常見解決辦法如下：PE開啟軟體出現異常故障現象：PE下執行綠色軟體(非整合在PE裡的)，大部分情況下會出錯，提示找不到某檔案(一般情況下是dll檔案)。故障解決：進到系統資料夾(通常情況下是dll檔案)，找到之後然後放在根目錄上面。(比如C:\WINDOWS\system32或C:\WINDOWS)搜尋找到這個檔案，再把這個缺少的檔案複製到與你軟體相同的目錄下 重新執行即可。在PE下安裝應用程式出現自動關閉不能開啟故障現象：安裝軟體也是一樣，提示找不到某檔案。故障分析：執行軟體時，PE會先從軟體的同一目錄下尋找所需檔案，然後是PE系統的。而因為PE只包含了系統的核心檔案，不能保證有所需檔案。故障解決：將缺少的檔案複製到與你軟體相同的目錄下重新安裝，這樣做成功率不高。因為PE系統只集成了windows執行的核心應用。那我們還是得這樣做—進到原系統讓其自動搜尋原系統的系統資料夾(比如C:\WINDOWS\system32或C:\WINDOWS)。

系統盤進入PE系統怎麼進行修復引導系統的方法，可以透過以下步驟操作來實現：

1、盤啟動盤連線上電腦，接著重啟電腦，並在開機畫面出現時按下啟動快捷鍵進入啟動項視窗，選擇【03】啟動Win8PE裝機維護版(新機器)，按回車鍵確認。

5、在“主引導記錄”頁面中，若使用的是windows xp系統就選擇NT 5.x ，使用Win7系統便選擇NT 6.x，工具會提示是否成功。