定點捕捉
神獸:
急凍鳥：哈吉左邊道路登瀑布
閃電鳥：流星瀑布最深處的更深處
火焰鳥：冠軍之路
超夢：和石之洞窟某NPC對話得到破壞因子後的壞天氣岩石(注意NPC的對話，選錯的話超夢就沒了)
夢幻：取下超夢身上的古代海圖坐船
水君：山優市瀑布洞
雷公：銀葉發電廠
炎帝：火之捷徑
洛奇亞：抓完3鳥後的116號道路洞口
鳳王：抓完3獸後的116號道路洞口
雪拉比：天元森林沖浪
三神柱
第一步：在126號水道的海底的水草中遇“地圖石魚（花刺）”（比較稀有）
第二步：在海邊用中/高階釣竿釣“皮皮鯨”，並練到40級進化成“巨鯨”
第三步：得到TM28“挖洞”並給精靈學
第四步：把上面所說的精靈都帶上
好了，準備工作都做完了。那麼，GO！
從那個建在水上的鎮（就是房子都是用木頭搭的鎮）往左遊，會來到一個有很多急流的地方，一直從最下面遊，會來到一個略成方行的海灘（我記得在134號路附近）。然後從中間游過去，會來到一個四面被急流包圍的深色水域，潛下去，一直走倒頭，調查石板後浮上去，便會到達遺蹟。
調查盡頭的石板後用挖洞，會出現一個洞，進去後把地圖石魚放在第一個，巨鯨放在最後，調查盡頭的石板後會有地震。地震完之後離開這裡去捉三神柱
雷吉洛克：在111號道路，在那文字那裡，左，左，下，下，然後使用HM06碎石。
雷吉艾斯：在105號道路，在文字那裡繞著牆壁迴圈一週
雷吉斯奇魯：在120號道路，在山洞中間使用HM05閃光
雷吉艾斯：就是冰柱
雷吉洛克 ：就是巖柱
雷吉斯奇魯：就是鋼柱
拉迪亞斯、拉帝歐斯：1個和原版一樣打完四大天王和冠軍後，回到家裡，電視上說的神秘神奇寶貝，便為拉帝亞斯和拉帝歐斯，此後在方元地區不一定在哪裡相遇，用大師球捕捉。,另一個與阿田市水手對話得船票,坐船
固拉多（又名古拉頓）：通關後隨機在 陸之洞窟 出現。
蓋歐卡（又名海皇牙）：通關後隨機在 海之洞窟 出現。
以上兩個通關後先去日川市（飛行系道館所在地）附近的天氣研究所裡，和2樓的NPC對話會告訴你哪一條道路或水道天氣不正常，然後就在天氣不正常的道路里找-陸地是以前沒有的山洞，在裡面會有固拉多，水路是以前沒有的潛水區域，在裡面會有蓋歐卡。
裂空座：天空之柱 頂層。準備好風馬腳踏車，爬天柱全是洞，不猛衝過去是會掉下去的
基拉祈：超能市白色隕石
代歐奇西斯：拿怪力術的洞窟衝浪
帝牙盧卡：通關後看看洞退潮後的冰洞
帕路奇犽：通關後流星瀑布新開洞
席多藍恩：坐纜車的地方(2)後面（限2.0及其以下版本）
雷吉奇卡斯：三神柱抓完後的吉納左邊潛水挖洞（限2.0及其以下版本）
基拉帝納：通關後日落山大樓頂層白墳墓
克雷塞西亞：通關後到賓館2樓得到三日月羽毛,然後在道吉睡覺
瑪納霏：雙鹿市潛水（限2.0及其以下版本）
達克萊伊：在鬼屋中得到暗黑之羽後在阿田睡覺(已修正)
潔咪：孵蛋之道洞窟
阿爾修斯：捕捉珍鑽的3神後,覺醒寺最底部
萊希拉姆：通關後火山山頂洞口（限3.0及其以上版本）
澤克羅姆：通關後石之洞窟中的洞口（限3.0及其以上版本）
丘雷姆：通關後雪鎮右側道路洞口（限3.0及其以上版本）
其他:
皮卡丘色的皮丘:121號道路
紅色暴鯉龍:沙狐樂園某個水池
暗黑洛奇亞:廢棄船深處
水晶大巖蛇:戰鬥邊疆藝術之洞2L冰岩
焚翼蛾:通關後沙漠地下島深處
