系統分析的具體步驟包括：限定問題、確定目標、調查研究收集資料、提出備選方案和評價標準、備選方案評估和提出最可行方案。 1、 限定問題　　所謂問題，是現實情況與計劃目標或理想狀態之間的差距。系統分析的核心內容有兩個：其一是進行“診斷”，即找出問題是及其原因；其二是“開處方”，即提出解決問題的最可行方案。所謂限定問題，就是要明確問題的本質或特性、問題存在範圍和影響程度、問題產生的時間和環境、問題的症狀和原因等。限定問題是系統分析中關鍵的一步，因為如果“診斷”出錯，以後開的“處方”就不可能對症下藥。在限定問題時，要注意區別症狀和問題，探討問題原因不能先入為主，同時要判別哪些是區域性問題，哪些是整體問題，問題的最後確定應該在調查研究之後。 2、確定目標　　系統分析目標應該根據客戶的要求和對需要解決問題的理解加以確定，如有可能應儘量透過指標表示，以便進行定量分析。對不能定量描述的目標也應該儘量用文字說明清楚，以便進行定性分析和評價系統分析的成效。 3、調查研究，收集資料　　調查研究和收集資料應該圍繞問題起因進行，一方面要驗證有限定問題階段形成的假設，另一方面要探討產生問題的根本原因，為下一步提出解決問題的備選方案做準備。 　　調查研究常用的有四種方式，即閱讀檔案資料、訪談、觀察和調查。 　　收集的資料和資訊包括事實（facts）、見解(opinions)和態度(attitudes)。要對資料和資訊去偽存真，交叉核實，保證真實性和準確性。

4、提出備選方案和評價標準　　透過深入調查研究，使真正有待解決的問題得以最終確定，使產生問題的主要原因得到明確，在此基礎上就可以有針對性地提出解決問題的備選方案。備選方案是解決問題和達到諮詢目標可供選擇的建議或設計，應提出兩種以上的備選方案，以便提供進一步評估和篩選。為了對備選方案進行評估，要根據問題的性質和客戶具備的條件。提出約束條件或評價標準，供下一步應用。

5、備選方案評估　　根據上述約束條件或評價標準，對解決問題備選方案進行評估，評估應該是綜合性的，不僅要考慮技術因素，也要考慮社會經濟等因素，評估小組的成員應該有一定代表性，除諮詢專案組成員外，也要吸收客戶組織的代表參加。根據評估結果確定最可行方案。

6、提交最可行方案　　最可行方案並不一定是最佳方案，它是在約束條件之內，根據評價標準篩選出的最現實可行的方案。如果客戶滿意，則系統分析達到目標。如果客戶不滿意，則要與客戶協商調整約束條件或評價標準，甚至重新限定的問題，開始新一輪系統分析，直到客戶滿意為止。