沉香的顏色是多種多樣的。如以常用的36種色名錶達，它們大概可以包括近十種顏色。；　　通常，活的沉香樹，樹皮是灰色至深灰色，樹葉是草綠色至綠色，木材是淡黃色，果皮是淡綠色(初生)至黃褐色(成熟)的。；　　而成品沉香，卻從灰、深灰到黑、赭、黃褐、鐵棕(含淺棕)、棕、淡綠、茶葉(綠)等多種色澤，又因其具木紋，紋理之間色澤不同，形成線條狀相間，所以常在同一件沉香成品，有二至三種顏色並不奇怪。；　　大體而言，成薄塊狀的沉香，為灰色至深灰色，而厚塊狀的沉香，則色彩較為豐富。以海南黑奇楠為例，以黑色和棕色為主，間以黃褐色條紋。；　　海南黃奇楠，以鐵棕和黃褐色紋相間；海南綠奇楠，則絕不能以通常的眼光去尋找它的“綠”色，因為其主色是在黃褐色的主調上，映現著一些泛淺綠色的光澤，區域性還呈現黑色或棕色的條塊，可謂色彩最多。；　　此外，稱為黑奇楠的，以黑色間棕色為多，越南產的更為顯著，其它南洋各地的，以棕色、鐵棕和赭色為多。至於一些神佛雕像，卻多是沉香原木與結成沉香的混合體，從黑色、黃褐色到淡黃色都有，不一而足。嚴格地說，它只能算沉香木材製品，而非沉香製品，傳說中價值數億元的“龍床”，即為此類產物。；　　值得一提的是，沉香樹又名白木香或土沉香，是宜於珠三角栽培的優良樹種，東莞以莞香之名馳名，中山以原來盛產沉香而名香山，澳門處於中山、東莞之間，地處沿海低丘地貌，是適宜栽種沉香的好地方。

顏色方面 沉香有青、赤、黃、白、黑五種不同顏色，至於沉香內所含的油脂顏色也不同，有綠（或墨綠）、紫、赤紅、金絲黃、土黃、黑數色，顏色不一樣的沉香，在燃燒時也會有不一樣的香味。鑑定沉香的顏色一定要在太Sunny下進行，否則顏色的準確度就會受到影響。沉香的顏色不僅會影響到沉香燃燒時的香味，還會對治療身體的療效發生不一樣的效果。’但是最重要的是樹脂含量要足夠，無論是什麼顏色的沉香，都會有它們獨自的藥效。 沉香等級的好壞，沉香是否沉於水，是決定香的品級高低最重要因素，再來更重要的是顏色的因素。因此在[本草備要]中，對沉香品級有較進一步的蘭述：「如鷓鴣斑者，名黃沉，如牛角黑者，名角沉。咀之軟，削之卷者，名黃蠟沉，甚難得。浮者名棧香，半沉者名煎香，雞骨香雖沉，而心空，並不堪用。 又說：「色黑沉水者良。」從清朝的汪昂所著的[本草備要]中，我們已發現到，此時對沉香的認識，又更進一步了。因為不僅由沉香，沉不沉水的鑑別法，已進步到用眼睛，去鑑定一塊沉香的質量好壞了，但是實際上，我們所見到的鷓鴣斑的黃沉、及雞骨香，都可以簡稱為板沉，鷓鴣沉可列為二、三級的沉香，而雞骨香可能要歸到六級以下的板沉，只能點香供佛，禪定修行，這樣的沉香力道較弱，且較不堪入藥，因含油量都較低。有關沉香的顏色分類，陳讓在<<海外逸說>>。書中記載沉香的顏色有五種:第一級為綠色，第二級為深綠色，第三級為金絲色(微黃)，第四級為黃土色，第五級為黑色。 印象中許多人以為沉香油脂的顏色是黑色，其實沉香中油脂含量越高的沉香中，油脂是黑色的反而更加少見。事實上沉香有紫色及深紅的赤色，有關紫色沉香的等級，在中藥大辭典及日本的分類方法，紫色與綠色相同是在沉香等級中屬於最高階的顏色。