糞便經發酵分解後不僅可直接作吃食性魚的餌料，而且其分解過程釋放的能量及速效養份又可作浮游生物生長的營養物質，為濾食性魚提供了餌料。使用發酵糞便應做到以下幾點： 　 一、新出池的發酵糞便，要在外面堆放1-2天，以釋放掉對魚類生長有害的氣體。　　二、若發酵好的糞便肥如起培肥水質的作用，魚塘宜放濾食性魚類，以白、花鰱為主，可佔投放量的70%左右。若將發酵好的糞便製成顆粒飼料再用微生物菌噴溼料投入魚塘，宜放養吃食性魚類，以草、鯿魚為主，佔投入量50%左右，再搭配其它的魚類。　　三、一般應在晴天上午施肥，因為陰雨天水中浮游植物光合作用差，不易分解發酵好的糞便中的有效成份。　　四、根據季節調整施肥量。初春，晚秋的氣溫、水溫較低，魚生長慢，需食量不大，可少施；七、八、九月高溫季節，氣、水溫均高，魚生長快，需食量大，可多施。　　五、飼餵時應注意遵從“由少到多，慢慢適應”的原則，如第一天可添加發酵飼料用量佔日糧的10%，第二天20%，逐漸加多。

養魚單位及專業戶，一向有應用人畜糞便與農盛樂糞便發酵劑發酵合成後直接放魚池的習氣。因人畜糞便經發酵合成後不只可直接作吃食性魚的餌料，而且其合成過程釋放的能量及速效養份又可作浮游生物生長的營養物質，為濾食性魚提供了餌料，但新穎人畜糞便入池，在合成過程中要耗費大量氧，常常形成魚池溶解氧幅度降落，惹起魚浮頭，且肥效受氣溫、池溫影響，不穩定，難控制；某些寄生蟲、病源菌也隨糞便入池，易惹起魚病發作。假如先將畜糞便入發酵池發酵產氣，再將發酵好的糞便投入魚池，既能堅持人畜糞便直接入池的優點，又能剋制其缺陷。實驗結果充沛證明，人畜糞便與糞便發酵劑發酵糞便餵魚相比，施用發酵過的糞便，魚池裡水解氮可提高15.5%、銨鹽氮進步52.9%、磷酸鹽進步11.8%、溶解氧增加13.8%。同時浮生物特別是浮游植物的數量和重量均有增加，且沒有魚病發作。此施肥辦法簡單，容易推行。 一、施量及辦法 發酵好的糞便是一種速緩兼備的有機肥，既可作魚塘基肥，又可作追肥。 1、發酵好的糞便作基肥。在未投放魚苗前，將其撒入塘中，依據運輸條件及魚塘肥力而定施量，普通每畝1000--1500公斤。 2、發酵好的糞便水肥作追肥。魚苗入塘後，從5月份即開端施肥，每10--15天施一次。發酵好的糞便每畝100--200公斤或發酵好的糞便水每畝300--400公斤，撒撥入池。有條件的中央可直接輸入。 3、依據塘水透明度施肥。普通五、六、九、十月，水透明度低於30釐米就施肥；七、八月高溫時節，水透明度20釐米時可施肥，堅持10釐米左右即可。 4、依據時節，天氣變化，靈敏控制施肥量。初春，晚秋的氣溫、水溫較低，魚生長慢，需食量不大，可少施；七、八、九月高溫時節，氣、水溫均高。魚生長快，需食量大，浮游生物繁衍快，養份耗費多，可勤施多施。 5、發酵好的肥料不只肥美水質，促進浮游生物生長，還能作吃食性魚類的餌料，因而可與精料拌和製成膨化顆料，直接餵養吃食性魚類。 二、注意事項 1、發酵好的糞便肥如起培肥水質的作用，魚塘宜放濾食性魚類，以白、花鰱為主，可佔投放量的70%左右。恰當搭配一些羅非魚，鯉鯽魚等雜食性魚類。 2、若將發酵好的糞便製成顆粒飼料再用糞便發酵劑噴溼料投入魚塘，宜放養吃食性魚類，以草、鯿魚為主，佔投入量50%左右，再搭配其它的魚類。 3、陰雨天水中浮游植物光協作用差，不易合成發酵好的糞便中的有效成份，普通應在晴天上午施肥，以免糜費勞力和肥料。 4、新出池的發酵糞便，要在外面堆放1--2天，以釋放掉對魚類生長有害的氣體。 5、如養魚場用發酵糞便養魚，池的設計要思索產氣效果和魚塘經常用肥的需求，以中層進料，底層半自動出料的發酵池為宜。