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    三江源自然保護區主要保護物件為江河源頭的生態系統、高原溼地、高原特有野生動物、高原原始地貌和世界第三極自然景觀。 青海三江源地區地處青藏高原腹地,是長江、黃河、瀾滄江三大河流的發源地。歷史上,三江源區曾是水草豐美、湖泊星羅棋佈、野生動物種群繁多的高原草原草甸區,被稱為生態“處女地”。近些年來,隨著全球氣候變暖,冰川、雪山逐年萎縮,直接影響高原湖泊和溼地的水源補給,眾多的湖泊、溼地面積縮小甚至乾涸,沼澤地消失,泥炭地乾燥並裸露,沼澤低溼草甸植被向中旱生高原植被演變,生態環境已十分脆弱。隨著人口的無節制增加和人類無限度的生產經營活動,又大大加速了該地區生態環境惡化的進度。特別是草地大規模的退化與沙化,不僅使該地區草地生產力和對土地的保護功能下降,優質牧草逐漸被毒、雜草所取代,一些草地危害動物如鼠類乘虛而入,導致草地載畜量減少,野生動物棲息環境質量減退,棲息地破碎化,生物多樣性降低。更為重要的是,隨著源區植被與溼地生態系統的破壞,水源涵養能力急劇減退,導致三江中下游廣大地區旱澇災害頻繁、工農業生產受到嚴重製約,並已直接威脅到了長江、黃河流域、乃至東南亞諸國的生態安全。

    1、是亞洲和中國大部分地區的“生命之源” 青藏高原被稱為“世界屋脊”、地球的“第三極”, 青藏高原的隆起打亂了行星風系的臨界尺度,迫使大氣環流改變行徑,成為一個獨立的氣候區域,孕育了黃河、長江、瀾滄江、恆河、印度河等國內外許多著名的河流,是歐亞大陸上大江大河發育最多的區域。三江源地處青藏高原腹地,起著各江河水文迴圈的初始作用。據資料,長江總水量的25%、黃河總水量的49%、瀾滄江總水量的15%來自該青海地區。

    2、是世界上海拔最高面積最大的高原溼地區 溼地與森林、海洋並稱為全球三大生態系統。溼地生態系統具有水陸過渡性、系統脆弱性、功能多樣性和結構複雜性的基本特徵,在水源涵養、減緩徑流、蓄洪防旱、防災抗災、降解汙染、維持生物多樣性,為人類生產、生活提供多種資源、調節氣候等方面有著其它生態系統不可替代的作用,具有巨大的生態功能,在生態安全體系中獨具特色。溼地也是珍稀水禽的繁殖地、臨時棲息地和越冬地。因此,溼地被譽為“地球之腎”、“生命的搖籃”。

    3、是世界上高海拔地區生物多樣性最集中的地區 三江源區所處的地理位置和獨特的地貌特徵決定了其具有豐富的生境多樣性、物種多樣性、基因多樣性遺傳多樣性和自然景觀多樣性。 源區最低海拔約3335m,最高海拔6564m,海拔4000—5800m的高山是保護區地貌的主要骨架。由於保護區面積大,地形複雜,氣候差異明顯。三江源嚴酷的高寒環境,構成了獨特的生命繁衍區,許多生物至此已達到邊緣分佈和極限分佈,成為珍貴的種質資源和高原基因庫。更由於地處黃土高原、橫斷山脈、羌塘高原和塔里木盆地等中國幾個一級地理單元之間,“邊緣效應”非常突出,生物的演化、變異等過程在激烈進行,孕育了眾多高原獨有的生物物種。區內維管束植物有87科、471屬、2238種,約佔全國植物種數的8%,其中種子植物種數佔全國相應種數的8.5%。,分別約佔青海省維管束植物的81%、57%、31%。脊椎動物370種,約佔青海省脊椎動物種類的47%、全國的11%;其中哺乳綱84種,佔青海省哺乳綱種類的44%。鳥綱237種,佔青海省的56%;兩棲爬行類15種,佔青海省的6%。此外,已鑑定昆蟲11目87科378種。因而有豐富的物種多樣性和遺傳多樣性。 4、是中國生態系統最脆弱和最原始的地區之一 由於青藏高原隆起的時間不長,下墊面的物理屬性較差,多數土壤、植被尚處於年青的發育階段,在寒旱生境中,系統的結構和功能簡單,受到外界干擾時,其自身的調節機制不夠健全,恢復能力較弱,一旦破壞,即發生退化和逆向演替現象。無論是其中西部和北部的灘地、沼澤,還是東南部的高山峽谷,由於地質發育年代輕,地質不穩定,山高、坡陡、峽谷深,風化殼淺薄,土壤厚度薄、質地粗,生態環境極為脆弱。特別是一旦地表植被破壞,很容易造成水土流失,並極難自然恢復,而人工恢復則要付出幾倍甚至幾十倍的代價。大量的黑土灘和沙化土地即是最好的例證。

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