主要有兩方面原因

顯然兩河流域能最早進入文明時代是受了諸多因素的影響，比如這裡是距離最早的農業中心黎凡特最近的大河流域地區。同時兩河流域南部氾濫的河水和乾旱的氣候，又促使原本分散的各聚落聯合起來，共同修建大規模的灌溉防洪工程，而要聯合各聚落共同修建大型的公共建築工程需要一個強有力的統治機構，這就促成了國家的出現。

兩河流域資源匱乏，但水陸交通便利，因此商業貿易十分活躍，而兩河流域最早的文字正是起源於商業貿易的需要。此外，兩河流域周邊的伊朗高原、小亞細亞等地的銅礦與冶金術，也對兩河文明的出現產生了巨大影響。

雖然尼羅河流域在地理上也與最早的農業中心黎凡特相連，而且其農業條件遠比兩河流域優越。但從考古發現上看，直到約公元前 5000 年尼羅河流域的農業發展並不突出，這是由於早期農業生產力落後，而同時期北非氣候溫和溼潤、水草繁茂，沙漠化還沒開始，從事狩獵畜牧反而有更大的收益。

已知非洲最早的新石器文化並非出現在埃及尼羅河谷，而是出現在今日的“死亡之地”撒哈拉沙漠。與今日的乾枯沙漠景象不同，當時的撒哈拉還比較溼潤，為稀樹草原之地。撒哈拉新石器文化沒有明顯的農業跡象，主要遺存是陶器和巖畫，其陶器製作時間早於東邊埃及和北部歐洲，可確定是獨立陶器製作的發源地。其巖畫代表是阿爾及利亞和利比亞邊界不遠的撒哈拉中部的阿杰爾高原的岩石繪畫，以大量的動物畫出名，被譽為“世界上最大的一個史前藝術博物館”。

阿杰爾高原的岩石繪畫

約公元前 5000 年之後，非洲北部氣候開始進入乾燥階段，氣候逐漸變得越來越炎熱乾旱，湖泊、溪流相繼乾涸斷流，撒哈拉河馬和大西洋象從此絕跡，繁盛的草原變成無盡的撒哈拉沙漠。原本從事遊牧狩獵的人們開始逐漸遷移到尼羅河流域從事農業耕作，尼羅河得天獨厚的農業優勢得以顯現，在河流兩岸的農業村落迅猛增加。

從時間上看，兩河流域早期重要的農業遺址——耶莫遺址，其年代約為公元前7000—前5800年。而尼羅河流域直到約公元前6000年，西亞的農作物與家畜傳入尼羅河流域，在下埃及三角洲的法尤姆綠洲出現埃及已知最早的農牧業文化。由此可見，尼羅河流域的農業起步要遠比兩河流域要晚。