仙劍五前傳遊戲共有十章劇情，玩家將化身主角夏侯瑾軒踏上神魔紛爭。
仙劍五前傳劇情攻略
序章 遠潮初起
夏侯世家的公子夏侯瑾軒登場，溫文爾雅的表現得到下人的讚賞，卻也被可惜武術不精、沉迷於神仙志怪類。在明州城賣藝的瑕和謝滄行之間發生衝突，無意中砸掉了皇甫卓送給瑾軒價值連城的玉佩。回到家的瑾軒，見到了來通告折劍山莊品劍大會事宜的姜承和歐陽弟子，此時瑕和謝滄行拜訪夏侯世家堅持賠償。有自己打算的瑾軒，向夏侯門主也就是其父夏侯彰申請了步行前往折劍山莊參加品劍大會之事，瑕、姜承與謝滄行當護衛，在瑾軒二叔夏侯韜的勸解下夏侯彰同意了瑾軒的請求。當晚姜承與瑾軒敘舊之時卻遭遇了妖物的襲擊，在瑕與謝滄行的幫助下戰勝了妖物。
第一章 葳香凝碧 蒼茫嶺斷煙橫
離開夏侯世家，數日後來到了風景優美的凝翠甸。旅途勞累的一行人決定在岸邊休息，深夜裡卻受到了花妖的襲擊。打敗花妖后，姜承出現走火入魔之勢，幸好瑾軒教姜承順息平復。第二日到達碧溪村，在旅店裡與幾名小賊發生衝突，一名青衣女子出手幫助眾人。女子名叫暮菖蘭，在得知眾人情況後決定也做瑾軒的護衛。五人結伴穿過千峰嶺的過程中遭到了厲巖為首的魔族山賊的襲擊，最後厲巖接受了姜承的挑戰，勝負未分，但是姜承又出現了走火入魔之勢，由此厲巖發現了姜承自己都不知道的秘密，於是他放走了姜承一行人，五人得以安全到達折劍山莊。
第二章 梅淺雪疏 衣寒劍寞
瑾軒在山莊內看見了擺擂臺賺外快的瑕，賺到了錢的瑕邀請瑾軒一起去找暮菖蘭喝酒，路上卻把錢給丟了。找到折劍山莊門口，得知附近村民被雪石路的妖怪抓走。皇甫卓與姜承為了伸張正義前往營救，瑾軒三人也是義不容辭。在山腰瑾軒被吸取人魂魄加快修行的妖怪雪女迷惑，失去了知覺。瑕等人折回去尋找瑾軒的時候遇到了雪女，一番苦戰後終於打敗了她。瑾軒不忍心下手，卻被雪女暗算令瑕等人動彈不得，除了暮菖蘭以外。在菖蘭猶豫是否要逃開的時候，謝滄行暗中救下了他們。
回到折劍山莊，巧遇蜀山弟子凌音和鐵筆。鐵筆不知出於何種目的稱是自己救下了皇甫一行人。第二日，瑾軒父親和二叔到達折劍山莊，拜會過歐陽英和皇甫門主皇甫一鳴後，看望姜承並認識其好友唐風（唐海）。品劍大會當日，瑕與暮菖蘭也參與了比武，並得到獎勵。這時蕭長風提出要與姜承比試。姜承勝利後，蕭長風惱羞成怒，偷襲姜承，負傷的姜承再次出現走火入魔之勢，一拳打飛了蕭長風，自己也倒地不起。當晚，一身黑袍的枯木出現在姜承面前，告知他的蚩尤後人身份，而且會眾叛親離。暮菖蘭偷聽到了同門師兄弟打算對姜承不利的情報。而姜承也因重傷同門而被趕出折劍山莊。隔日，前途迷茫的姜承在折劍山莊外遇見了瑾軒等人，眾人決定四處旅遊陪姜承散心。
第三章 颯然西望遙峰 塞外訪孤城
步行了幾日後，眾人來到了深山密林（司雲崖）。到達山頂後，眾人看到了一方水壇，裡面竟然映有神州地圖。好奇的瑕觸摸了水壇中西域位置，突然整個水壇連同附近地面（雲來石）騰空飛起，不料空中遭到神龍的襲擊，好在有驚無險地降落在了Murano附近沙漠。在綠洲，遇見了龍溟和凌波。大家出於各自的目的，結伴前往Murano，卻發現Murano陷入了詛咒，所有人都只能進到Murano而無法離開。得知一切是Murano王的鬼魂搞鬼後，瑾軒等人決定去找這個鬼魂。夜晚找到Murano王后，與他大戰了一場。Murano王還附身到瑾軒身上。而Murano王所做的一切，令有著國家信仰的龍溟憤怒，最終將他徹底毀滅。
