原則不同

獲得高校自主招生認定資格的考生仍要參加高考，在錄取時可享受一定條件的優惠。根據教育部有關規定，入選考生高考總分原則上不應低於考生所在省(自治區、直轄市)有關高校同批次同科類錄取控制分數線。

二、目標不同

“學科特長和創新潛質”是關於自主招生的檔案中提到最多的詞語。這正是自主招生選拔目標學生所具備的特點，你可能認為它的直接證明就是各種競賽獎項等。

三、選拔方式不同

“首先報名然後準備申請材料透過初審，再參加筆試面試，最後才能拿到加分。”這就是自主招生選拔學生的方式。

四、名額分配不同

在高考志願填報中每所高校的招生計劃都是嚴格規定好的，即一所高校在某個省份的招生名額是提前計劃好的，任何增加或者減少名額的情況，都需要非常繁瑣而嚴格的程式。而自主招生則不同。首先，參與自主招生的90餘所高校的招生名額分配權歸每所高校所有，具體人數為該校招生計劃的5%左右。其次，這些名額不針對某個省份，而是面向全國考生的，只要符合條件都可以提出申請，透過高校考核就可以拿到高校20-60分不等的加分，甚至降至一本線錄取的優惠。

五、招生院校不同

試點高校自主招生2003年啟動，目前招生高校有90所，招生人數約佔試點高校招生總數的5%，其中，北京工 業大學、 黑龍江大學、上海大學等13所高校只面向本省考生自主招生。2014年選拔錄取了2.3萬人。這90所自主招生試點高校中，有些面向全國招生，有些只在本省(市)招生。而2016年參加本省高職自主招生的院校，大都是本省的院校。