1、流轉方式不同 電子支付是採用先進的技術透過數字流轉來完成資訊傳輸的，其各種支付方式都是透過數字化的方式進行款項支付的；而傳統的支付方式則是透過現金的流轉、票據的轉讓及銀行的匯兌等物理實體來完成款項支付的。

2、支付媒介不同 電子支付使用的是最先進的通訊手段，如Internet、Extranet，而傳統支付使用的則是傳統的通訊媒介；電子支付對軟、硬體設施的要求很高，一般要求有聯網的微機、相關的軟體及其他一些配套設施，而傳統支付則沒有這麼高的要求。

3、用時和費用不同 傳統支付費用高，電子支付費用低。電子支付具有方便、快捷、高效、經濟的優勢。使用者只要擁有一臺上網的PC機，便可足不出戶，在很短的時間內完成整個支付過程。 在電子商務中，支付過程是整個商貿活動中非常重要的一個環節，同時也是電子商務中準確性、安全性要求最高的業務過程。電子支付的資金流是一種業務過程,而非一種技術。但是在進行電子支付活動的過程中,會涉及到很多技術問題。 傳統支付方式普遍使用的是發票、本票、匯票、信用卡、現金的方式，雖然以票據交換取代了現金流轉，給實際支付業務帶來了巨大的變化，但是，這種方式下的業務處理仍然存在著許多弊病。現今採用網路交易的電子支付不僅能夠提高結算效率，更重要的是加快了資金週轉速度，降低了資金週轉的成本。