而此時在中原，蕭長風被枯木殺掉，並且在皇甫一鳴的安排下順利嫁禍給遠在Murano的姜承。龍溟與魔族長老魔翳的對話情形都被凌波悄悄看在眼中。瑕照顧被Murano王附身的瑾軒，兩人之間出現了青澀懵懂的感情。
第四章 漠上驚喧震 未料塵更
眾人打敗Murano王，解除了Murano的詛咒。姜承認出了龍溟的力量，與其私下交談後若有所思。
與龍溟、凌波二人告別後，打算跟隨商隊返回中原，路遇沙蟲，卻在沙蟲的不經意幫助下找到了雲來石。迫於無奈的眾人與興奮不已的瑾軒乘坐雲來石飛往皇甫家族所在的開封，可在路途中再遇神龍穹武，一番苦戰後，眾人終於明白了Murano城下雨的真相。
來到開封皇甫家，皇甫一鳴安排了陷阱準備捕捉姜承，利用姜承達到自己的目的。姜承在暮菖蘭的鼓動下決定逃亡，皇甫卓因為幫助姜承逃亡而被罰跪，卻仍然心繫姜承，讓瑾軒去調查姜承被陷害的真相。
回到明州的瑾軒被父親責罵了一番，最後二叔告訴其夏侯家族不能插手調查的原因。三人猜想姜承投靠了厲巖一群山賊，決定去將姜承找回來。在山賊營寨前遇到了來找厲巖的結蘿，幾句不和就大打出手。最終姜承出來相見，告知瑾軒自己已經做出了選擇，返回山寨。結蘿同樣被關在了山寨之外，心情不好的她丟下了一些奇怪的毒藥，三人暈倒，瑾軒醒來時發現已經在山下，然而，瑕卻沒有醒過來。
找到醫生，醫生讓瑾軒等人去為瑕準備後事。憤怒之下瑾軒決定親自去山寨找結蘿算賬，菖蘭阻止了瑾軒，告訴瑾軒好好陪著瑕，自己一人去山寨找結蘿。
第五章 折玉摧蘭 人間如寄 嘆飄蓬
暮菖蘭獨自來到山寨帶結蘿回碧溪村為瑕解毒，卻發現了瑕的奇怪的病症。求醫心切的瑾軒請結蘿帶路一起回苗疆尋找她的師傅為瑕治病，另有打算的結蘿答應了瑾軒等人的要求。於是，眾人和厲巖結蘿一起前往苗疆。
在黑苗族居住青木居的外面青木小徑中遇見了龍溟，龍溟聽到了結蘿關於神降密境的訊息後告別眾人獨自離開。來到青木居，結蘿的師傅看到瑕的症狀，覺得很奇特，並非人力所能治療，並且中原數年前也有人出現類似症狀，那人與蜀山有淵源，讓他們前往蜀山去找有“醫聖”之名的草穀道長詢問是否有治療方法。
正好因為姜承的事也需要前往蜀山，但考慮到姜承的身份，故將其與厲巖、結蘿留在了青木居。瑾軒一行人在蜀山在凌波的引見下見到了草谷，草谷看出是魔氣困擾，讓凌波帶瑾軒等人去仙竹林取仙藥材。
在仙竹林遇到了許久不見的謝滄行，在仙竹林取得藥之後，菖蘭想多取幾份藥材激怒了看守的仙靈，一番苦戰後打敗仙靈，憤怒的仙靈想收回本來賜給了瑕的仙藥，但是在一行人的苦苦要求（更多的應該是看在謝滄行的面子上）下只是趕走了眾人。
然而，仙藥並不能治好滿懷希望的瑕的病，在蜀山的御風臺上，瑾軒找到了失落的瑕，鼓勵她不要放棄。最後，瑕終於從失落中走出來，重新燃起了要活下去的信念，和瑾軒一起。
第六章 一局誰算誰爭 縱平生意氣
約好一起看星星的瑾軒和瑕，還有不知為何出現在御風臺的菖蘭發現璇光殿有入侵者。其實是龍溟欲闖璇光殿盜走神農鼎。凌波沒有阻止龍溟進入璇光殿，反而帶著瑾軒一行人一起進入了幻境，不得不與盜取神農鼎的龍溟聯手。龍溟被看守三神器的三神之力重創，凌波幫龍溟破除封印之時也受到了神力的反噬。破除結界後龍溟帶著神農鼎與凌波離開，留下瑾軒向蜀山的道長解釋一切。
