1、第一步，清洗時首先拆卸下車輛的空調濾芯，使車輛處於怠速狀態，關閉空調並將出風量調至最大，為了能同時兼顧冷暖風道的清洗，需要將出風模式選擇中置，開啟內迴圈模式。自動空調一般將溫度設定到恆溫24度。

2、第二步，將清潔劑匯入空調清洗機，將清洗機一端的噴管插入車內鼓風機附近的空氣出風口，啟動清洗機進行第一步清洗，清洗過程大概需要10分鐘。

3、第三步，清潔劑清洗完畢後，需要更換純淨水對蒸發箱等處進行沖洗，需要注意的是，此過程必須使用純淨水以免在空調管路內產生水垢，迴圈模式選擇內/外迴圈均可，這一步需要持續清洗8分鐘左右。

4、第四步，消毒，用清洗機將消味劑高壓噴入空氣出風口，一般這種消味劑都能有效的殺死空調內常見的各種病菌及感染細菌，對空調部件也沒有損傷。此過程一般需要開啟外迴圈模式，持續清洗10分鐘即可。

5、清洗完畢後，短時間內空調依舊會殘留一部分清洗劑和消毒液的味道，一般24小時後味道會消失，清洗效果才會顯現出來。用空調清洗機對空調進行殺菌根據清潔殺菌液品牌的不同單次費用一般為300元左右。