根據動物區系成分的系統發生和歷史的共通性，將世界陸地動物區系劃分為六個區：全北區、東洋區、熱帶區、新熱帶區、澳洲區和南極區。
全北區 佔有北半球的大部分，包括從歐亞大陸北緣到撒哈拉和喜馬拉雅山以及從北美洲大陸至墨西哥索諾拉州。該動物區系的歷史，大體上反映了冰期氣候變化的影響。當更新世最大冰期時，由於海平面下降，白令海峽間有陸橋相連，冰川前被迫南遷的動物區系完全混雜，第三紀時新舊大陸北部兩地動物區系的差異最後消失，形成一個統一的動物區系。如哺乳類的鼴科、蝟科、鼠兔科、河狸科，鳥類的潛鳥科、松雞科、太平鳥科、攀雀科、鴁科、施木雀科，兩棲類的洞源科、蠑螈科等都是典型的兩地共有動物。冰川退卻後，由於陸橋消失，兩地失去了連線，新露出的區域被重新移居，歐亞大陸北部與北美洲兩地間動物區系的差異便發展起來，產生了屬、種的分化。有人將全北區劃分為古北區和新北區。
（古北區 包括歐洲、北迴歸線以北的非洲與阿拉伯半島中、北部以及喜馬拉雅與秦嶺山脈以北的亞洲大陸。哺乳動物月鼠科、跳鼠科、睡鼠科、鼴形鼠科等為古北區所特有，鳥類巖鷚科及兩棲類小鯢科主要分佈於古北區。本區還有一些特有的屬，例如鼴鼠、金絲猴、貉、獾、駱駝、獐、狍及山鶉、鴇、沙雞、百靈、地鴉、巖鷚、沙雀等。
新北區 包括墨西哥北部及其以北的北美洲。哺乳類叉角羚科、山河狸科，爬行類北美蛇蜥科，兩棲類鰻螈科、兩棲鯢科，魚類弓鰭魚科、雀鱔科等為本區所特有。特有的屬有美洲麝牛、美洲河狸、美洲獾、美洲松鼠、豹鼠、蹼足鼴、野吐綬雞等。）
東洋區 又稱印度馬來亞區，包括印度、中南半島、菲律賓和中國南部。本區與熱帶區有許多共同之處，在第三紀時均為熱帶雨林，棲居著一些世界性的熱帶種類。如鱷科、鸚鵡科、日鷉科、蟒蛇科、壁虎科和蚓螈科等。更新世氣候惡化，喜暖的古北區森林動物南遷進入本區和熱帶區，如類人猿、猴類、象、犀、牛、豬、靈貓和犀鳥、鴨、太陽鳥等類群。由於陸地的分離，兩區共有的類群產生一些分化，發展了各自的特有屬，如長臂猿、猩猩、亞洲象、東方靈貓等。本區特有的類群哺乳類有樹鼩科、刺山鼠科、眼鏡猴科、大熊貓、小熊貓，鳥類有和平鳥科、冠Swift科，爬行類有平胸龜科、異盾蛇科、鱷蜥科、擬毒蜥科、食魚鱷科。本區分為印度、中南半島、南中國—喜馬拉雅三個亞區。動物區系的明顯差異表現在種的水平上。
熱帶區 又稱衣索比亞區，包括撒哈拉以南的非洲大陸及馬拉加西島等地。更新世氣候惡化，古北區喜暖動物南遷進入東洋區和熱帶區，但沒有鼴鼠、鹿和熊。本區分化出來的特有屬有黑猩猩、大猩猩、疣猴、狒狒、非洲黑犀、非洲象等。特有的類群有蹄兔目、管齒目、金毛鼴科、象鼩科、土豚科、河馬科、長頸鹿科、珠雞科、鷺鷹科鴕鳥科和非洲肺魚科等。其中長頸鹿科並不起源於非洲，原產歐洲、印度和中國等地，今在其起源地已經滅絕，而保留在非洲併成為特有動物。本區有一些古區系成分，如蚓蜥、蚓螈、鱺魚和淡水貽貝等在古北區從未發現過它們的化石，但卻見於南美洲（新熱帶區），證明非洲大陸曾是古生代岡瓦納大陸的一部分。馬拉加西島動物區系具有顯著的獨特性，幾乎所有熱帶區哺乳動物在這裡都不存在，僅有非洲河豬是晚近時期從非洲大陸遷來的。作為該島的特有類群有狐猴科、大狐猴科、指猴科、馬島蝟科和擬鶉科、裸眉鶇科、鵑鴗科等。