瑾軒如實陳述了看到的一切，而另外一邊，龍溟和凌波來到凌波平素靜心時的流光洞，讓凌波在洞中等自己回來，自己身負重傷前往神降密境取水靈珠，並帶走了凌波的珠花。料到他會前往神降密境的瑾軒一群人再次來到青木居，取得避毒珠後與追趕龍溟。瑾軒因為弄丟了珠子險些喪命，卻因此拉近了與瑕的距離，和姜承的兄弟情義又更深了一步。
另一方面，身負重傷的龍溟遇見了看守水靈珠的骨蛇，險勝之後，卻為保護神農鼎硬接下了骨蛇拼死的一擊，深知傷重不治的龍溟，使出全身的力量將骨蛇釘於地面。垂危之際，枯木出現，龍溟交待完一切後閉上雙眼。此時瑾軒一行趕到，枯木此次顯得些許大意被眾人看見了。瑾軒等人沒有帶走龍溟留下的武器和凌波的信物，以尊重死者，只取走了要交還蜀山的神農鼎。
枯木在所有人離開後，取走了龍溟留下的力量，帶著力量來到流光洞，送給了還在等著龍溟歸來的凌波，最後，他凍潔了全部流光洞。流光洞的石床上，只留下微笑著離開的凌波。
第七章 難卻風生 枉念舊時
瑾軒一行人回到青木居，打算次日將神農鼎交還蜀山，順便解決姜承的身份的事情。當晚枯木與暮菖蘭見面。原來暮菖蘭一直受僱於一個神秘僱主要她將瑕與姜承的訊息交給他，但暮菖蘭並不知道此人即是枯木。暮菖蘭覺得此人很蹊蹺，想打探他的底細。之後枯木姜承見面，讓他妄想回到人類世界，只有魔族才是他的歸宿。他還告訴姜承四大世家借追殺他的名義濫殺妖魔，而且剛從千峰嶺回來，並給他一張蚩尤冢地圖。與枯木見面後姜承非常擔心山寨的兄弟們，決定和厲巖一起回山寨。瑾軒無奈，將姜承與厲巖送到千峰嶺後，前往蜀山歸還神農鼎，終於遇到了鐵筆，可知皇甫一鳴並非從鐵筆與凌音處得知姜承為魔族的事情。蜀山由於顧慮頗多，不便插手姜承之事，瑾軒指責蜀山道長後告辭而去。
瑾軒等人在碧溪村為山賊們購買了物資後，來到山寨卻發現山寨已經被人類血洗，制服了發狂的厲巖，提前趕到山寨的結蘿告訴眾人是皇甫世家的人做了這一切，並且抓走了剩餘的半魔山賊去了折劍山莊。厲巖姜承想去救人，瑾軒提出了進入山莊的計謀和策略。
重返折劍山莊，歐陽英為了家族的名譽，與姜承宣佈斷絕關係。面對四大世家瘋狂的追殺，回想起之前在折劍山莊和在山寨經歷的不同境遇，悲痛之下，姜承捨棄了自己的名字，改名姜世離。雖然形勢有變，但在瑾軒和皇甫卓，歐陽倩的暗中幫助下厲巖與姜世離逃離了折劍山莊，狼狽逃回青木居。
姜世離想起枯木告訴自己的蚩尤祭壇，決定前往尋找自己的身世。走投無路的厲巖決定和他一起去尋找剩下的同胞，結蘿的專一終於打動了這個完全不會笑的男子，螢火蟲飛舞的夜空，在星星點點的希望中兩人相依著睡去。
第八章 由來夢破難承
姜世離一行人找到蚩尤冢，解開了身上的所有謎，在看到覆天頂魔族的悲慘生活後決定接受魔君的稱號，為人間的魔族建立一片樂土。雖然不捨，想通了的瑾軒與姜世離來了一場好兄弟之間的對決後離開覆天頂。在等解藥的瑾軒等人決定陪菖蘭去她的故鄉看看。菖蘭有些遲疑，但最後還是接受了，同樣前往的還有不請自來的謝滄行。
第九章 雲海問仙蓬
菖蘭對瑾軒和瑕坦白了自己做的一切，得到了眾人的諒解。由於山神指出了瑕與村民的病因相同，幾人前去蜀山尋求草谷的指點，草谷終於明白了瑕的病因，表示需要一種傳說中的藥材（誓緣枝）才能製作出解藥，而這種藥材需要去海外仙島尋找。
