套取國家專案資金法律上處理如下：

一、查辦套取國家專項資金案件，應當堅持全面理解國家專項資金政策，統一正確適用法律；堅持準確劃分責任，體現區別對待，貫徹寬嚴相濟；堅持嚴格把握、慎重處理，重點懲治國家機關工作人員的嚴重失職瀆職犯罪和重大詐騙犯罪。

二、套取國家專項資金的使用人不符合國家專項資金政策的基本條件，在申報過程中以非法佔有為目的，嚴重弄虛作假，虛構並不存在的企業或專案，偽造關鍵性申報材料，符合詐騙罪構成要件的，應當對使用人以詐騙罪定罪處罰。

三、套取國家專項資金使用人的申報專案符合國家專項資金政策的基本條件，但在申報過程中誇大實際情況，偽造或提供了個別非關鍵性虛假申報材料，套取的國家專項資金部分被用於企業彌補損失，或者用於轉產、更新裝置、生產經營的，對使用人一般不宜按詐騙罪定罪處罰。

四、在套取國家專項資金過程中負有直接稽核職責的國家機關工作人員起主要作用，積極支援、參與幫助資金使用人弄虛作假，並對套取的國家專項資金進行私分，非法佔為己有的，無論資金使用人是否構成犯罪，均以貪汙罪追究相關國家機關工作人員刑事責任。國家機關工作人員本人系資金直接使用人，符合貪汙罪構成要件的按貪汙罪定罪處罰。

套取國家專項資金的使用人涉嫌詐騙等犯罪，國家機關工作人員在稽核資金使用人提供的材料時明知或應當明知條件虛構，仍予以縱容、幫助或者不認真履行職責，嚴重不負責任沒有審查出相關材料虛假而使國家專項資金被騙取的，應當分別以濫用職權罪、翫忽職守罪追究相關國家機關工作人員刑事責任。收受賄賂，構成受賄罪的數罪併罰。

相關規定：

《刑法》第三百九十五條規定，國家工作人員的財產、支出明顯超過合法收入，差額巨大的，可以責令該國家工作人員說明來源，不能說明來源的，差額部分以非法所得論，處五年以下有期徒刑或者拘役；差額特別巨大的，處五年以上十年以下有期徒刑。財產的差額部分予以追繳。