11月25日,一篇由英國倫敦大學學院遺傳學家團隊釋出在《Nature Communications》上的新論文在研究了大量的新冠病毒(SARS-CoV-2)突變後,得出沒有發現任何可能改變病毒傳播能力的突變的結論。
SARS-CoV-2已經在人類身上生存了大約一年,在此期間,它發展出了不少變化。
為了確定SARS-CoV-2的突變是否增加了它的傳播性,本研究背後的科學家分析了來自99個國家46723人的基因組樣本。
據該研究論文的共同第一作者,英國UCL遺傳學研究所的Lucy·van·Dorp博士說:“用於科學研究的SARS-CoV-2基因組的數量是驚人的。”她補充道,“我們在大流行的早期就意識到,我們需要新的方法來分析海量的資料——接近實時——來標記病毒中可能影響其傳播或症狀嚴重性的新突變。”
科學家們分析的資料集包括直到2020年7月底的樣本。
在最初的46723個樣本中,科學家們確定了12706例病毒突變。然而,研究人員對398例可能獨立發生多次的突變特別感興趣。
這表明,這些突變更有可能增加病毒的傳播,而不是具有中性作用,並被偶然傳遞。
科學家們最終確定了185個至少獨立發生三次的突變。
為了確定這些突變是否提高了病毒的傳播機率,科學家們建立了病毒的進化樹模型,追蹤每個突變在某個進化分支上的常見程度。
如果突變在後代中頻繁發生,就可能增加了病毒傳播的機會。
在追蹤了185個突變的進化過程,每個突變都獨立發生了三次,科學家們沒有發現任何證據表明,任何一個突變有增加病毒的傳播機會。
相反,他們發現大多數突變在病毒傳播方面是中性的。
這些突變似乎主要是由於人類免疫系統的影響而發生的。這與病毒從人類感染到水貂身上時的表現形成了鮮明對比,科學家們曾分別分析過這種情況。
正如van Dorp博士所說:“當我們分析來自水貂的病毒基因組時,我們驚奇地發現相同的突變在不同的水貂養殖場中反覆出現,儘管這些相同的突變以前很少在人類身上觀察到。”
根據倫敦大學學院生物科學部的Francois ·Balloux教授的說法,這可能意味著SARS-CoV-2在人類中的關鍵突變事件發生在病毒從一個仍未確定的非人類動物宿主傳染後不久。
“我們很可能已經錯過了病毒在人類中的早期適應期。我們之前估計SARS-CoV-2是在2019年10月或11月傳染到人類,但我們掌握的第一批基因組的日期是12月底。那個時候,對人類中的傳播能力至關重要的病毒突變可能已經出現並穩定下來,我們無法研究它們。”
科學家們指出,隨著第一批有效的SARS-CoV-2疫苗即將在全球範圍內推廣,病毒很可能會經歷一系列的變異反應。他們所開發的方法應該有助於快速識別這些突變。
Balloux教授說:“疫苗方面的訊息看起來很不錯。該病毒很可能在未來產生免疫逃逸突變,但我們有信心能夠及時標記出這些突變,這樣就可以在需要時及時更新疫苗。”
11月25日,一篇由英國倫敦大學學院遺傳學家團隊釋出在《Nature Communications》上的新論文在研究了大量的新冠病毒(SARS-CoV-2)突變後,得出沒有發現任何可能改變病毒傳播能力的突變的結論。
SARS-CoV-2已經在人類身上生存了大約一年,在此期間,它發展出了不少變化。
為了確定SARS-CoV-2的突變是否增加了它的傳播性,本研究背後的科學家分析了來自99個國家46723人的基因組樣本。
據該研究論文的共同第一作者,英國UCL遺傳學研究所的Lucy·van·Dorp博士說:“用於科學研究的SARS-CoV-2基因組的數量是驚人的。”她補充道,“我們在大流行的早期就意識到,我們需要新的方法來分析海量的資料——接近實時——來標記病毒中可能影響其傳播或症狀嚴重性的新突變。”
科學家們分析的資料集包括直到2020年7月底的樣本。
在最初的46723個樣本中,科學家們確定了12706例病毒突變。然而,研究人員對398例可能獨立發生多次的突變特別感興趣。
這表明,這些突變更有可能增加病毒的傳播,而不是具有中性作用,並被偶然傳遞。
科學家們最終確定了185個至少獨立發生三次的突變。
為了確定這些突變是否提高了病毒的傳播機率,科學家們建立了病毒的進化樹模型,追蹤每個突變在某個進化分支上的常見程度。
如果突變在後代中頻繁發生,就可能增加了病毒傳播的機會。
在追蹤了185個突變的進化過程,每個突變都獨立發生了三次,科學家們沒有發現任何證據表明,任何一個突變有增加病毒的傳播機會。
相反,他們發現大多數突變在病毒傳播方面是中性的。
這些突變似乎主要是由於人類免疫系統的影響而發生的。這與病毒從人類感染到水貂身上時的表現形成了鮮明對比,科學家們曾分別分析過這種情況。
正如van Dorp博士所說:“當我們分析來自水貂的病毒基因組時,我們驚奇地發現相同的突變在不同的水貂養殖場中反覆出現,儘管這些相同的突變以前很少在人類身上觀察到。”
根據倫敦大學學院生物科學部的Francois ·Balloux教授的說法,這可能意味著SARS-CoV-2在人類中的關鍵突變事件發生在病毒從一個仍未確定的非人類動物宿主傳染後不久。
“我們很可能已經錯過了病毒在人類中的早期適應期。我們之前估計SARS-CoV-2是在2019年10月或11月傳染到人類,但我們掌握的第一批基因組的日期是12月底。那個時候,對人類中的傳播能力至關重要的病毒突變可能已經出現並穩定下來,我們無法研究它們。”
科學家們指出,隨著第一批有效的SARS-CoV-2疫苗即將在全球範圍內推廣,病毒很可能會經歷一系列的變異反應。他們所開發的方法應該有助於快速識別這些突變。
Balloux教授說:“疫苗方面的訊息看起來很不錯。該病毒很可能在未來產生免疫逃逸突變,但我們有信心能夠及時標記出這些突變,這樣就可以在需要時及時更新疫苗。”