由於不知道具體位置，無法乘坐雲來石前往，瑾軒回家向父親申請出航未果企圖私自出海，被抓個正著，最後父親同意了他這份無理的請求。在明州的碼頭，第一次瑾軒與瑕正視這份感情，此次航行，不知歸期何時。
航行半個月，遇到不明震盪，船毀，眾人漂流到一座神奇的島嶼（寒晶島），並且被那裡的冰麟長老授予了艱鉅的任務，而任務的獎勵就是他們此行的目的。完成了任務的眾人被獨善其身的仙靈們趕回了中原。
第十章 鶴影鳴歸月 醉嘯殘峰
被傳送到開封城外丹楓谷的一行人偶然聽到了有人打算對皇甫世家不利的訊息，與皇甫卓見面才知道自己在仙境待的這段時間，在中原已經5年過去了。得知姜世離一手創立的淨天教與武林公然為敵（唐風也加入了淨天教），四大家族均派人前往蜀山請求殲滅淨天教。一行人先於四大家族趕到蜀山把藥材交給草谷，煉藥需要一定時間，於是瑾軒決定前往拜訪姜世離問個究竟。
前往覆天頂，見到了模樣完全改變的厲巖，並且已改名血手，被姜世離拒絕見面後回到蜀山。仙藥煉製完成，瑕的病被治好了，並且為菖蘭準備了拯救村子的仙藥。一行人迫不及待趕回暮靄村，暮靄村與小黑終於得到了解脫。
在蜀山等四大家族到達的時候，淨天教圍攻四大家族，實際是想解開鎖妖塔封印的行動開始了。謝滄行揹負蜀山守護封印的大任，在鎖妖塔與姜世離展開大戰，最終兵解，重傷了枯木，並且化解了此次危機。
雖然姜世離最後念及故人之情離開了蜀山，然而他與瑾軒等人的情義也到此為止。
終章 忽道參商剎那 自是有相逢
淨天教進攻鎖妖塔行動失敗，返回淨天教總壇，四大家族也返攻上山。當枯木與龍幽交談之時被唐風發現，刺殺了枯木結果被淨天教眾人發現，最後被姜世離關押在地牢中。
此時枯木已經覺得那具身體即將隕滅，而瑕的到來令他產生奪瑕的身體作為傀儡的念頭。當碰見夏侯彰時，枯木現出身份——夏侯韜，然而枯木沒有留情，殺了夏侯彰與其隨從。之後，瑾軒趕到，發現枯木與二叔竟是同一人。枯木解釋瑕與夏侯韜是他附身的人選，他們只是他在人界的宿體。本身瑕在十六年前的大地動裡已經死去，因為附魂玉在瑕體內才能使瑕存活。當眾人打敗枯木之後，枯木施展招數假攻夏侯瑾軒，瑕為了保護夏侯瑾軒而喪命。枯木被暮菖蘭刺中倒下，魂魄飛離。
三人隨後來到司雲崖準備安葬瑕，誰知枯木魂魄忽然附身到瑕的身體，刺傷瑾軒與暮菖蘭。瑾軒因瑕之前所贈之玉擋住而保住性命，暮菖蘭卻因此重傷。瑾軒只能孤身一人去找被枯木附身的瑕，並承諾暮菖蘭無論生死一定會將瑕帶回來，隨後找到了枯木。枯木向瑾軒道出了他策劃的整個陰謀，瑾軒與其交戰。最終瑕魂魄還有一絲殘存使枯木不能施展法術，為了人間的安寧，瑾軒不得已痛苦的用瑕的劍刺向了瑕的身體，瑕的魂魄最終甦醒過來，用自己最後的力氣將瑾軒推開致使他不落入懸崖，掉下了山崖。瑾軒落地後，看到瑕落下去後立馬跳下山崖，拼命地想抓住瑕的手。隨後暮菖蘭趕到，崖上卻只見一隻破碎的毛筆，再不見夏侯瑾軒和瑕。
續：之後數月，淨天教被四大家族和蜀山派圍攻失陷，姜世離被封印，血手將神農鼎送往魔界隨後被青石、玉書打敗。唐風將其女唐雨柔交付給草谷醫治。夏侯家因兩位門主的去世與少主失蹤最後由遠房接管逐漸敗落。而皇甫卓成為皇甫門主並扶持歐陽家。歐陽倩隱居蒼木山，為其子取名姜雲凡。暮菖蘭一直在等夏侯瑾軒與瑕的歸來。當暮菖蘭再次來到司雲崖來看望他們的時候，突然聽到背後有匆匆的腳步聲，難道是……【終】
