匯流排型別不同，PCI插槽是基於PCI區域性匯流排的擴充套件插槽，而PCI-E插槽則是最新的匯流排和介面標準，這個新標準將全面取代現行的PCI和AGP，最終實現匯流排標準的統一。 顏色不同，PCI插槽是乳白色的，而PCI-E插槽是黑色的。 由於PCI匯流排只有133MB/s 的頻寬，對音效卡、網絡卡、影片卡等絕大多數輸入/輸出裝置顯得綽綽有餘，但對效能日益強大的顯示卡則無法滿足其需求。 用於取代AGP介面的PCI-E介面位寬為X16，能夠提供5GB/s的頻寬，即便有編碼上的損耗但仍能夠提供約為4GB/s左右的實際頻寬，遠遠超過AGP 8X的2.1GB/s的頻寬。 規格不同，PCI插槽只有一種規格，而PCI-E插槽有X1(250MB/秒)，X2，X4，X8，X12，X16和X32通道的7種規格。

區別一、匯流排型別不同，PCI插槽是基於PCI區域性匯流排的擴充套件插槽，而PCI-E插槽則是最新的匯流排和介面標準，這個新標準將全面取代現行的PCI和AGP，最終實現匯流排標準的統一。

區別二、顏色不同，PCI插槽是乳白色的，而PCI-E插槽是黑色的。

區別三、規格不同，PCI插槽只有一種規格，而PCI-E插槽有X1(250MB/秒)，X2，X4，X8，X12，X16和X32通道的7種規格。

區別四、傳輸速率不同，PCI插槽最大資料傳輸率為133MB/sec(32位)和266MB/sec(64位)，而PCI-E插槽，目前最高可達到10GB/s以上。