輔助功能字是用於指定主軸的旋轉方向、啟動、停止、冷卻液的開關，工件或刀具的夾緊和鬆開，刀具的更換等功能。輔助功能字由地址符M和其後的兩位數字組成。JB3208-1999標準中規定如下：.m00 程式停止 在完成程式段的其它指令後，用以停止主軸、冷卻液，並停止作進一步的處理。

M01 計劃停止 與程式停止相似，所不同的是，除非操作人員預先按電鈕確認這個指令，否則這個指令不起使用。

M02 程式停止 表示工件已完成的一個輔助指令。在完成了程式段的全部指令以後，用以停止主軸、冷卻液和進給。常用以使控制機和（或）機床復位，包括捲回紙帶，退回到“程式開始”字元，或使環形紙帶越過接頭。

M03 主軸順時針方向 開動主軸時，按右旋螺紋進入工件的方向旋轉。

M04 主軸逆時針方向 開動主軸時，按右旋螺紋離開工件的方向旋轉。

M05 主軸停止 一般情況下，主軸停止，也可採用制動器，關閉冷卻液。

M06 換刀 手動或自動換刀指令，不包括刀具選擇，也可以自動關閉冷卻液和主軸。

M07 2 號冷卻液開 2 號冷卻液（如霧狀）開。

M08 1 號冷卻液開 1 號冷卻液（如液體）開。

M09 冷卻液關 登出M07、M08、M50 和M51。

M10 和M11 卡緊和鬆開 適用於機床滑座、工件、夾具、主軸等。

M15 和M16 運動正向和運動負向 在需要時用以選擇快速移動的方向或進給的方向，也可應用於絕對測量系統的迴轉工作臺。

M19 主軸定向停止 該指令使主軸停止在預定的角度位置上。

M30 紙帶結束 在完成程式段的所有指令後，使主軸、進給和冷卻液停止。常用以使控制機和（或）機床復位，包括將紙帶捲回到“程式開始”字元，或使環形紙帶越過接頭，或轉換到第二臺輸入機。

M31 互鎖旁路 用以使正常的互鎖機構暫時失效的指令。

M36 和M37 進給範圍1 和進給範圍2 進給率範圍選擇。

M38 和M39 主軸速度範圍1 和主軸速度範圍2 主軸速度範圍選擇。

M48 登出M49。

M49 旁路進給率修正 使手動給定的主軸速度或進給率修正（已在程式說明中規定的）失去作用，並恢復到原來程式規定的引數。

M50 3 號冷卻液開。

M51 4 號冷卻液開。

M55 刀具直線位移，位置1 刀具直線移動到固定位置（如在刀具座標上的某預定位置）。

M56 刀具直線位移，位置2 刀具直線移動到固定位置（如在刀具座標上的某預定位置）。

M61 工件直線位移，位置1 工件直線移動到固定位置。

M62 工件直線位移，位置2 工件直線移動到固定位置。

M71 工件角度位移，位置1 工件角度位移到固定位置。

M72 工件角度位移，位置2 工件角度位移到固定位置。