仙劍五前傳遊戲共有十章劇情，玩家將化身主角夏侯瑾軒踏上神魔紛爭。
仙劍五前傳劇情攻略
序章 遠潮初起
夏侯世家的公子夏侯瑾軒登場，溫文爾雅的表現得到下人的讚賞，卻也被可惜武術不精、沉迷於神仙志怪類。在明州城賣藝的瑕和謝滄行之間發生衝突，無意中砸掉了皇甫卓送給瑾軒價值連城的玉佩。回到家的瑾軒，見到了來通告折劍山莊品劍大會事宜的姜承和歐陽弟子，此時瑕和謝滄行拜訪夏侯世家堅持賠償。有自己打算的瑾軒，向夏侯門主也就是其父夏侯彰申請了步行前往折劍山莊參加品劍大會之事，瑕、姜承與謝滄行當護衛，在瑾軒二叔夏侯韜的勸解下夏侯彰同意了瑾軒的請求。當晚姜承與瑾軒敘舊之時卻遭遇了妖物的襲擊，在瑕與謝滄行的幫助下戰勝了妖物。
第一章 葳香凝碧 蒼茫嶺斷煙橫
離開夏侯世家，數日後來到了風景優美的凝翠甸。旅途勞累的一行人決定在岸邊休息，深夜裡卻受到了花妖的襲擊。打敗花妖后，姜承出現走火入魔之勢，幸好瑾軒教姜承順息平復。第二日到達碧溪村，在旅店裡與幾名小賊發生衝突，一名青衣女子出手幫助眾人。女子名叫暮菖蘭，在得知眾人情況後決定也做瑾軒的護衛。五人結伴穿過千峰嶺的過程中遭到了厲巖為首的魔族山賊的襲擊，最後厲巖接受了姜承的挑戰，勝負未分，但是姜承又出現了走火入魔之勢，由此厲巖發現了姜承自己都不知道的秘密，於是他放走了姜承一行人，五人得以安全到達折劍山莊。
第二章 梅淺雪疏 衣寒劍寞
瑾軒在山莊內看見了擺擂臺賺外快的瑕，賺到了錢的瑕邀請瑾軒一起去找暮菖蘭喝酒，路上卻把錢給丟了。找到折劍山莊門口，得知附近村民被雪石路的妖怪抓走。皇甫卓與姜承為了伸張正義前往營救，瑾軒三人也是義不容辭。在山腰瑾軒被吸取人魂魄加快修行的妖怪雪女迷惑，失去了知覺。瑕等人折回去尋找瑾軒的時候遇到了雪女，一番苦戰後終於打敗了她。瑾軒不忍心下手，卻被雪女暗算令瑕等人動彈不得，除了暮菖蘭以外。在菖蘭猶豫是否要逃開的時候，謝滄行暗中救下了他們。
回到折劍山莊，巧遇蜀山弟子凌音和鐵筆。鐵筆不知出於何種目的稱是自己救下了皇甫一行人。第二日，瑾軒父親和二叔到達折劍山莊，拜會過歐陽英和皇甫門主皇甫一鳴後，看望姜承並認識其好友唐風（唐海）。品劍大會當日，瑕與暮菖蘭也參與了比武，並得到獎勵。這時蕭長風提出要與姜承比試。姜承勝利後，蕭長風惱羞成怒，偷襲姜承，負傷的姜承再次出現走火入魔之勢，一拳打飛了蕭長風，自己也倒地不起。當晚，一身黑袍的枯木出現在姜承面前，告知他的蚩尤後人身份，而且會眾叛親離。暮菖蘭偷聽到了同門師兄弟打算對姜承不利的情報。而姜承也因重傷同門而被趕出折劍山莊。隔日，前途迷茫的姜承在折劍山莊外遇見了瑾軒等人，眾人決定四處旅遊陪姜承散心。
第三章 颯然西望遙峰 塞外訪孤城
步行了幾日後，眾人來到了深山密林（司雲崖）。到達山頂後，眾人看到了一方水壇，裡面竟然映有神州地圖。好奇的瑕觸摸了水壇中西域位置，突然整個水壇連同附近地面（雲來石）騰空飛起，不料空中遭到神龍的襲擊，好在有驚無險地降落在了Murano附近沙漠。在綠洲，遇見了龍溟和凌波。大家出於各自的目的，結伴前往Murano，卻發現Murano陷入了詛咒，所有人都只能進到Murano而無法離開。得知一切是Murano王的鬼魂搞鬼後，瑾軒等人決定去找這個鬼魂。夜晚找到Murano王后，與他大戰了一場。Murano王還附身到瑾軒身上。而Murano王所做的一切，令有著國家信仰的龍溟憤怒，最終將他徹底毀滅。
