第一個就是性質不一樣。

農業銀行是國有控股大型商業銀行，是中國四大行之一；而農商行一般是由農村信用社發展而來，控股方一般是以地方政府為主。

農業銀行全國只有一家，而農商行就有很多，目前有上千家，但是這幾千家農商行當中，它們又是相互獨立的，不是同一家銀行。

農業銀行是中國最金融業最核心的機構之一，從國家到銀監會包括到央行都是高度重視，基本是已經到了不能倒下的地步，萬一哪天農業銀行經營不善面臨破產，那國家肯定會出手兜底，不會讓農業銀行倒下。

而農商行就不一樣，農商行只是一個普通的銀行，自負盈虧自己承擔風險，萬一哪天經營不善，面臨破產了，就按照法律程式走破產流程。

農業銀行不論是在營業收入，營業利潤，資產規模，員工規模，市值等方面都遠遠超過農商行。

比如在資產規模方面，2011年農業銀行的資產總規模達到了21萬億；

而據有關資料統計，截至2016年底，1055家農商行的資產規模才20萬億，就算2017年有一定的發展，但總資產規模已也不會超過25萬億，在農商行當中，資產規模最大的重慶農商也不過9000億左右。

相當於一個農業銀行的資產規模，就跟全國1000多家農商行這個規模差不多。

農業銀行業務面向全國，甚至全世界，目前業務基本上覆蓋全國所有縣級以上行政單位，有超過23000的分支機構。

而農商行的業務範圍一般主要侷限於本區域之內，就算有的農商行可以跨區域經營，但是網點也很少。

銀行業的所有資質基本上農業銀行都有，而農商行有很多資質都不具備，比如發行結構性存款，農業銀行具備發行金融衍生品的資質，所以可以隨便發行結構性存款，而很多農商行不具備發行金融衍生品的資質，所以不能發行結構性存款。

農業銀行是一個系統，在不同地區辦理業務，都是在農業銀行內部進行，比如轉賬就不算跨行。

而農商行很多都是相互獨立的，特別是各省的農商系統都是相互獨立，如果從廣東農商行轉賬到湖南農商行，那就是跨兩個系統轉賬，就算跨行轉賬。