施工合同的質量控制涉及多方面因素，任一方面的缺陷都可能使工程質量無法達到預期標準。

在資質方面，承包人有無承攬工程的相應資質，直接關係到建設工程的質量。在合同審查期間，一方面應嚴格審查施工企業資質及專案負責人資質，另一方面應檢查企業過往的類似業績，從多維度查驗承攬能力，以避免超越資質等級、借用有資質的建築施工企業的名義承攬工程等現象出現。

在管理方面，關鍵崗位人員配備和在崗履職是確保建築工程質量和安全生產的前提。施工企業應按工程專案實際施工情況，分階段配備關鍵崗位人員，確保包括專案負責人、專案技術負責人、施工員、安全員、質量員、資料員等關鍵崗位人員的配備情況及在崗情況達標，並在經監理、建設單位書面同意後撤離關鍵崗位人員。

在經濟方面，經濟風險分擔和企業資信狀況是工程施工質量的重要影響因素。在合同審查階段，應重點關注發承包雙方的風險分擔安排，確保合同充分考慮到施工期間建設工程材料價格異常波動對工程實施的影響；在合同履行階段，也應定期審查施工企業的資產負債、對外擔保等經濟狀況，經營成果、現金流量等財務狀況，以及既往工程履約情況、專案獎懲情況、涉訴情況等信用狀況，從而動態把握經營風險和財務風險。

在技術方面，工程質量也向裝置材料及施工工藝提出了要求，即符合國家、行業以及地方技術標準、規範的規定。在材料裝置供應的質量控制中，應確保供應單位具備法定條件、材料裝置各項質量試驗指標及品牌規格符合要求；承包人也需按照合同約定的時間和要求提出施工工藝、施工技術要求和方法，經發包人認可後執行。