而此時在中原，蕭長風被枯木殺掉，並且在皇甫一鳴的安排下順利嫁禍給遠在Murano的姜承。龍溟與魔族長老魔翳的對話情形都被凌波悄悄看在眼中。瑕照顧被Murano王附身的瑾軒，兩人之間出現了青澀懵懂的感情。
第四章 漠上驚喧震 未料塵更
眾人打敗Murano王，解除了Murano的詛咒。姜承認出了龍溟的力量，與其私下交談後若有所思。
與龍溟、凌波二人告別後，打算跟隨商隊返回中原，路遇沙蟲，卻在沙蟲的不經意幫助下找到了雲來石。迫於無奈的眾人與興奮不已的瑾軒乘坐雲來石飛往皇甫家族所在的開封，可在路途中再遇神龍穹武，一番苦戰後，眾人終於明白了Murano城下雨的真相。
來到開封皇甫家，皇甫一鳴安排了陷阱準備捕捉姜承，利用姜承達到自己的目的。姜承在暮菖蘭的鼓動下決定逃亡，皇甫卓因為幫助姜承逃亡而被罰跪，卻仍然心繫姜承，讓瑾軒去調查姜承被陷害的真相。
回到明州的瑾軒被父親責罵了一番，最後二叔告訴其夏侯家族不能插手調查的原因。三人猜想姜承投靠了厲巖一群山賊，決定去將姜承找回來。在山賊營寨前遇到了來找厲巖的結蘿，幾句不和就大打出手。最終姜承出來相見，告知瑾軒自己已經做出了選擇，返回山寨。結蘿同樣被關在了山寨之外，心情不好的她丟下了一些奇怪的毒藥，三人暈倒，瑾軒醒來時發現已經在山下，然而，瑕卻沒有醒過來。
找到醫生，醫生讓瑾軒等人去為瑕準備後事。憤怒之下瑾軒決定親自去山寨找結蘿算賬，菖蘭阻止了瑾軒，告訴瑾軒好好陪著瑕，自己一人去山寨找結蘿。
第五章 折玉摧蘭 人間如寄 嘆飄蓬
暮菖蘭獨自來到山寨帶結蘿回碧溪村為瑕解毒，卻發現了瑕的奇怪的病症。求醫心切的瑾軒請結蘿帶路一起回苗疆尋找她的師傅為瑕治病，另有打算的結蘿答應了瑾軒等人的要求。於是，眾人和厲巖結蘿一起前往苗疆。
在黑苗族居住青木居的外面青木小徑中遇見了龍溟，龍溟聽到了結蘿關於神降密境的訊息後告別眾人獨自離開。來到青木居，結蘿的師傅看到瑕的症狀，覺得很奇特，並非人力所能治療，並且中原數年前也有人出現類似症狀，那人與蜀山有淵源，讓他們前往蜀山去找有“醫聖”之名的草穀道長詢問是否有治療方法。
正好因為姜承的事也需要前往蜀山，但考慮到姜承的身份，故將其與厲巖、結蘿留在了青木居。瑾軒一行人在蜀山在凌波的引見下見到了草谷，草谷看出是魔氣困擾，讓凌波帶瑾軒等人去仙竹林取仙藥材。
在仙竹林遇到了許久不見的謝滄行，在仙竹林取得藥之後，菖蘭想多取幾份藥材激怒了看守的仙靈，一番苦戰後打敗仙靈，憤怒的仙靈想收回本來賜給了瑕的仙藥，但是在一行人的苦苦要求（更多的應該是看在謝滄行的面子上）下只是趕走了眾人。
然而，仙藥並不能治好滿懷希望的瑕的病，在蜀山的御風臺上，瑾軒找到了失落的瑕，鼓勵她不要放棄。最後，瑕終於從失落中走出來，重新燃起了要活下去的信念，和瑾軒一起。
第六章 一局誰算誰爭 縱平生意氣
約好一起看星星的瑾軒和瑕，還有不知為何出現在御風臺的菖蘭發現璇光殿有入侵者。其實是龍溟欲闖璇光殿盜走神農鼎。凌波沒有阻止龍溟進入璇光殿，反而帶著瑾軒一行人一起進入了幻境，不得不與盜取神農鼎的龍溟聯手。龍溟被看守三神器的三神之力重創，凌波幫龍溟破除封印之時也受到了神力的反噬。破除結界後龍溟帶著神農鼎與凌波離開，留下瑾軒向蜀山的道長解釋一切。