定點捕捉
神獸:
急凍鳥：哈吉左邊道路登瀑布
閃電鳥：流星瀑布最深處的更深處
火焰鳥：冠軍之路
超夢：和石之洞窟某NPC對話得到破壞因子後的壞天氣岩石(注意NPC的對話，選錯的話超夢就沒了)
夢幻：取下超夢身上的古代海圖坐船
水君：山優市瀑布洞
雷公：銀葉發電廠
炎帝：火之捷徑
洛奇亞：抓完3鳥後的116號道路洞口
鳳王：抓完3獸後的116號道路洞口
雪拉比：天元森林沖浪
三神柱
第一步：在126號水道的海底的水草中遇“地圖石魚（花刺）”（比較稀有）
第二步：在海邊用中/高階釣竿釣“皮皮鯨”，並練到40級進化成“巨鯨”
第三步：得到TM28“挖洞”並給精靈學
第四步：把上面所說的精靈都帶上
好了，準備工作都做完了。那麼，GO！
從那個建在水上的鎮（就是房子都是用木頭搭的鎮）往左遊，會來到一個有很多急流的地方，一直從最下面遊，會來到一個略成方行的海灘（我記得在134號路附近）。然後從中間游過去，會來到一個四面被急流包圍的深色水域，潛下去，一直走倒頭，調查石板後浮上去，便會到達遺蹟。
調查盡頭的石板後用挖洞，會出現一個洞，進去後把地圖石魚放在第一個，巨鯨放在最後，調查盡頭的石板後會有地震。地震完之後離開這裡去捉三神柱
雷吉洛克：在111號道路，在那文字那裡，左，左，下，下，然後使用HM06碎石。
雷吉艾斯：在105號道路，在文字那裡繞著牆壁迴圈一週
雷吉斯奇魯：在120號道路，在山洞中間使用HM05閃光
雷吉艾斯：就是冰柱
雷吉洛克 ：就是巖柱
雷吉斯奇魯：就是鋼柱
拉迪亞斯、拉帝歐斯：1個和原版一樣打完四大天王和冠軍後，回到家裡，電視上說的神秘神奇寶貝，便為拉帝亞斯和拉帝歐斯，此後在方元地區不一定在哪裡相遇，用大師球捕捉。,另一個與阿田市水手對話得船票,坐船
固拉多（又名古拉頓）：通關後隨機在 陸之洞窟 出現。
蓋歐卡（又名海皇牙）：通關後隨機在 海之洞窟 出現。
以上兩個通關後先去日川市（飛行系道館所在地）附近的天氣研究所裡，和2樓的NPC對話會告訴你哪一條道路或水道天氣不正常，然後就在天氣不正常的道路里找-陸地是以前沒有的山洞，在裡面會有固拉多，水路是以前沒有的潛水區域，在裡面會有蓋歐卡。
裂空座：天空之柱 頂層。準備好風馬腳踏車，爬天柱全是洞，不猛衝過去是會掉下去的
基拉祈：超能市白色隕石
代歐奇西斯：拿怪力術的洞窟衝浪
帝牙盧卡：通關後看看洞退潮後的冰洞
帕路奇犽：通關後流星瀑布新開洞
席多藍恩：坐纜車的地方(2)後面（限2.0及其以下版本）
雷吉奇卡斯：三神柱抓完後的吉納左邊潛水挖洞（限2.0及其以下版本）
基拉帝納：通關後日落山大樓頂層白墳墓
克雷塞西亞：通關後到賓館2樓得到三日月羽毛,然後在道吉睡覺
瑪納霏：雙鹿市潛水（限2.0及其以下版本）
達克萊伊：在鬼屋中得到暗黑之羽後在阿田睡覺(已修正)
潔咪：孵蛋之道洞窟
阿爾修斯：捕捉珍鑽的3神後,覺醒寺最底部
萊希拉姆：通關後火山山頂洞口（限3.0及其以上版本）
澤克羅姆：通關後石之洞窟中的洞口（限3.0及其以上版本）
丘雷姆：通關後雪鎮右側道路洞口（限3.0及其以上版本）
其他:
皮卡丘色的皮丘:121號道路
紅色暴鯉龍:沙狐樂園某個水池
暗黑洛奇亞:廢棄船深處
水晶大巖蛇:戰鬥邊疆藝術之洞2L冰岩
焚翼蛾:通關後沙漠地下島深處