1．鹵代烴類通常認為此類殺線蟲劑主要以透過烷基化作用或氧化作用使線蟲中毒。中毒線蟲表現為劇烈活動，繼而周身麻醉，最後死亡。線蟲體內與生命至關重要的蛋白質，由於均擁有羥基、氨基等可與鹵代烴發生烷基化反應而使酶失去原有的活性或使其活性受到抑制，使線蟲死亡。另一作用機制是發生在細胞色素c氧化，使線蟲的呼吸作用受阻而死亡。研究發現，二溴乙烷對線蟲蛋白質烷基化反應的速度比氧化作用慢得多，因此，在該藥劑起作用的劑量下，其氧化作用在殺滅線蟲方面的作用似乎佔主要地位。2．異硫氰酸甲酯釋放劑類此類殺線蟲劑是氨基甲醯化試劑。一般認為其殺線蟲作用主要是透過與酶分子中的親核部位（如氨基、羥基、巰基）發生氨基甲醯化反應來完成。3．有機磷和氨基甲酸酯類多種線蟲的神經系統中發現有膽鹼酯酶存在，一般認為有機磷和氨基甲酸酯殺線蟲作用的機制與它們殺蟲的機制相似。這兩類化合物對線蟲作用的機制是麻痺，而並非是殺死，且這種作用是可逆的。當把中毒麻痺的線蟲從藥液中取出放入清水中，線蟲可在一定時間內復甦。因此，認為這兩類藥劑的殺線蟲作用，主要在抑制膽鹼酯酶的活性，從而減少線蟲的活動，抑制線蟲侵入植物取食的能力，破壞了雌蟲引誘雄蟲的能力，導致線蟲的發育、繁殖滯後等。4．抗生素類此類藥物目前使用較多的主要是阿維菌素。它透過作用於線蟲的γ－氨基丁酸（GABA）神經系統，即透過消除神經細胞間質中γ－氨基丁酸對神經突觸的抑制作用而達到抑制神經傳導的能力，此過程是不可逆的，屬於徹底的致死機制，可長期使線蟲的蟲口密度處於較低的水平。