企業程式碼和商品條碼都是由相對應的數字程式碼和條空符號共同構成的用於記錄資訊的標記，目的是為了實現 計算機自動化管理和迅速的資訊交換，具有唯一性和穩定性，但二者從本質到各方面內容都有著嚴格的區別。

1.含義和作用不同

企業程式碼是為了便於加強政府的宏觀管理和經濟監督而要求企業在全國範圍內使用的數字名稱，目前，在工商、稅務、銀行、統計、福利等部門得到了廣泛應用；商品條碼是記錄商品的規格、生產者情況等資訊標記，用於現代化商品流通領域。

2.實施的特點不同

企業程式碼是國家強制推行和使用的；商品條碼則由企業自願申辦使用；隨著市場國際化的發展，商品的自動化管理水平的提高，將會得到普遍的應用。

3.使用方法不同

企業程式碼是用企業身份識別，以程式碼證書或IC卡為載體，不能脫離載體而單獨使用，因此也就不應也不必印有商品包裝上，更不允許冒充商品條碼欺騙消費者；而商品條碼是在商品交易中透過掃描器讀出商品的有關資訊，以實現迅速結算要求，因此只有印在包裝上才能得以應用。

4.標註方法不同

企業程式碼是由9位數碼和對應的條空符號構成，數碼在上、條空符在下，數碼最後一位----校驗碼為阿拉伯數字或英文字母X；而商品條碼的條空符在上、數碼在下，數碼一般（標準版）為13 位，都是阿拉伯數字，國內產品均以690、691、692開頭。

簡而言之，企業程式碼是企業的“身份證”，商品條碼是商品（產品）的“身份證”。一個企業只能有一個企業程式碼，而可以有多個商品條碼。兩者含義不同、用途不同、應區別對待、正確使用、不能混淆。