應該說你的鴿子再注射疫苗之前就應該感染了沙門氏菌，因為母鴿子出現了又拉又吐的現象，並且是剛剛產蛋的母鴿子，說明你的鴿子在接種疫苗之初就有病菌的感染情況，我們知道注射疫苗需要至鴿子健康最佳的時候才可以進行，如果你的鴿子在生病時接種疫苗，很容易造成鴿子的感染加重，導致疫苗不能形成免疫力還會產生一定的毒副作用，所以你的剛下蛋的鴿子出現這種情況很可能和你接種疫苗有關。

在接種疫苗的時候一般鴿友們會選擇在種鴿分棚以後換羽結束進行，這時候的鴿子身體健康指數很高，並不會出現各種疾病，如果按照題主所說的接種了十三天前後十五天都在拉墨綠色糞便，可以說你的鴿子已經感染疾病非常嚴重了，這時候也會伴隨著鴿子大幅消瘦，縮毛懶飛食慾不振等等一些病情常見症狀。具體你的鴿子屬於那種疾病你需要把鴿子糞便送到專業檢測機構進行檢測，透過顯微鏡觀察分析是否屬於沙門氏菌感染還是新城疫感染，因為單憑一種簡單的描述很難辨別屬於哪種疾病，必須透過專業的機構去檢測才更科學，才能對症用藥。

如果我們根據鴿友的敘述，可以肯定你的這些鴿子透過接種疫苗之後造成了嚴重的影響，這種影響其實是透過疫苗這種毒株接種之後爆發的，總的來說你的這些鴿子在接種前肯定已經感染了新城疫或者沙門氏菌，之所以接種之後才爆發是因為疫苗本身就是一種病毒，只是這種病毒的計量比較小，所以在接種之後造成病毒的爆發，給你一個建議，如果你的鴿子出現了消瘦炸毛，綠便，精神萎靡，那麼我勸你不要在進行治療了，因為這些鴿子已經病情很嚴重，很難再治癒，即使勉強治癒在接下來的比賽中也很難勝任艱苦的賽事需要。