國有企業改革中涉及到劃撥土地使用權的，應區別情況作如下處理：

1、國有企業合併、兼併，且合併、兼併後的企業是國有工業生產企業的，經批准可以保留劃撥土地使用權，但保留劃撥用地方式的期限不能超過5年。在國有企業合併、兼併中，如合併、兼併後的企業不是國有工業生產企業，但被兼併方或合併中的一方屬於瀕臨破產的企業的，其擁有的劃撥土地使用權也可以按上述方式處置。

2、非國有企業兼併國有企業的，應當採取出讓或租賃方式處置。

3、須由國家控股的關係國計民生、國民經濟命脈的關鍵領域和基礎性行業企業或大型骨幹企業，改造或改組為有限責任公司、股份有限公司以及組建企業集團的，涉及的劃撥土地使用權經省級以上人民政府土地管理部門批准，可以採用國家以土地使用權作價出資（入股）方式處置。這裡應注意的是，土地使用權作價出資（入股）形成的國家股股權，不應由原劃撥土地使用企業持有，而應按照國有資產投資主體由有批准權的人民政府土地管理部門委託有資格的國有股權持股單位統一持有。 各區、縣級市人民政府，市府直屬各單位： 　　鑑於市政府《關於加強國有企業改革轉制中原劃撥土地使用權管理的通知》（穗府〔2000〕25號）第一項第四款（“除按規定可保留劃撥用地方式外，採取其他方式處置的，企業應委託廣州市房地產估價管理所等A級土地評估機構進行土地資產評估，出具土地資產評估報告，並報市以上國土部門稽核確認”）的表述與國土資源部《關於改革土地估價結果確認和土地資產處置審批辦法的通知》（國土資發〔2001〕44號）、《關於改革土地估價人員和機構監督管理方式的通知》（國土資發〔2002〕237號）的規定不符，現將該款修改為：“除按規定可保留劃撥用地方式外，採用其他方式處置的，企業應委託有土地評估資質的機構進行資產評估，出具土地資產評估報告，並報市以上國土部門備案”。請遵照執行。

按照《企業會計準則第6號——無形資產》準則的規定，企業透過劃撥無償取得的土地使用權也應確認為“無形資產”，直接歸屬於使該項資產達到預定用途所發生的支出（如繳納配套費、土地儲備金等）應計入取得無形資產的成本；土地使用權用於自行開發建造廠房等地上建築物時，土地使用權的賬面價值不與地上建築物合併計算其成本，單獨作為“無形資產”進行核算。