瑾軒如實陳述了看到的一切，而另外一邊，龍溟和凌波來到凌波平素靜心時的流光洞，讓凌波在洞中等自己回來，自己身負重傷前往神降密境取水靈珠，並帶走了凌波的珠花。料到他會前往神降密境的瑾軒一群人再次來到青木居，取得避毒珠後與追趕龍溟。瑾軒因為弄丟了珠子險些喪命，卻因此拉近了與瑕的距離，和姜承的兄弟情義又更深了一步。
另一方面，身負重傷的龍溟遇見了看守水靈珠的骨蛇，險勝之後，卻為保護神農鼎硬接下了骨蛇拼死的一擊，深知傷重不治的龍溟，使出全身的力量將骨蛇釘於地面。垂危之際，枯木出現，龍溟交待完一切後閉上雙眼。此時瑾軒一行趕到，枯木此次顯得些許大意被眾人看見了。瑾軒等人沒有帶走龍溟留下的武器和凌波的信物，以尊重死者，只取走了要交還蜀山的神農鼎。
枯木在所有人離開後，取走了龍溟留下的力量，帶著力量來到流光洞，送給了還在等著龍溟歸來的凌波，最後，他凍潔了全部流光洞。流光洞的石床上，只留下微笑著離開的凌波。
第七章 難卻風生 枉念舊時
瑾軒一行人回到青木居，打算次日將神農鼎交還蜀山，順便解決姜承的身份的事情。當晚枯木與暮菖蘭見面。原來暮菖蘭一直受僱於一個神秘僱主要她將瑕與姜承的訊息交給他，但暮菖蘭並不知道此人即是枯木。暮菖蘭覺得此人很蹊蹺，想打探他的底細。之後枯木姜承見面，讓他妄想回到人類世界，只有魔族才是他的歸宿。他還告訴姜承四大世家借追殺他的名義濫殺妖魔，而且剛從千峰嶺回來，並給他一張蚩尤冢地圖。與枯木見面後姜承非常擔心山寨的兄弟們，決定和厲巖一起回山寨。瑾軒無奈，將姜承與厲巖送到千峰嶺後，前往蜀山歸還神農鼎，終於遇到了鐵筆，可知皇甫一鳴並非從鐵筆與凌音處得知姜承為魔族的事情。蜀山由於顧慮頗多，不便插手姜承之事，瑾軒指責蜀山道長後告辭而去。
瑾軒等人在碧溪村為山賊們購買了物資後，來到山寨卻發現山寨已經被人類血洗，制服了發狂的厲巖，提前趕到山寨的結蘿告訴眾人是皇甫世家的人做了這一切，並且抓走了剩餘的半魔山賊去了折劍山莊。厲巖姜承想去救人，瑾軒提出了進入山莊的計謀和策略。
重返折劍山莊，歐陽英為了家族的名譽，與姜承宣佈斷絕關係。面對四大世家瘋狂的追殺，回想起之前在折劍山莊和在山寨經歷的不同境遇，悲痛之下，姜承捨棄了自己的名字，改名姜世離。雖然形勢有變，但在瑾軒和皇甫卓，歐陽倩的暗中幫助下厲巖與姜世離逃離了折劍山莊，狼狽逃回青木居。
姜世離想起枯木告訴自己的蚩尤祭壇，決定前往尋找自己的身世。走投無路的厲巖決定和他一起去尋找剩下的同胞，結蘿的專一終於打動了這個完全不會笑的男子，螢火蟲飛舞的夜空，在星星點點的希望中兩人相依著睡去。
第八章 由來夢破難承
姜世離一行人找到蚩尤冢，解開了身上的所有謎，在看到覆天頂魔族的悲慘生活後決定接受魔君的稱號，為人間的魔族建立一片樂土。雖然不捨，想通了的瑾軒與姜世離來了一場好兄弟之間的對決後離開覆天頂。在等解藥的瑾軒等人決定陪菖蘭去她的故鄉看看。菖蘭有些遲疑，但最後還是接受了，同樣前往的還有不請自來的謝滄行。
第九章 雲海問仙蓬
菖蘭對瑾軒和瑕坦白了自己做的一切，得到了眾人的諒解。由於山神指出了瑕與村民的病因相同，幾人前去蜀山尋求草谷的指點，草谷終於明白了瑕的病因，表示需要一種傳說中的藥材（誓緣枝）才能製作出解藥，而這種藥材需要去海外仙島尋找。
