1996年 001-042集
1997年 043-085集
1998年 086-128集
1999年 129-173集
2000年 174-218集
2001年 219-262集
2002年 263-303集
2003年 304-344集
2004年 345-383集
2005年 384-424集
2006年 425-444集
特別篇
特別篇01-鋼琴奏鳴曲"月光"殺人事件 （前篇）
特別篇01-鋼琴奏鳴曲"月光"殺人事件 （後篇）
特別篇02-霧天狗傳說殺人事件 （前篇）
特別篇02-霧天狗傳說殺人事件 （後篇）
特別篇03-柯南 vs 怪盜KID （前篇）
特別篇03-柯南 vs 怪盜KID （後篇）
特別篇04-走頭無路的名偵探！連續兩大殺人事件
特別篇05-浪花連續殺人事件
特別篇06-來自黑暗組織的女子！大學教授殺人事件
特別篇07-飛行中的密室！工藤新一首次事件
特別篇08-第二十年的殺機！聖佛尼號連續殺人事件 （前篇）
特別篇08-第二十年的殺機！聖佛尼號連續殺人事件 （後篇）
特別篇09-詛咒假面的冷笑
特別篇10-朝向迷宮的入口．巨神像之怒
特別篇11-名偵探的會集 工藤新一vs怪盜基德
特別篇12-大阪雙謎 浪花劍士與太閣之城
特別篇13-震動的警視廳 1200萬人質
特別篇14-豪斯登堡的新娘
特別篇15-與黑衣組織直面對決 滿月之夜的雙重迷案
特別篇16-怪盜基德的驚異空中步行
特別篇17-甲子園的奇蹟 絕不輸給看不見的惡魔
劇場版
1：記時引爆摩天樓
2：第十四個的目標
3：世紀末的魔術師
4：瞳孔中的暗殺者
5：通往天國的倒計時
6：貝克街的亡靈
7：迷宮的十字路口
8：銀翅膀的魔術師
9：水平線上的陰謀
10: 偵探們的陣魂歌
OVA
1：柯南 vs Kid vs Yaiba 寶刀爭奪大作戰!
2：16個嫌疑犯
3：柯南、平次與消失的少年
4：基德與水晶之母
5：目標是小五郎!!少年偵探團的秘密調查。
6：追蹤消失的鑽石！柯南&平次vsKID！
特輯
1：工藤優作-彷徨的紅蝴蝶
2：工藤有希子-飛上天空的十顆行星
3：世紀百科-追尋謎一樣的水星怪獸
4：青山岡倉短篇動畫集
5：少年偵探團7分鐘特輯（名偵探柯南幕後工作公開紀錄片）
1996年 001-042集
1997年 043-085集
1998年 086-128集
1999年 129-173集
2000年 174-218集
2001年 219-262集
2002年 263-303集
2003年 304-344集
2004年 345-383集
2005年 384-424集
2006年 425-444集
特別篇
特別篇01-鋼琴奏鳴曲"月光"殺人事件 （前篇）
特別篇01-鋼琴奏鳴曲"月光"殺人事件 （後篇）
特別篇02-霧天狗傳說殺人事件 （前篇）
特別篇02-霧天狗傳說殺人事件 （後篇）
特別篇03-柯南 vs 怪盜KID （前篇）
特別篇03-柯南 vs 怪盜KID （後篇）
特別篇04-走頭無路的名偵探！連續兩大殺人事件
特別篇05-浪花連續殺人事件
特別篇06-來自黑暗組織的女子！大學教授殺人事件
特別篇07-飛行中的密室！工藤新一首次事件
特別篇08-第二十年的殺機！聖佛尼號連續殺人事件 （前篇）
特別篇08-第二十年的殺機！聖佛尼號連續殺人事件 （後篇）
特別篇09-詛咒假面的冷笑
特別篇10-朝向迷宮的入口．巨神像之怒
特別篇11-名偵探的會集 工藤新一vs怪盜基德
特別篇12-大阪雙謎 浪花劍士與太閣之城
特別篇13-震動的警視廳 1200萬人質
特別篇14-豪斯登堡的新娘
特別篇15-與黑衣組織直面對決 滿月之夜的雙重迷案
特別篇16-怪盜基德的驚異空中步行
特別篇17-甲子園的奇蹟 絕不輸給看不見的惡魔
劇場版
1：記時引爆摩天樓
2：第十四個的目標
3：世紀末的魔術師
4：瞳孔中的暗殺者
5：通往天國的倒計時
6：貝克街的亡靈
7：迷宮的十字路口
8：銀翅膀的魔術師
9：水平線上的陰謀
10: 偵探們的陣魂歌
OVA
1：柯南 vs Kid vs Yaiba 寶刀爭奪大作戰!
2：16個嫌疑犯
3：柯南、平次與消失的少年
4：基德與水晶之母
5：目標是小五郎!!少年偵探團的秘密調查。
6：追蹤消失的鑽石！柯南&平次vsKID！
特輯
1：工藤優作-彷徨的紅蝴蝶
2：工藤有希子-飛上天空的十顆行星
3：世紀百科-追尋謎一樣的水星怪獸
4：青山岡倉短篇動畫集
5：少年偵探團7分鐘特輯（名偵探柯南幕後工作公開紀錄片）