新熱帶區 包括整個中美洲和南美洲大陸、墨西哥南部及西印度群島。是世界最具特色的動物區系。在漫長的地質時期，南美洲曾是一個孤島，發展了許多特有類群，且與其他區域聯絡較少。本區古老成分的代表是貧齒類和有袋類中的原始哺乳動物。有袋類有新袋鼠科和負鼠科，貧齒類有三個現存的科：樹獺科、犰狳科和食蟻獸科。齧齒類特殊的科有美洲豪豬科、豚鼠科、毛絲鼠科和刺豚鼠科。特有的羊駝是偶蹄類的代表。特有鳥類佔全部鳥類的三分之一，如美洲鴕科、鴱科、叫鴨科、麝雉科、灶鳥科和傘鳥科等。獨特的魚類有美鯰科和南美肺魚等。還有一些原為本區所特有，現亦分佈於新北區，如西科、浣熊科和蜂鳥科、霸鶲科等。
澳洲區 又稱大洋洲區，包括澳洲、紐西蘭、塔斯馬尼亞、伊裡安島和太平洋諸島。是世界最古老的動物區系，從中生代一直到上新世，澳洲經歷了漫長的隔離時期。動物區系高度特化，具有許多特有類群，包括原獸亞綱單孔類中的鴨嘴獸科、針鼴科和後獸亞綱有袋類中的袋鼬科、袋熊科、袋鼠科等。鳥類中鸚鵡有3個特有科：冠鸚科、倭鸚科、吸蜜科。還有一些十分特殊的科：鴯鶓科、鶴鴕科、琴鳥科、冢雉科、無翼科和園丁鳥科等。淡水魚類有澳洲肺魚。歐洲移民引進一些古北區動物，如英國穴兔、歐洲狐等，對原有動物區系產生了顯著影響。
南極區 南極大陸現在完全被冰雪覆蓋，但在地質歷史中，大部分時期曾是豐富的具有熱帶性的動、植物區系。根據化石研究，本區絕滅的動物屬古岡瓦納動物區系。有證據認為已發現的三尖叉齒獸和杯龍類與南非發現的化石同種。現代動物區系是由極端耐寒的無脊椎動物，特別是蟎類和無翅昆蟲所組成。脊椎動物最著名的是企鵝和鸌、鷗。企鵝是十分古老的類群，南極是其起源中心，由此向北輻射。
根據動物區系成分的系統發生和歷史的共通性，將世界陸地動物區系劃分為六個區：全北區、東洋區、熱帶區、新熱帶區、澳洲區和南極區。
全北區 佔有北半球的大部分，包括從歐亞大陸北緣到撒哈拉和喜馬拉雅山以及從北美洲大陸至墨西哥索諾拉州。該動物區系的歷史，大體上反映了冰期氣候變化的影響。當更新世最大冰期時，由於海平面下降，白令海峽間有陸橋相連，冰川前被迫南遷的動物區系完全混雜，第三紀時新舊大陸北部兩地動物區系的差異最後消失，形成一個統一的動物區系。如哺乳類的鼴科、蝟科、鼠兔科、河狸科，鳥類的潛鳥科、松雞科、太平鳥科、攀雀科、鴁科、施木雀科，兩棲類的洞源科、蠑螈科等都是典型的兩地共有動物。冰川退卻後，由於陸橋消失，兩地失去了連線，新露出的區域被重新移居，歐亞大陸北部與北美洲兩地間動物區系的差異便發展起來，產生了屬、種的分化。有人將全北區劃分為古北區和新北區。
（古北區 包括歐洲、北迴歸線以北的非洲與阿拉伯半島中、北部以及喜馬拉雅與秦嶺山脈以北的亞洲大陸。哺乳動物月鼠科、跳鼠科、睡鼠科、鼴形鼠科等為古北區所特有，鳥類巖鷚科及兩棲類小鯢科主要分佈於古北區。本區還有一些特有的屬，例如鼴鼠、金絲猴、貉、獾、駱駝、獐、狍及山鶉、鴇、沙雞、百靈、地鴉、巖鷚、沙雀等。
新北區 包括墨西哥北部及其以北的北美洲。哺乳類叉角羚科、山河狸科，爬行類北美蛇蜥科，兩棲類鰻螈科、兩棲鯢科，魚類弓鰭魚科、雀鱔科等為本區所特有。特有的屬有美洲麝牛、美洲河狸、美洲獾、美洲松鼠、豹鼠、蹼足鼴、野吐綬雞等。）
