鹼基互補配對原則在DNA或某些雙鏈RNA分子結構中，由於鹼基之間的氫鍵具有固定的數目和DNA兩條鏈之間的距離保持不變，使得鹼基配對必須遵循一定的規律，這就是Adenine（A，腺嘌呤）一定與Thymine（T，胸腺嘧啶），在RNA中與Uracil（U，尿嘧啶）配對，Guanine（G，鳥嘌呤）一定與Cytosine（C，胞嘧啶）配對，反之亦然。鹼基間的這種一一對應的關係叫做鹼基互補配對原則。其規律是：規律一：在一個雙鏈DNA分子中，A=T、G=C。即：A+G=T+C或A+C=T+G。也就是說，嘌呤鹼基總數等於嘧啶鹼基總數，各佔全部鹼基總數的50%。規律二：在雙鏈DNA分子中，兩個互補配對的鹼基之和的比值與該DNA分子中每一單鏈中這一比值相等。（A1+A2+T1+T2）/(G1+G2+C1+C2）=(A1+T1）/(G1+C1）=(A2+T2）/(G2+C2）規律三：DNA分子一條鏈中，兩個不互補配對的鹼基之和的比值等於另一互補鏈中這一比值的倒數，即DNA分子一條鏈中 的比值等於其互補鏈中這一比值的倒數。（A1+G1）/(T1+C1）=(T2+C2）/(A2+G2）規律四：在雙鏈DNA分子中，互補的兩個鹼基和佔全部鹼基的比值等於其中任何一條單鏈佔該鹼基比例的比值，且等於其轉錄形成的mRNA中該種比例的比值。即雙鏈（A+T)%或（G+C)%=任意單鏈 (A+T)%或（G+C)%=mRNA中 (A+U)%或（G+C)%。規律五：不同生物的DNA分子中，其互補配對的鹼基之和的比值（A+T)/(G+C）不同，代表了每種生物DNA分子的特異性。
鹼基互補配對原則在DNA或某些雙鏈RNA分子結構中，由於鹼基之間的氫鍵具有固定的數目和DNA兩條鏈之間的距離保持不變，使得鹼基配對必須遵循一定的規律，這就是Adenine（A，腺嘌呤）一定與Thymine（T，胸腺嘧啶），在RNA中與Uracil（U，尿嘧啶）配對，Guanine（G，鳥嘌呤）一定與Cytosine（C，胞嘧啶）配對，反之亦然。鹼基間的這種一一對應的關係叫做鹼基互補配對原則。其規律是：規律一：在一個雙鏈DNA分子中，A=T、G=C。即：A+G=T+C或A+C=T+G。也就是說，嘌呤鹼基總數等於嘧啶鹼基總數，各佔全部鹼基總數的50%。規律二：在雙鏈DNA分子中，兩個互補配對的鹼基之和的比值與該DNA分子中每一單鏈中這一比值相等。（A1+A2+T1+T2）/(G1+G2+C1+C2）=(A1+T1）/(G1+C1）=(A2+T2）/(G2+C2）規律三：DNA分子一條鏈中，兩個不互補配對的鹼基之和的比值等於另一互補鏈中這一比值的倒數，即DNA分子一條鏈中 的比值等於其互補鏈中這一比值的倒數。（A1+G1）/(T1+C1）=(T2+C2）/(A2+G2）規律四：在雙鏈DNA分子中，互補的兩個鹼基和佔全部鹼基的比值等於其中任何一條單鏈佔該鹼基比例的比值，且等於其轉錄形成的mRNA中該種比例的比值。即雙鏈（A+T)%或（G+C)%=任意單鏈 (A+T)%或（G+C)%=mRNA中 (A+U)%或（G+C)%。規律五：不同生物的DNA分子中，其互補配對的鹼基之和的比值（A+T)/(G+C）不同，代表了每種生物DNA分子的特異性。