主要區別有，消毒原理不同、人體危害性不同、應用範圍不同，具體如下：

一、消毒原理不同

1、84消毒液

84消毒液一般透過氯氣（ Cl2）與氫氧化鈉（NaOH）反應制得，反應產物中的次氯酸鈉是消毒液的主要成分。 次氯酸鈉是一種強電解質，在水中首先電離生成次氯酸根離子（ClO-），次氯酸根離子水解生成次氯酸，進一步分解生成新生態氧[O]（氧原子直接構成的物質），其化學性質非常活潑，具有極強氧化力，在消毒過程中起了極大的作用。

2、二氧化氯消毒劑

二氧化氯對細胞壁有較好的吸附和透過效能，ClO2與微生物接觸釋放出新生態的氧及次氯酸分子而產生強大的殺菌消毒作用，這種強氧化作用主要表現對負電子或供電子的原子或基團（如氨基酸內含硫基的酶或硫化物、氮化物等）進行攻擊，強行掠奪電子使微生物中的氨基酸氧化分解，抑制其生長並將其殺滅，從而達到消毒滅菌的目的。

二、人體危害性不同

1、84消毒液

84消毒液有一定的健康危害，經常用手接觸本品的工人，手掌大量出汗，指甲變薄，毛髮脫落，有致敏作用。次氯酸鈉溶液放出的遊離氯有可能引起中毒。

2、二氧化氯消毒劑

二氧化氯消毒滅菌劑屬實際無毒級產品，積累性試驗結論為弱蓄積性物質。用其消毒的水體不會對口腔粘膜、皮膜和頭皮產生損傷，其在急性毒性和遺傳毒理學上都是絕對安全的。

三、應用範圍不同

1、84消毒液

廣泛用於賓館、旅遊、醫院、食品加工行業、家庭等的衛生消毒。

2、二氧化氯消毒劑

應用於各種場合下的生活、飲用、自來水的消毒，以及食品、飲料廠、發酵工業的裝置、管道、容器的最終滅菌消毒等。