第一類是簡易密碼，又稱替位密碼。這是一種最原始、初級的密碼，主要玩的是數字和文字的遊戲，比如將偶數當奇數用，把炮彈說成香蕉、進攻說成回家，諸如此類，玩的名堂比較簡易，有點暗語性質的。這種密碼沒有什麼學術價值，也不體現智慧，只有一點小聰明，作用也只是防君子不防小人的，所以一般都是在小範圍內使用，臨時性很強，風險也很大。早在二戰之前，這種密碼就幾乎已被淘汰，即使有些區域性戰役偶爾用一下，也是因為情況緊急，迫不得已。

　　第二類是專業密碼，又稱中級密碼，或數學密碼，主要奧妙在數學的運用上。這種密碼一般都是由專業的數學人才參與設計，玩的是數學的遊戲，不是數字的。二次大戰中大部分國家和軍隊用的都是這種密碼，因為設定的程式相當複雜，人已無法單純用頭腦記清它的轉換方式和程式，所以出現了專業的密碼機。這類密碼是用數學造出來的陷阱，所以，每部密碼幾乎都可以演變出一道或者幾道超難的數學題。

　　第三類是高階密碼，又稱語言密碼。研製這樣一部密碼，相當於創造發明一門語言，也許該說是瘋子的語言，破壞語言的語言，研製難度相當大，破譯難度也很大。二戰期間，有少許國家開始嘗試性地用，保密性很好，但之後並沒有如人們所期望的那樣普及開來，原因是研製這樣一部密碼，耗資巨大，且使用難度極大，難以普及。這是一種密碼中的密碼，即使在少數發達國家，一般只在高層聯絡中使用，很難全面鋪開。