1、採用的技術不同：

機電一體化技術是將機械技術、電工電子技術、微電子技術、資訊科技、感測器技術、介面技術、訊號變換技術等多種技術進行有機地結合，並綜合應用到實際中去的綜合技術，現代化的自動生產裝置幾乎可以說都是機電一體化的裝置。

數控技術也叫計算機數控技術（CNC，ComputerizedNumericalControl），它是採用計算機實現數字程式控制的技術。這種技術用計算機按事先存貯的控制程式來執行對裝置的運動軌跡和外設的操作時序邏輯控制功能。

2、應用領域不同：

機電一體化除用於單個機器、裝置或一般的生產系統的技術改造之外，還用於柔性製造系統、計算機整合製造系統、工廠自動化、辦公自動化、家庭自動化等方面。

數控涉及多個領域：(1)機械製造技術；(2)資訊處理、加工、傳輸技術；(3)自動控制技術；(4)伺服驅動技術；(5)感測器技術；(6)軟體技術等。

3、組成不同：

一個機電一體化系統中一般由結構組成要素、動力組成要素、運動組成要素、感知組成要素、職能組成要素五大組成要素有機結合而成。

早期的數控系統是由硬體電路構成的稱為硬體數控（HardNC），1970年代以後，硬體電路元件逐步由專用的計算機代替而稱為計算機數控系統，一般是採用專用計算機並配有介面電路，可實現多臺數控裝置動作的控制。因此現在的數控一般都是CNC（計算機數控）。