高效液相色譜儀是在經典液相柱色譜儀的基礎上，引入了氣相色譜儀的理論，技術上採用了高壓輸液泵、高效固定相、梯度洗脫技術和高靈敏度檢測器，具有高壓、高速、高效、高靈敏度、高選擇性和應用範圍廣等特點。

高效液相色譜儀與氣相色譜儀的主要差別：

　1、分析物件差別：

　　(1)氣相色譜儀的分析物件：

　　1)能氣化、熱穩定性好和沸點較低的樣品。

　　2)高沸點、揮發性差、熱穩定性差、離子型及高聚物樣品不能檢測。

　　3)僅佔有機物的15%～20%左右。

　　(2)高效液相色譜儀的分析物件：

　　1)溶解後能製成溶液的樣品。

　　2)不受樣品揮發性和熱穩定性的限制。

　　3)分子量大、難氣化、熱穩定性差、高分子和離子型樣品均可檢測。

　　4)應用廣泛，佔有機物的80%～85%左右。

　　2、流動相差別：

　　(1)氣相色譜儀的流動相：

　　1)流動相為惰性氣體。

　　2)組分與流動相之間無親合作用力，只與固定相作用。

　　(2)高效液相色譜儀的流動相：

　　1)流動相為液體。

　　2)流動相與組分之間有親合作用力，為提高柱的選擇性和改善分離度增加了因素，對分離起很大作用。

　　3)流動相種類較多，選擇餘地大。

　　4)流動相極性和PH值的選擇對分離起到重要作用。

　　5)選用不同比例的兩種或兩種以上液體作為流動相可以增大分離選擇性。

　3、操作條件差別：

　　(1)氣相色譜儀的操作條件： 加溫操作。

　　(2)高效液相色譜儀的操作條件： 室溫，高壓(液體粘度大)。