區別一、答辯的原因不同。

第一次答辯主要是校方組織論文答辯的目的簡單說是為了進一步審查論文，即進一步考查和驗證論文作者對所著論文論述到的論題的認識程度和當場論證論題的能力；考察論文作者對專業知識掌握的深度和廣度；審查論文是否由學員自己獨立完成等情況。而二次答辯沒有透過畢業論文再答辯。

區別二、兩者答辯的時間不同。

第一次答辯主要是學校組織在同一個時間段學生統一答辯。而二次答辯主要是由於第一次答辯沒有透過，而學校會重新安排時間進行答辯。

區別三、兩者結果不同。

區別四、兩者前後準備不同。

透過第一次畢業論文答辯的同學，必須按照學院規定，按時以班為單位，提交畢業論文定稿及相關材料。而二次答辯的同學，需要準備答辯的材料以及需要答辯時查重等工作。

區別五、兩者的影響不同。

以畢業論文查重為例，第一次查重不透過的，可以在學院組織安排的第二次答辯三天前，申請對修改後的論文進行再次查重，如查重透過，可申請參加第二次答辯，查重未透過或未按規定時間提出再次查重申請的同學，不能參加第二次答辯，不再安排論文答辯，學生需申請延期畢業。

畢業論文答辯是一種有組織、有準備、有計劃、有鑑定的比較正規的審查論文的重要形式。

為了搞好畢業論文答辯，在舉行答辯會前，校方、答辯委員會、答辯者（撰寫畢業論文的作者）三方都要作好充分的準備。

在答辯會上，考官要極力找出來在論文中所表現的水平是真是假。而學生要證明自己的論點是正確的。