河流生態系統指河流水體的生態系統，屬流水生態系統的一種，是陸地與海洋聯絡的紐帶，在生物圈的物質迴圈中起著主要作用。河流生態系統水的持續流動性，使其中溶解氧比較充足，層次分化不明顯。主要具有以下特點：（1）具縱向成帶現象，但物種的縱向替換並不是均勻的連續變化，特殊種群可以在整個河流中再現；（2）生物大多具有適應環境的特殊形態結構。表現在浮游生物較少；底棲生物多具有體形扁平、流線性等形態或吸盤結構；適應性強的魚類和微生物豐富；（3）與其他生態系統相互制約關係複雜。一方面表現為氣候、植被以及人為干擾強度等對河流生態系統都有較大影響；另一方面表現為河流生態系統明顯影響沿海（尤其河口；海灣）生態系統的形成和演化；（4）自淨能力強，受干擾後恢復速度較快。

這裡所說的河流生態系統，主要是指河流水體的生態系統，屬流水生態系統的一種，是陸地與海洋聯絡的紐帶，在生物圈的物質迴圈中起著重要作用。河流生態系統水的持續流動性，使其中溶解氧很充足，層次分化不顯著。它主要具有以下4個特點：

1．具縱向成帶現象，不過物種的縱向替換並非是均勻的連續變化，特殊種群能夠在整個河流中再出現。

2．生物多數具有適應急流環境的特殊形態結構。表現在浮游生物較少；底棲生物多具有體形扁平。流線性等形態或吸盤結構；適應性強的魚類和微生物豐富。

3．和其他生態系統相互制約關係複雜。一方面表現為氣候、植被以及人為干擾強度等對河流生態系統都有較大影響；另一方面表現為河流生態系統明顯影響沿海（尤其河口、海灣）生態系統的形成和演化。

4．自淨能力強，受干擾後恢復速度很快。