由於不知道具體位置，無法乘坐雲來石前往，瑾軒回家向父親申請出航未果企圖私自出海，被抓個正著，最後父親同意了他這份無理的請求。在明州的碼頭，第一次瑾軒與瑕正視這份感情，此次航行，不知歸期何時。
航行半個月，遇到不明震盪，船毀，眾人漂流到一座神奇的島嶼（寒晶島），並且被那裡的冰麟長老授予了艱鉅的任務，而任務的獎勵就是他們此行的目的。完成了任務的眾人被獨善其身的仙靈們趕回了中原。
第十章 鶴影鳴歸月 醉嘯殘峰
被傳送到開封城外丹楓谷的一行人偶然聽到了有人打算對皇甫世家不利的訊息，與皇甫卓見面才知道自己在仙境待的這段時間，在中原已經5年過去了。得知姜世離一手創立的淨天教與武林公然為敵（唐風也加入了淨天教），四大家族均派人前往蜀山請求殲滅淨天教。一行人先於四大家族趕到蜀山把藥材交給草谷，煉藥需要一定時間，於是瑾軒決定前往拜訪姜世離問個究竟。
前往覆天頂，見到了模樣完全改變的厲巖，並且已改名血手，被姜世離拒絕見面後回到蜀山。仙藥煉製完成，瑕的病被治好了，並且為菖蘭準備了拯救村子的仙藥。一行人迫不及待趕回暮靄村，暮靄村與小黑終於得到了解脫。
在蜀山等四大家族到達的時候，淨天教圍攻四大家族，實際是想解開鎖妖塔封印的行動開始了。謝滄行揹負蜀山守護封印的大任，在鎖妖塔與姜世離展開大戰，最終兵解，重傷了枯木，並且化解了此次危機。
雖然姜世離最後念及故人之情離開了蜀山，然而他與瑾軒等人的情義也到此為止。
終章 忽道參商剎那 自是有相逢
淨天教進攻鎖妖塔行動失敗，返回淨天教總壇，四大家族也返攻上山。當枯木與龍幽交談之時被唐風發現，刺殺了枯木結果被淨天教眾人發現，最後被姜世離關押在地牢中。
此時枯木已經覺得那具身體即將隕滅，而瑕的到來令他產生奪瑕的身體作為傀儡的念頭。當碰見夏侯彰時，枯木現出身份——夏侯韜，然而枯木沒有留情，殺了夏侯彰與其隨從。之後，瑾軒趕到，發現枯木與二叔竟是同一人。枯木解釋瑕與夏侯韜是他附身的人選，他們只是他在人界的宿體。本身瑕在十六年前的大地動裡已經死去，因為附魂玉在瑕體內才能使瑕存活。當眾人打敗枯木之後，枯木施展招數假攻夏侯瑾軒，瑕為了保護夏侯瑾軒而喪命。枯木被暮菖蘭刺中倒下，魂魄飛離。
三人隨後來到司雲崖準備安葬瑕，誰知枯木魂魄忽然附身到瑕的身體，刺傷瑾軒與暮菖蘭。瑾軒因瑕之前所贈之玉擋住而保住性命，暮菖蘭卻因此重傷。瑾軒只能孤身一人去找被枯木附身的瑕，並承諾暮菖蘭無論生死一定會將瑕帶回來，隨後找到了枯木。枯木向瑾軒道出了他策劃的整個陰謀，瑾軒與其交戰。最終瑕魂魄還有一絲殘存使枯木不能施展法術，為了人間的安寧，瑾軒不得已痛苦的用瑕的劍刺向了瑕的身體，瑕的魂魄最終甦醒過來，用自己最後的力氣將瑾軒推開致使他不落入懸崖，掉下了山崖。瑾軒落地後，看到瑕落下去後立馬跳下山崖，拼命地想抓住瑕的手。隨後暮菖蘭趕到，崖上卻只見一隻破碎的毛筆，再不見夏侯瑾軒和瑕。
續：之後數月，淨天教被四大家族和蜀山派圍攻失陷，姜世離被封印，血手將神農鼎送往魔界隨後被青石、玉書打敗。唐風將其女唐雨柔交付給草谷醫治。夏侯家因兩位門主的去世與少主失蹤最後由遠房接管逐漸敗落。而皇甫卓成為皇甫門主並扶持歐陽家。歐陽倩隱居蒼木山，為其子取名姜雲凡。暮菖蘭一直在等夏侯瑾軒與瑕的歸來。當暮菖蘭再次來到司雲崖來看望他們的時候，突然聽到背後有匆匆的腳步聲，難道是……【終】