可以。

雖說從禮制、律制上不太可以，但在實際操作上非同源的同姓可以，只不過案例少而已。

夏殷不嫌一姓之婚，周制始絕同姓之娶。

即至周時，才開始在制度上禁絕同姓婚姻，可能是因為在實際的的同姓婚姻中，因為血脈相近出現了高機率的畸形兒或者先天疾病，也即：

男女同姓，其生不繁。同姓不婚，懼不殖也

到了唐朝之後，則明確的了同姓為婚的處理方法：

唐律：同姓為婚者徙二年，同姓又同宗者以奸罪論

宋元延續了唐律，至明清則加大了處罰程度，凡同姓為婚者各杖六十，離異。至清末則廢棄，只禁同宗，不再禁同姓。

那麼在周至唐之間的秦漢魏晉，這一期間同姓結婚還是有例可循的。

《漢書·王訢傳》訢薨，子譚嗣；譚薨，子鹹嗣；王莽妻即鹹女

王莽孝睦皇后王氏，即同姓為婚。

具體到中古士族：

魏司空東萊王基當世大儒，豈不達禮乎！為子納司空太原王沈女，以其姓同而源異故也。

東萊王氏是魏晉之際興起計程車族，王基官至徵南將軍、都督荊州諸軍事，贈司空；

太原王氏則是後漢以來的世家大族，王沈官至驃騎將軍、錄尚書事，贈司空；

兩個王氏雖然同姓但不同源，所以可以通婚。

不過按照王彌年少時曾經在洛陽能與劉淵交遊深交，而幷州匈奴劉氏和太原王氏累世相交，那麼王彌很可能是王基的後輩從子。攻破洛陽滅晉的王彌是王基的後輩，王沈的兒子則是晉末大攪屎棍王浚，兩人又都在宴會上被石勒做掉，還真是奇妙。