腸道菌群形成一道免疫屏障，阻止致病菌入侵人體。要知道，腸道內壁，是人體和外部環境接觸面積最大的地區。而腸道菌群能夠黏附在腸道內壁的表面，形成一個保護層，來防止致病菌和腸道內壁直接接觸，進入人體。同時，腸道菌還能刺激人體在腸道形成更多的淋巴器官，增加免疫球蛋白在血漿和腸黏膜中的數量，來增加人體免疫力。

另外，我們不知道的是，腸道菌群還能調節腸道，為其提供營養。腸道菌群產生的短鏈脂肪酸，能刺激腸道上皮組織生長。另外，腸道菌群能使得腸黏膜更快地修復破損。

研究表明，腸道菌群和人體代謝疾病有重要關係。一般肥胖、糖尿病等代謝異常病人的腸道菌群是失衡的。主要原因就是腸道菌群失衡，造成脂多糖等毒素進入人體，被免疫細胞識別後，產生多種炎症因子，人體進入低炎症狀態，產生代謝異常。

腸道菌會影響我們的腸胃健康，腸道菌會影響我們的心情，腸道菌還會影響我們的視力？

科學家們的一項研究表明，有些腸道菌會影響我們的眼睛，觸發自身免疫性葡萄膜炎。我們人體腸道內有些特殊細菌生成的蛋白和眼部蛋白很相似。這種類似的蛋白可以在腸道啟動一些T細胞，這些T細胞被啟用後，就會跑到眼睛“搗亂”，引發自身免疫性葡萄膜炎。

由此看來，腸道菌群，是一個影響到人體各個方面的“器官”，它的健康、正常對整個人體健康有很大影響。

腸道菌群對人體健康的影響不僅僅限於消化道健康。

隨著近年分子生物學的發展，科學家們發現，很多疾病跟腸道健康相關。也慢慢建立了腸道中的某些菌群失衡和某種疾病的相關性，特別是對於肥胖和糖尿病，非酒精酒性脂肪肝的研究方面，取得了重大發展。

人類大腸中，有一半都是細菌，它們利用食物殘渣進行發酵，代謝出不同的產物，這些產物會影響腸道通透性，腸道通透性高時，包括內毒素在內的有害物質透過腸壁被大量吸收，會誘發系統炎症，使人們生病。而腸道通透性低時，腸壁作為一個屏障，阻斷這種轉運，降低系統炎症。而腸道中的菌群對腸道通透性起著至關重要的作用，腸道中的益生菌佔優時，腸道通透性低，而有害菌比例較高時，腸道通透性較高。