MD5的典型應用是對一段資訊（Message）產生資訊摘要（Message-Digest），以防止被篡改。比如，在UNIX下有很多軟體在下載的時候都有一個檔名相同，副檔名為.md5的檔案，在這個檔案中通常只有一行文字，大致結構如：
MD5(tanajiya.tar.gz)=0ca175b9c0f726a831d895e269332461
這就是tanajiya.tar.gz檔案的數字簽名。MD5將整個檔案當作一個大文字資訊，透過其不可逆的字串變換演算法，產生了這個唯一的MD5資訊摘要。如果在以後傳播這個檔案的過程中，無論檔案的內容發生了任何形式的改變（包括人為修改或者下載過程中線路不穩定引起的傳輸錯誤等），只要你對這個檔案重新計算MD5時就會發現資訊摘要不相同，由此可以確定你得到的只是一個不正確的檔案。如果再有一個第三方的認證機構，用MD5還可以防止檔案作者的"抵賴"，這就是所謂的數字簽名應用。
MD5還廣泛用於加密和解密技術上。比如在UNIX系統中使用者的密碼就是以MD5（或其它類似的演算法）經加密後儲存在檔案系統中。當用戶登入的時候，系統把使用者輸入的密碼計算成MD5值，然後再去和儲存在檔案系統中的MD5值進行比較，進而確定輸入的密碼是否正確。透過這樣的步驟，系統在並不知道使用者密碼的明碼的情況下就可以確定使用者登入系統的合法性。這不但可以避免使用者的密碼被具有系統管理員許可權的使用者知道，而且還在一定程度上增加了密碼被破解的難度。
正是因為這個原因，現在被駭客使用最多的一種破譯密碼的方法就是一種被稱為"跑字典"的方法。有兩種方法得到字典，一種是日常蒐集的用做密碼的字串表，另一種是用排列組合方法生成的，先用MD5程式計算出這些字典項的MD5值，然後再用目標的MD5值在這個字典中檢索。我們假設密碼的最大長度為8位位元組（8Bytes），同時密碼只能是字母和數字，共26+26+10=62個字元，排列組合出的字典的項數則是P(62,1)+P(62,2)….+P(62,8)，那也已經是一個很天文的數字了，儲存這個字典就需要TB級的磁碟陣列，而且這種方法還有一個前提，就是能獲得目標賬戶的密碼MD5值的情況下才可以。這種加密技術被廣泛的應用於UNIX系統中，這也是為什麼UNIX系統比一般作業系統更為堅固一個重要原因
MD5的典型應用是對一段資訊（Message）產生資訊摘要（Message-Digest），以防止被篡改。比如，在UNIX下有很多軟體在下載的時候都有一個檔名相同，副檔名為.md5的檔案，在這個檔案中通常只有一行文字，大致結構如：
MD5(tanajiya.tar.gz)=0ca175b9c0f726a831d895e269332461
這就是tanajiya.tar.gz檔案的數字簽名。MD5將整個檔案當作一個大文字資訊，透過其不可逆的字串變換演算法，產生了這個唯一的MD5資訊摘要。如果在以後傳播這個檔案的過程中，無論檔案的內容發生了任何形式的改變（包括人為修改或者下載過程中線路不穩定引起的傳輸錯誤等），只要你對這個檔案重新計算MD5時就會發現資訊摘要不相同，由此可以確定你得到的只是一個不正確的檔案。如果再有一個第三方的認證機構，用MD5還可以防止檔案作者的"抵賴"，這就是所謂的數字簽名應用。
MD5還廣泛用於加密和解密技術上。比如在UNIX系統中使用者的密碼就是以MD5（或其它類似的演算法）經加密後儲存在檔案系統中。當用戶登入的時候，系統把使用者輸入的密碼計算成MD5值，然後再去和儲存在檔案系統中的MD5值進行比較，進而確定輸入的密碼是否正確。透過這樣的步驟，系統在並不知道使用者密碼的明碼的情況下就可以確定使用者登入系統的合法性。這不但可以避免使用者的密碼被具有系統管理員許可權的使用者知道，而且還在一定程度上增加了密碼被破解的難度。
正是因為這個原因，現在被駭客使用最多的一種破譯密碼的方法就是一種被稱為"跑字典"的方法。有兩種方法得到字典，一種是日常蒐集的用做密碼的字串表，另一種是用排列組合方法生成的，先用MD5程式計算出這些字典項的MD5值，然後再用目標的MD5值在這個字典中檢索。我們假設密碼的最大長度為8位位元組（8Bytes），同時密碼只能是字母和數字，共26+26+10=62個字元，排列組合出的字典的項數則是P(62,1)+P(62,2)….+P(62,8)，那也已經是一個很天文的數字了，儲存這個字典就需要TB級的磁碟陣列，而且這種方法還有一個前提，就是能獲得目標賬戶的密碼MD5值的情況下才可以。這種加密技術被廣泛的應用於UNIX系統中，這也是為什麼UNIX系統比一般作業系統更為堅固一個重要原因