區別： 1、研究性狀： 基因的分離定律：1對； 基因的自由組合定律：2對或n對(n>2,下同)。 2、等位基因對數： 基因的分離定律：1對； 基因的自由組合定律：2對或n對。 3、等位基因與染色體的關係： 基因的分離定律：位於1對同源染色體上； 基因的自由組合定律：分別位於2對或2對以上同源染色體上。 4、細胞學基礎（染色體的活動）： 基因的分離定律：減數第一次分裂後期，同源染色體分離： 基因的自由組合定律：減數第一次分裂後期，非同源染色體自由組合；減數第一次分裂前期，同源染色體的非姐妹染色單體間交叉互換。 5、遺傳本質： 基因的分離定律：等位基因分離： 基因的自由組合定律：非同源染色體上的非等位基因的重組互不干擾。 聯絡： ①在形成配子時，兩個基因定律同時其作用。 在減數分裂時，同源染色體上等位基因都要分離；等位基因分離的同時，非同源染色體上的非等位基因自由組合。 ②分離定律是最基本的遺傳定律，是自由組合定律的基礎。 基因的自由組合定律：或稱基因的獨立分配定律，是遺傳學的三大定律之一(另外兩個是基因的分離定律和基因的連鎖和交換定律)。它由奧地利遺傳學家孟德爾經豌豆雜交試驗發現。同源染色體相同位置上決定相對性狀的基因在形成配子時等位基因分離，非等位基因自由組合。 基因分離定律：在生物的體細胞中，控制同一性狀的遺傳因子成對存在，不相融合;在形成配子時，成對的遺傳因子發生分離，分離後的遺傳因子分別進入不同的配子中，隨配子遺傳給後代。 基因分離定律是有性遺傳中最基礎、最重要的定律。