1)自然現象的固有不確定性 主要是指現實世界的變化是一個漸進的過程,不像GIS中的資料結構描繪那樣是能截然分開的,如不同土壤的邊界的劃分,森林的邊界等問題,應該存在一個過渡的模糊區域,實際在處理的時候卻沒有考慮過渡區域,因為目前的大部分GIS還沒有處理模糊不確定性的能力[9]。

2)度量不確定性 度量不確定性包括以下幾個方面。①測量誤差:有測量就存在不確定性,對於測量不確定性一般而言主要由於觀測者、儀器以及觀測條件等因素引起的; ②比例尺引起的不確定性:比例尺決定最小區域在地圖的顯示和識別,對於一幅圖而言比例尺越大越能顯示地物更詳細而顯示地物類別卻越少,雖然現在的數字資料庫看起來是與比例尺無關的,然而,大部分GIS資料來自於地圖,因而地圖的比例尺決定了GIS資料的最小對映單元和包含和省略地物。3)模型不確定性 模糊是對現實世界的一種抽象,由於空間物體的複雜性,一個模型要體現所有的複雜性是不可能的,只能對其主要特性進行抽象,對空間物體進行簡化處理,正是簡化處理因而產生了模型不確定性。GIS一開始就是對地理實體的抽象,如對地理概念的定義就是一種抽象處理,因而模型不確定性是與GIS分不開的。現在所能認識到的模型不確定性主要存在於GIS的操作階段,如:空間資料的內插,是選用線性模型,還是選用樣條模型等等。4)資料處理和轉換的不確定性 主要是指GIS在操作的誤差和在計算機處理的積累誤差。由於計算機是對離散資料的處理,而實際上空間資料是連續的,因而對空間資料的離散化處理必然產生誤差;計算機計算的結尾誤差也造成一定的誤差。空間資料的處理牽涉到很多內容,每一步都會帶來誤差,並且根據誤差傳播律,誤差具有積累性。