工廠化栽培金針菇不僅需要專用廠房設施，還需要配套的機械裝置。工廠化生產各個工藝階段需要不同的生產裝置，而生產裝置的配備根據生產規模而定。裝置配備不足，將影響生產量，裝置配備過剩，造成不必要的浪費。金針菇工廠化生產需配備的裝置包括攪拌機及送料帶、裝瓶機、殺菌鍋、自動接種機、搔菌機、加溼器、挖瓶機和產品包裝機。金針菇工廠化栽培採用塑膠瓶為栽培容器。栽培容器常見有550～1100毫升的聚丙烯塑膠瓶及每筐放12瓶或16瓶的塑膠筐。據介紹（張引芳，2006），日產2噸的規模，廠房設施、機械裝置等項投資大約需要2000萬元；日產12噸的規模，廠房設施、機械裝置等項投資大約需要6000萬元。

工廠化袋栽金針菇使用的機械裝置很多，但常用的主要機械裝置有：（1）粉碎機用來粉碎原料，如木屑、玉米芯、甘蔗等。（2）拌料機用來均勻攪拌原輔材料至適宜含水量。（3）裝袋機用於機械裝料成栽培袋。（4）鍋爐滅菌提供熱源之用。（5）高壓鍋滅菌容器。（6）貨架作為週轉筐載體，供釵車進出搬運週轉。（7）釵車整架轉運栽培袋使用。（8）接種箱用於接菌種、栽培袋使用。（9）週轉筐（塑膠筐或鋼筋焊制）常用規格47釐米×47釐米×24釐米，可自行定做。（10）平板車（50釐米×100釐米）斗車。作為週轉筐載體，供栽培袋轉運各栽培房使用。（11）空調機調節溫度，主要供接菌室、菌種培養室使用。（12）真空包裝機供產品小包裝使用。（13）製冷機組用於發菌冷庫和出菇冷庫的氣調製冷。