東洋區 又稱印度馬來亞區，包括印度、中南半島、菲律賓和中國南部。本區與熱帶區有許多共同之處，在第三紀時均為熱帶雨林，棲居著一些世界性的熱帶種類。如鱷科、鸚鵡科、日鷉科、蟒蛇科、壁虎科和蚓螈科等。更新世氣候惡化，喜暖的古北區森林動物南遷進入本區和熱帶區，如類人猿、猴類、象、犀、牛、豬、靈貓和犀鳥、鴨、太陽鳥等類群。由於陸地的分離，兩區共有的類群產生一些分化，發展了各自的特有屬，如長臂猿、猩猩、亞洲象、東方靈貓等。本區特有的類群哺乳類有樹鼩科、刺山鼠科、眼鏡猴科、大熊貓、小熊貓，鳥類有和平鳥科、冠Swift科，爬行類有平胸龜科、異盾蛇科、鱷蜥科、擬毒蜥科、食魚鱷科。本區分為印度、中南半島、南中國—喜馬拉雅三個亞區。動物區系的明顯差異表現在種的水平上。
熱帶區 又稱衣索比亞區，包括撒哈拉以南的非洲大陸及馬拉加西島等地。更新世氣候惡化，古北區喜暖動物南遷進入東洋區和熱帶區，但沒有鼴鼠、鹿和熊。本區分化出來的特有屬有黑猩猩、大猩猩、疣猴、狒狒、非洲黑犀、非洲象等。特有的類群有蹄兔目、管齒目、金毛鼴科、象鼩科、土豚科、河馬科、長頸鹿科、珠雞科、鷺鷹科鴕鳥科和非洲肺魚科等。其中長頸鹿科並不起源於非洲，原產歐洲、印度和中國等地，今在其起源地已經滅絕，而保留在非洲併成為特有動物。本區有一些古區系成分，如蚓蜥、蚓螈、鱺魚和淡水貽貝等在古北區從未發現過它們的化石，但卻見於南美洲（新熱帶區），證明非洲大陸曾是古生代岡瓦納大陸的一部分。馬拉加西島動物區系具有顯著的獨特性，幾乎所有熱帶區哺乳動物在這裡都不存在，僅有非洲河豬是晚近時期從非洲大陸遷來的。作為該島的特有類群有狐猴科、大狐猴科、指猴科、馬島蝟科和擬鶉科、裸眉鶇科、鵑鴗科等。
新熱帶區 包括整個中美洲和南美洲大陸、墨西哥南部及西印度群島。是世界最具特色的動物區系。在漫長的地質時期，南美洲曾是一個孤島，發展了許多特有類群，且與其他區域聯絡較少。本區古老成分的代表是貧齒類和有袋類中的原始哺乳動物。有袋類有新袋鼠科和負鼠科，貧齒類有三個現存的科：樹獺科、犰狳科和食蟻獸科。齧齒類特殊的科有美洲豪豬科、豚鼠科、毛絲鼠科和刺豚鼠科。特有的羊駝是偶蹄類的代表。特有鳥類佔全部鳥類的三分之一，如美洲鴕科、鴱科、叫鴨科、麝雉科、灶鳥科和傘鳥科等。獨特的魚類有美鯰科和南美肺魚等。還有一些原為本區所特有，現亦分佈於新北區，如西科、浣熊科和蜂鳥科、霸鶲科等。
澳洲區 又稱大洋洲區，包括澳洲、紐西蘭、塔斯馬尼亞、伊裡安島和太平洋諸島。是世界最古老的動物區系，從中生代一直到上新世，澳洲經歷了漫長的隔離時期。動物區系高度特化，具有許多特有類群，包括原獸亞綱單孔類中的鴨嘴獸科、針鼴科和後獸亞綱有袋類中的袋鼬科、袋熊科、袋鼠科等。鳥類中鸚鵡有3個特有科：冠鸚科、倭鸚科、吸蜜科。還有一些十分特殊的科：鴯鶓科、鶴鴕科、琴鳥科、冢雉科、無翼科和園丁鳥科等。淡水魚類有澳洲肺魚。歐洲移民引進一些古北區動物，如英國穴兔、歐洲狐等，對原有動物區系產生了顯著影響。
南極區 南極大陸現在完全被冰雪覆蓋，但在地質歷史中，大部分時期曾是豐富的具有熱帶性的動、植物區系。根據化石研究，本區絕滅的動物屬古岡瓦納動物區系。有證據認為已發現的三尖叉齒獸和杯龍類與南非發現的化石同種。現代動物區系是由極端耐寒的無脊椎動物，特別是蟎類和無翅昆蟲所組成。脊椎動物最著名的是企鵝和鸌、鷗。企鵝是十分古老的類群，南極是其起源中心，由此向北輻射。