系統保留分割槽用於存放系統引導檔案。 系統保留分割槽指的是Windows系統在第一次管理硬碟的時候，保留用於存放系統引導檔案的分割槽。系統保留分割槽用於儲存引導檔案，引導檔案是系統啟動時需要首先讀取的一部分具有特殊功能的檔案。 Windows7的啟動過程是： 開機後，BIOS進行開機自檢，然後選擇從硬碟進行啟動並載入硬碟的MBR，然後把控制權交給MBR； MBR會搜尋64B大小的分割槽表，找到活動分割槽，然後載入活動分割槽的第一個扇區(Bootmgr)到記憶體;；Bootmgr尋找並讀取BCD，如果有多個啟動選項，會將這些啟動選項反映在螢幕上，由使用者選擇從哪個啟動項啟動。選擇從Windows 7啟動後，會載入C:\windows\system32\winload.exe，並開始核心的載入過程。 bootmgr和BCD都是儲存在儲存分割槽裡，因此，系統保留分割槽很重要，不能隨意刪除，以免影響系統啟動。

系統保留分割槽一般應用於修復壞道。如果你的硬碟分割槽有損壞，那麼會將損壞分割槽塞到保留分割槽，將無損的分割槽和扇道恢復過來，保證空間和分割槽充足 。再者，往往系統保留分割槽還大多數作引導，修復和其他作用。如無必要，可以刪除。另外，在Windows8及更高版本會有一個恢復分割槽，用於系統重置。一般有了恢復分割槽就不要系統保留分割槽了