原核細胞和真核細胞的根本區別：第一：原核細胞無核膜包被的細胞核，而真核生物具有核膜包被的細胞核。第二：這種區別裡也包含著共性，如儘管原核生物無核膜，但有擬核，兩者都有遺傳物質DNA。第三：是否有核膜包被的細胞核 包含著共性。許多細菌的最外表還覆蓋著一層多糖類物質，其中邊界明顯的稱為莢膜，如肺炎球菌，邊界不明顯的稱為粘液層(slime layer)，如葡萄球菌。莢膜對細菌的生存具有重要意義，細菌不僅可利用莢膜抵禦不良環境;保護自身不受白細胞吞噬;而且能有選擇地粘附到特定細胞的表面上，表現出對靶細胞的專一攻擊能力。例如，傷寒沙門桿菌能專一性地侵犯腸道淋巴組織。細菌莢膜的纖絲還能把細菌分泌的消化酶貯存起來，以備攻擊靶細胞之需。鞭毛是某些細菌的運動器官，由一種稱為鞭毛蛋白(flagellin)的彈性蛋白構成，結構上不同於真核生物的鞭毛。細菌可以透過調整鞭毛旋轉的方向(順時針和逆時針)來改變運動狀態。菌毛是菌體表面極其細的蛋白纖維，須用電鏡觀察，特點是:細、短、直、硬、多。菌毛與細菌運動無關，根據形態、結構和功能，可分為普通菌毛和性菌毛兩類。前者與細菌吸附和侵染宿主有關，後者為中空管子，與傳遞遺傳物質有關。擴充套件資料原核生物的基因結構多數以操縱子形式存在，即完成同類功能的多個基因聚集在一起，處於同一個啟動子的調控之下，下游同時具有一個終止子。兩個基因之間存在長度不等的間隔序列，如與乳糖代謝有關酶的基因。在距轉錄起始點-35和-10(轉錄起始點上游的核苷酸序列為"-"，下游的核苷酸序列為"+")附近的序列都有RNA聚合酶識別的訊號。RNA聚合酶先與-35附近的序列(稱為Pribnow框)結合，然後才與-10附近的序列(稱為Sextama框)結合。RNA聚合酶一旦與-10附近序列結合，就立即從識別位點上脫離下來，DNA雙鏈解開，轉錄開始。除啟動子外，往往還有一些調控轉錄的其他因子，如調節基因和操縱基因。原核生物基因轉錄終止之前同樣有一段迴文序列結構，稱為終止子，它的特殊的鹼基排列順序能夠阻礙RNA聚合酶的移動，並使其從DNA模板鏈上脫離下來。相比真核細胞，原核細胞也有編碼區與非編碼區，但無內含子，僅有外顯子。