諸葛亮是丞相。

尚書令是尚書檯的長官，尚書檯是漢武帝開始設定的，可以視為朝廷的秘書處，尚書令相當於朝廷的秘書長，雖然品秩不如部長級的九卿高，更不如副國級的三公，但處在權力的核心位置，非常重要。

劉備稱漢中王，參照曹操稱魏王的做法，可以任命一位王國的尚書令，這個尚書令是“漢中國”的秘書長，當然比較顯要，但劉備沒有任命諸葛亮，而任命的是法正。

這是不是意味著諸葛亮的地位不如法正呢？其實不是，這只是分工不同，因為劉備當時有3套班子在同時執行，“漢中國”下面的領導機構只是其中之一，在另外兩套機構裡，諸葛亮都擔負著重任。

劉備的第一套班子是左將軍府，這是管軍事的，諸葛亮以軍師將軍的身份“署左將軍府事”，也就是主持左將軍府的日常工作，劉備稱漢中王之前軍事方面都由左將軍府管，而其日常事務是諸葛亮在處理。

劉備稱漢中王后任命了四方將軍，其中就有左將軍，這兩個左將軍是不一樣的，劉備的左將軍是漢朝的左將軍，關羽等人的四方將軍是“漢中國”的，劉備把左將軍的印信送還給了漢室，但不意味著軍事就改由“漢中國”尚書檯去管了，事實上，軍事事務仍然由諸葛亮在協助劉備管。

理由是，劉備任命四方將軍，在醞釀人選時諸葛亮就發表了意見，而未見法正說什麼，劉備任命黃忠為四方將軍之一，諸葛亮認為不妥，曾提醒劉備，說明諸葛亮仍在行使著之前“署左將軍府事”的職責。

劉備的第二套班子是益州牧府，這是處理行政事務的，在這方面諸葛亮仍然是劉備的第一助手，諸葛亮不僅親自兼任了益州郡太守，而且協助劉備處理日常事務，“先主外出，亮常鎮守成都，足食足兵”，在行政上也是僅次於劉備的“二把手”。

劉備的第三套班子在“漢中國”下，與前面兩套班子有交叉，但不能取代，因為“漢中國”的範圍只有幾個郡，而不是劉備佔領區的全部，法正的這個尚書令，也只是負責一部分行政事務，他平時的主要角色是劉備的“謀主”，只是與諸葛亮的作用不一樣而已，說他超過諸葛亮，沒有任何依據。

這一階段，諸葛亮的實際作用遠重要於擔任“漢中國”尚書令的法正，後來法正去世，劉備這時已經不是漢中王了，已經稱帝，也仍需要一位尚書令，這是蜀漢朝廷的秘書長，劉備用劉巴來接替法正，這個任命又能證明，法正之前擔任的尚書令作用是有限的。

劉備這次又沒有任命諸葛亮，這是因為諸葛亮此時已擔任了丞相一職，地位和作用均遠遠高於尚書令，並且“錄尚書事”，也就是分管尚書檯的工作，成為尚書令的直接領導。

至於劉巴死後劉備又任命李嚴為尚書令，道理也一樣，只能說明諸葛亮的地位遠高於李嚴，而且是李嚴的直接“分管領導”。