1. 根據生物戰劑對人的危害程度，可分為致死性戰劑和失能性戰劑：

（1）致死性戰劑。

致死性戰劑的病死率在10％以上，甚至達到50

（2）失能性戰劑。病死率在10％以下，如布魯氏桿菌、Q熱立克次體、委內瑞拉馬腦炎病毒等。

2. 根據生物戰劑的形態和病理可分為：

（1）細菌類生物戰劑。主要有炭疽桿菌、鼠疫桿菌、霍亂狐菌、野兔熱桿菌、布氏桿菌等。

（2）病毒類生物戰劑。主要有黃熱病毒、委內瑞拉馬腦炎病毒、天花病毒等。

（3）立克次體類生物戰劑。主要有流行性班疹傷寒立克次體、Q熱立克次體等。

（4）衣原體類生物戰劑。主要有鳥疫衣原體。

（5）毒素類生物戰劑。主要有肉毒桿菌毒素、葡萄球菌腸毒素等。

（6）真菌類生物戰劑。主要有粗球孢子菌、莢膜組織胞漿菌等。

3. 根據生物戰劑有無傳染性可分為兩種：

（1）傳染性生物戰劑，如天花病毒、流感病毒、鼠疫桿菌和霍亂弧菌等。

（2）非傳染性生物戰劑，如土拉桿菌、肉毒桿菌毒素等。

隨著微生物學和有關科學技術的發展，新的致病微生物不斷被發現，可能成為生物戰劑的種類也在不斷增加。近些年來，人類利用微生物遺傳學和遺傳工程研究的成果，運用基因重組技術界限遺傳物質重組，定向控制和改變微生物的性狀，從而有可能產生新的致命力更強的生物戰劑。