CD-R光碟可以刻錄的格式目前有6種。
1. ISO-9660 ：簡稱ISO ，是由國際標準化組織在1985年制定的 ，目前唯一通用的光碟檔案系統 ，任何型別的計算機和所有的燒錄軟體都支援它 。如果想讓所有的CD-ROM 光碟機都能讀取燒錄好的光碟 ，就必須使用 ISO-9660 或與其相容的檔案系統 。
2. Rock Ridge ：針對 UNIX系統的 ISO-9660檔案系統 ，支援檔名字母大小寫、符號字元以及長檔名 。由於相容 ISO -9660， 所以即使作業系統不支援 Rock Ridge， 也可以透過ISO-9660 檢視。
3. HFS：全稱為混合檔案系統 (Hybrid File System)，是蘋果公司 (Apple)的MAC機所使用的光碟檔案系統 ，不支援 DOS、Windows 9x/NT等其他作業系統 。
4. Joliet ：微軟公司自定義的光碟檔案系統 ，也是 ISO-9660 的一種擴充套件 ，支援Windows 9x/NT 和DOS，在Windows 9x/ NT下檔名可顯示 64個字元 ，並可使用中文。
5. UDF：UDF 是統一光碟格式 (Universal Disc Format)的英文縮寫 ，由國際標準化組織於1996 年制定的通用光碟檔案系統 。它採用標準的包燒錄技術 (PW ，Packet Writing)來簡化燒錄機的使用。UDF檔案系統使使用者可以如同操作硬碟那樣來使用CD- RW燒錄機。
6. Overburn ：支援燒錄超過標準的 640MB碟片 ，最高可達 1GB，但刻錄的碟片相容性較差。
CD-R光碟可以刻錄的格式目前有6種。
1. ISO-9660 ：簡稱ISO ，是由國際標準化組織在1985年制定的 ，目前唯一通用的光碟檔案系統 ，任何型別的計算機和所有的燒錄軟體都支援它 。如果想讓所有的CD-ROM 光碟機都能讀取燒錄好的光碟 ，就必須使用 ISO-9660 或與其相容的檔案系統 。
2. Rock Ridge ：針對 UNIX系統的 ISO-9660檔案系統 ，支援檔名字母大小寫、符號字元以及長檔名 。由於相容 ISO -9660， 所以即使作業系統不支援 Rock Ridge， 也可以透過ISO-9660 檢視。
3. HFS：全稱為混合檔案系統 (Hybrid File System)，是蘋果公司 (Apple)的MAC機所使用的光碟檔案系統 ，不支援 DOS、Windows 9x/NT等其他作業系統 。
4. Joliet ：微軟公司自定義的光碟檔案系統 ，也是 ISO-9660 的一種擴充套件 ，支援Windows 9x/NT 和DOS，在Windows 9x/ NT下檔名可顯示 64個字元 ，並可使用中文。
5. UDF：UDF 是統一光碟格式 (Universal Disc Format)的英文縮寫 ，由國際標準化組織於1996 年制定的通用光碟檔案系統 。它採用標準的包燒錄技術 (PW ，Packet Writing)來簡化燒錄機的使用。UDF檔案系統使使用者可以如同操作硬碟那樣來使用CD- RW燒錄機。
6. Overburn ：支援燒錄超過標準的 640MB碟片 ，最高可達 1GB，但刻錄的碟片相容性較差。